Page 42 - 《广西植物》2022年第11期

ϟ ऐ ሕ ࿗ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗԰ 卷
表 ᇺই 大粒香 ዞᡓᦵટዛ 密码子使用
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ሕজ ऊᆍʛᆍႿ ࣼ༁ᑕ੫ᔀ ᔽႿ ዹᡱ᧕શዶ ᆍ஦ ᧕ᑕ᤟ᔽ଴ᔽᑕႿ੫

名称 密码子 次数 密码子偏好性 名称 密码子 次数 密码子偏好性
શᑕቝᔀ ऊᆍʛᆍႿ શࣼቝᤦᔀʢ ኏୩ऊВ શᑕቝᔀ ऊᆍʛᆍႿ શࣼቝᤦᔀʢ ኏୩ऊВ
异亮氨酸 ዶВВ Ꭾሕԡ ϟ঎ጢϟ 缬氨酸 ᥈ВВ ࿗ԡԡ ϟ঎ጢᤃ
᧧༁ᆍ᤟ᔀࣼዹᔽႿᔀ ჆ᑕ᤟ᔽႿᔀ
ዶВऊ ԰ऐᤃ ԡ঎ጢँ ᥈Вऊ ϟϟጢ ԡ঎࿗ጢ
ዶВዶ ࿗ሕጢ ԡ঎ँԡ ᥈Вዶ ሕᎮᤃ ϟ঎࿗ᤃ
苏氨酸 ዶऊВ ࿗ԡ԰ ϟ঎Ꭾϟ ᥈В᥈ ϟሕᤃ ԡ঎ጢሕ
ఋၤʢᔀᆍႿᔽႿᔀ
ዶऊऊ ϟᎮँ ԡ঎Ꭾᤃ 丙氨酸 ᥈ऊВ ࿗ऐँ ϟ঎Ꭾ࿗
ዶ᤟ᑕႿᔽႿᔀ
ዶऊዶ ԰࿗ँ ϟ঎ԡᤃ ᥈ऊऊ ϟᤃ԰ ԡ঎ጢऐ
ዶऊ᥈ ϟԡऐ ԡ঎࿗ᤃ ᥈ऊዶ ሕሕϟ ϟ঎ϟऐ
赖氨酸 ዶዶዶ ᤃሕऐ ϟ঎࿗Ꭾ ᥈ऊ᥈ ϟ࿗԰ ԡ঎ጢϟ
ᓂᢃ༁ᔽႿᔀ
ዶዶ᥈ ԰ሕϟ ԡ঎ጢሕ 天冬氨酸 ᥈ዶВ ጢԡऐ ϟ঎ጢᤃ
ዶ༁ᡱᑕʢᡷᔽዹ ᑕዹᔽʛ
天冬酰胺 ዶዶВ ጢϟጢ ϟ঎࿗ጢ 天冬氨酸 ᥈ዶऊ ϟ࿗ሕ ԡ঎࿗࿗
ዶ༁ᡱᑕʢᑕ੫ᔽႿᔀ ዶ༁ᡱᑕʢᡷᔽዹ ᑕዹᔽʛ
ዶዶऊ ϟँሕ ԡ঎ጢጢ 谷氨酸 ᥈ዶዶ ᤃँᎮ ϟ঎࿗Ꭾ
丝氨酸 ВऊВ ሕሕϟ ϟ঎ጢᤃ ᥈ዶ᥈ ԰࿗ँ ԡ঎ጢሕ
୩ᔀʢᔽႿᔀ
Вऊऊ ԰ጢ࿗ ϟ঎԰ԡ 甘氨酸 ᥈᥈В ࿗ϟጢ ϟ঎԰ᤃ
᥈᤟ᢃዹᔽႿᔀ
Вऊዶ ԰԰ሕ ϟ঎ԡጢ ᥈᥈ऊ ϟሕऐ ԡ঎࿗԰
Вऊ᥈ ϟϟԡ ԡ঎ጢ԰ ᥈᥈ዶ ጢϟ࿗ ϟ঎ጢᤃ
ዶ᥈В ԰ᤃᤃ ϟ঎԰ጢ ᥈᥈᥈ ԰࿗ँ ԡ঎Ꭾᤃ
ዶ᥈ऊ ऐऐ ԡ঎࿗԰ 组氨酸 ऊዶВ ԰ँँ ϟ঎ጢԡ
̀ᔽ༁ᡷᔽʛᔽႿᔀ
精氨酸 ऊ᥈В ԰࿗ሕ ϟ঎ሕᤃ ऊዶऊ ϟԡϟ ԡ঎ጢԡ
ዶʢ੫ᔽႿᔽႿᔀ
ऊ᥈ऊ ϟԡԡ ԡ঎ጢᤃ 谷氨酰胺 ऊዶዶ ࿗Ꭾᤃ ϟ঎ጢϟ
᥈᤟ࣼᡷᑕቝᔽႿᔀ
ऊ᥈ዶ ԰ሕϟ ϟ঎԰ँ ऊዶ᥈ ϟጢሕ ԡ঎࿗ँ
ऊ᥈᥈ ऐጢ ԡ঎࿗ऐ 半胱氨酸 В᥈В ϟጢԡ ϟ঎ጢ԰
ऊᢃ༁ᡷᔀᔽႿᔀ
ዶ᥈ዶ ሕԡ࿗ ϟ঎Ꭾԡ В᥈ऊ ࿗ऐ ԡ঎࿗ऐ
ዶ᥈᥈ ϟԡऐ ԡ঎ᤃϟ 苯丙氨酸 ВВВ ᤃ࿗ᤃ ϟ঎԰ँ
۪ၤᔀႿᢃ᤟ᑕ᤟ᑕႿᔽႿᔀ
甲硫氨酸 ዶВ᥈ ࿗԰ሕ ϟ঎ԡԡ ВВऊ ሕጢጢ ԡ঎Ꭾϟ
ᥘᔀᡷၤᔽᆍႿᔽႿᔀ
ВВዶ ᤃጢᎮ ԰঎ԡሕ 色氨酸 В᥈᥈ ሕ԰ँ ϟ঎ԡԡ
ఋʢᢃᡱᡷᆍᡱၤᑕႿ
ВВ᥈ ሕጢԡ ϟ঎ԡऐ 酪氨酸 ВዶВ ጢϟԡ ϟ঎ጢᤃ
ఋᢃʢᆍ༁ᔽႿᔀ
亮氨酸 ऊВВ ࿗԰ሕ ϟ঎ሕϟ Вዶऊ ϟ࿗԰ ԡ঎࿗࿗
ᓂᔀࣼዹᔽႿᔀ
ऊВऊ ϟሕሕ ԡ঎࿗ϟ 脯氨酸 ऊऊВ ሕԡϟ ϟ঎ጢँ
۪ʢᆍ᤟ᔽႿᔀ
ऊВዶ ԰Ꭾ԰ ԡ঎ऐ࿗ ऊऊऊ ϟᤃᎮ ԡ঎ऐऐ
ऊВ᥈ ϟԡँ ԡ঎ሕ࿗ ऊऊዶ ԰ԡ԰ ϟ঎ԡᎮ
ऊऊ᥈ ऐऐ ԡ঎࿗ᤃ

ԣॹᇺ 大粒香 ዞᡓᦵટዛ 长重复序列和 ୒୒ቴ 分析 内ྉ表 ࿗ɯᤥ

在大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 中检测到 ϟँ 个长重复序列ᖔ 在大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 的 ϟ԰ँ 个 ୩୩኏ 位点中有 ँጢ
包含了 ऐ 个正向重复ᖔ长度范围为 ሕԡ ጲ ጢ԰ ᤦᡱᖔ以及 个单核苷酸重复ᖔ并且 Ꭾԡ঎ԡᎮᠮ的 ୩୩኏ 由 ዶ 或 ఋ 组
ϟϟ 个回文重复ᖔ其长度范围为 ሕԡ ጲ ϟ԰Ꭾ ᤦᡱᤥ 最长 成ᖔ表明 ୩୩኏ 位点有使用 ዶᣰ ఋ 碱基的偏好ᤥ 同时ᖔ
的 ϟ԰Ꭾ ᤦᡱ 的重复序列位于 ʗᡓ໧ϟँ᥋ᡓ໧ᤇ᣽ 的基因间隔 研究表明 ୩୩኏ 位点在大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 上分布不均ᖔ

区内ᖔ而含有最多长重复序列的区间为 ʗᐹዞᓂ᥋ᐹዞዞ᧕ᤥ 在 ᓂ୩ऊ 区ܦ୩୩ऊ 区以及 ᧧኏ 区分别分布了 ँጢ 个ܦϟऐ
༁
区域位置分布显示ᖔ绝大多数分布在基因间隔区 个和 ϟᤃ 个 ୩୩኏ 位点ྉ表 ጢɯᤥ