Page 39 - 《广西植物》2022年第11期

ϟϟ 期 吴朝昕等᧥ 大粒香水稻叶绿体基因组特征分析 ϟ ऐ ሕ ϟ
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জজ 叶绿体是植物获取能量的重要细胞器ᖔ具有独 为材料进行测序ᖔ构建大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 图谱ᖔ分析密
立于核基因组的遗传体系ᤥ 因为其基因序列保守ᖔ 码子的使用和重复序列ᖔ并分析其亲缘关系ᖔ拟解
基因结构重排事件远低于核基因组ᖔ结构简单ᖔ一 决大粒香叶绿体基因组以下问题᧥ྉ ϟɯ 大粒香
般为母系遗传ᖔ所以被用来揭示物种的进化与亲缘 ዹᡱ᧕શዶ 的基本特征大小ଫྉ԰ɯ大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 密码子
关系ྉ李绪英等ᖔ԰ԡϟϟଫᓂᔽ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟऐଫ ԻၤᑕႿ੫ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ 偏好情况ଫྉሕɯ大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 系统发育所属分支ᤥ
԰ԡϟऐଫ ȮᔀᆍႿ ᪲ ᣽ᔽቝᖔ ԰ԡϟँଫ朱斌等ᖔ԰ԡ԰ϟɯᤥ 由于发达
的测 序科技使不少生物实现了叶绿体基因组 ϟজ 材料与方法
ྉዹᡱ᧕શዶɯ测序ᖔ因此 શऊା᧧ 中收录的叶绿体基因逐
渐增多ᖔ利用叶绿体基因研究亲缘关系的报道也不 ϓॹϓ 材料
断增多ᤥ 在水稻中ᖔèᑕႿ 等ྉ԰ԡ԰ԡɯ利用 ዹᡱ᧕શዶ 分析 以大粒香为材料ᖔ԰ԡϟँ 年冬季种植于海南三
了 ሕሕ 个稻属物种的亲缘关系ᖔ结果显示 ᧣ʗᡥऊᐹ ໧ᐹᡙᔠצᐹ 亚师部农场基地ᖔ԰ԡ԰ԡ 年 ԰ 月选取无病虫害ܦ长势
׹ᆍࣼዹၤᔀʢ̀୩ዶ᥈୩᧕ɟ᧕ϟऐԡ԰ 与 ᧣ॹ ໧ᐹᡙᔠצᐹ ዹࣼ᤟ᡷᔽ׹ᑕʢ ఋશϟܦ 良好的水稻叶片ᖔ冲洗ܦ擦干液氮速冻暂存ᖔ用干
᧣ॹ ໧ᐹᡙᔠצᐹ ዹࣼ᤟ᡷᔽ׹ᑕʢ ኏۪ ାᔽᆍ᥋԰԰ᤃ 和 ᧣ॹ ໧ᐹᡙᔠצᐹ ዹࣼ᤟ᡷᔽ׹ᑕʢ ᧧኏ऐ 冰保存寄回贵州ᖔ置于ͱऐԡ ቩ 保存ᖔ用于提取大粒
的亲缘关系最近ᤥèᑕႿ੫ 等ྉ԰ԡϟᎮɯ 通过分析 ዹᡱ᧕શዶ 香 ᧕શዶᤥ
探讨了根茎野生稻与其他 ϟሕ 个稻属物种的亲缘关 ϓॹԣ 方法
系ᖔ结果显示与根茎野生稻关系较近的是药用野生 ϟ঎԰঎ϟ 大粒香 ᧕શዶ 提取及测序জ 使用 ఋ᧧ዶશ᥈ጶશ 植
稻且属于 ऊऊ 基因类型ᤥ 在其他物种中ᖔ 张慧等 物 ᧕શዶ 试剂盒提取大粒香总 ᧕શዶᖔ测序公司检测
ྉ԰ԡϟऐɯ利用 ዹᡱ᧕શዶ 分析了益母草及其他 ϟᤃ 个物种 合格后ᖔ构建文库ᖔ进行测序ᤥ
的亲缘关系ᖔ研究结果很好地解决了野芝麻亚科的 ϟ঎԰঎԰ ዹᡱ᧕શዶ 序列组装与注释জ 将原始数据ᖔ除去
进化关系ᤥ 郑祎等ྉ԰ԡ԰ԡɯ 用大花君子兰叶绿体基 有污染ܦ低质量的片段ᖔ使用 ୩۪ዶʛᔀ༁ 软件拼接后
因序列与 ϟԡ 个百合科ܦጢ 个兰科ܦ࿗ 个鸢尾科及 ጢ 个 组装ᤥ 使用 ऊ۪᥈ዶ჆ዶ୩԰ 进行基因注释ᖔ 利用
石蒜科共 ԰࿗ 个物种的叶绿体基因组序列进行系统 ᨃ᥈᧕኏ዶۼ 绘制大粒香的 ዹᡱ᧕શዶ 图谱ᤥ
发育分析ᖔ研究结果支持大花君子兰属于石蒜科ᖔ ϟ঎԰঎ሕ 密码子使用分析জ 使用 ऊᆍʛᆍႿۼ 进行密码子
并使用其中 ԰ሕ 个物种叶绿体基因组中 ᡥዞஏ԰ 进行亲 使用分析ᤥ
缘关系分析发现ᖔ叶绿体基因组中 ᡥዞஏ԰ 可以代替叶 ϟ঎԰঎࿗ 重复序列分析জ 使用 ჆ቝᑕᡷዹၤ 完成大粒香
绿体基因组全长进行亲缘关系分析ᤥ ዹᡱ᧕શዶ 的长重复序列的查找ᤥ 大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 的
大粒香是贵州省水稻研究所选育ᖔ具有稻米 ୩୩኏ 筛选则使用 ᥘ᧧୩ዶ 软件ᖔ该软件的检测参数᧥
粒大且香的特点ᖔ并且大粒香在乡村振兴过程中 单核苷酸大于 ऐ 时被检测ଫ二核苷酸和三核苷酸
为社会带来了较高的经济效益ྉ 蒋志谦ᖔ԰ԡԡऐଫ罗 大于 ࿗ 时被检测ᤥ
仁发等ᖔ԰ԡϟ԰ɯᤥ 目前ᖔ对大粒香基因组学ܦ品质形 ϟ঎԰঎ጢ 系统进化分析জ 为探究大粒香与其他稻属
成等理论研究的文献报道不多ᤥ 基于大粒香在贵 物种的亲缘关系ᖔ从 શऊା᧧ 中下载了 ϟ԰ 个稻属物
州优质稻发展过程中的重要性ᖔ为进一步从基因 种和 ԰ 种禾本科近源物种的 ዹᡱ᧕શዶ ྉ 绿竹和高

组水平认识和改良大粒香ᖔ本研究以大粒香 ᧕શዶ 粱ɯᖔ使用 ኏ᑕ଴ᥘᓂ 软件构建系统发育树ᤥ