Page 22 - 《广西植物》2022年第12期
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２ ０ １ ２ 广 西 植 物 ４２ 卷
表 ３ 木芙蓉 ｃｐＤＮＡ 的基因信息 为 ６３ 和 １１０ꎬ差异较大ꎮ 木芙蓉 ３ 个品种和台湾
Ｔａｂｌｅ ３ Ｌｉｓｔ ｏｆ ｇｅｎｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ｃｐＤＮＡｓ Ｈｉｂｉｓｃｕｓ ｍｕｔａｂｉｌｉｓ 芙蓉的基因组中存在 ６ 种完全微卫星序列ꎬ而朱
基因类型 基因分组 基因名称 数量 槿和木槿中不存在六核苷酸重复ꎮ 木芙蓉 ３ 个品
Ｇｅｎｅｃａｔｅｇｏｒｙ Ｇｒｏｕｐ ｏｆ ｇｅｎｅ Ｎａｍｅ ｏｆ ｇｅｎｅ Ｎｕｍｂｅｒ
种与台湾芙蓉的共同区别仅仅在于前者均只有 １
表达相关基因 核糖体大亚基基因 ｒｐｌ２ａ ꎬ２３ａꎬ３２ꎬ２２ꎬ１６ ꎬ １１
Ｓｅｌｆ￣ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ Ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍｅ
１４ꎬ３６ꎬ２０ꎬ３３ 个五核苷酸重复ꎬ而后者存在 ２ 个五核苷酸重复ꎮ
ｇｅｎｅ ｇｅｎｅ
核糖体小亚基基因 ｒｐｓ７ａꎬ １５ꎬ １９ꎬ ３ꎬ ８ꎬ １１ꎬ １４ 木芙蓉 ３ 个品种中ꎬ‘ 牡丹粉’ 明显区别于另外 ２
Ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍｅ １２ａ ꎬ１８ꎬ４ꎬ１４ꎬ２ꎬ１６
ｇｅｎｅ 种ꎬ‘牡丹粉’的单核苷酸重复比另外 ２ 种多 １ 个ꎬ
ＲＮＡ 聚合酶亚基基因 ｒｐｏＡꎬｒｐｏＢꎬｒｐｏＣ１ ꎬｒｐｏＣ２ ４ 而六核苷酸重复比另外 ２ 种少 １ 个ꎮ
ＤＮＡ￣ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ＲＮＡ
ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｇｅｎｅ
重复序列有 ４ 种类型ꎬ即正向(ｆｏｒｗａｒｄ)、反向
核糖体 ＲＮＡ 基因 ｒｒｎ１６ａꎬｒｒｎ２３ａꎬｒｒｎ４.５ａꎬ ８
Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ＲＮＡ ｇｅｎｅ ｒｒｎ５ａ (ｒｅｖｅｒｓｅ)、互补( ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ)、回文( ｐａｌｉｎｄｒｏｍｉｃ)ꎮ
转运 ＲＮＡ 基因 ｔｒｎＩ￣ＣＡＵａꎬｔｒｎＬ￣ＣＡＡａꎬ ３７ 如图 ４ 所示ꎬ木芙蓉 ３ 个品种中均检测到 ４ 种类
Ｔｒａｎｓｆｅｒ ＲＮＡ ｇｅｎｅ ｔｒｎＶ￣ＧＡＣａꎬｔｒｎＡ￣ＵＧＣａ ꎬ
ｔｒｎＲ￣ＡＣＧａꎬｔｒｎＩ￣ＧＡＵａ ꎬ 型的重复ꎬ而台湾芙蓉无互补重复ꎻ木芙蓉 ３ 个品
ｔｒｎＮ￣ＧＵＵａꎬｔｒｎＬ￣ＵＡＧꎬ
ｔｒｎＰ￣ＵＧＧꎬｔｒｎＷ￣ＣＣＡꎬ 种均为 ２２ 个正向重复和 ３ 个反向重复ꎬ而台湾芙
ｔｒｎＭ￣ＣＡＵꎬｔｒｎＶ￣ＵＡＣ ꎬ
蓉的正向重复和反向重复分别为 ２６ 和 １ꎮ 木芙蓉
ｔｒｎＦ￣ＧＡＡꎬｔｒｎＬ￣ＵＡＡ ꎬ
ｔｒｎＴ￣ＵＧＵꎬｔｒｎＳ￣ＧＧＡꎬ ３ 个品种间的 ４ 种重复的比例十分类似ꎬ但同时互
ｔｒｎｆＭ￣ＣＡＵꎬｔｒｎＧ￣ＧＣＣꎬ
ｔｒｎＳ￣ＵＧＡꎬｔｒｎＴ￣ＧＧＵꎬ
ｔｒｎＥ￣ＵＵＣꎬｔｒｎＹ￣ＧＵＡꎬ 相之间则存在着差异ꎮ 虽然三者的正向重复均为
ｔｒｎＤ￣ＧＵＣꎬｔｒｎＣ￣ＧＣＡꎬ
２２ 个ꎬ但其构成略有差别ꎬ‘ 牡丹粉’ 重复单元长
ｔｒｎＲ￣ＵＣＵꎬｔｒｎＧ￣ＵＣＣ ꎬ
ｔｒｎＳ￣ＧＣＵꎬｔｒｎＱ￣ＵＵＧꎬ
ｔｒｎＫ￣ＵＵＵ ꎬｔｒｎＨ￣ＧＵＧ 度为 ３０ ~ ３９ 和 ４０ ~ ４９ 的正向重复数量分别为 １６
光合作用 光合系统Ⅰ基因 ｐｓａＣꎬＪꎬＩꎬＡꎬＢ ５ 和 ６ꎬ而其他 ２ 种都分别是 １７ 和 ５ꎻ‘ 单瓣白’ 和
Ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ｉ ｇｅｎｅ
‘金秋颂’ 的回文重复均为 １２ 个ꎬ而‘ 牡丹粉’ 为
光合系统Ⅱ基因 ｐｓｂＨꎬＮꎬＴꎬＢꎬＥꎬＦꎬＬꎬＪꎬ １５
Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ ＩＩ ｇｅｎｅ ＺꎬＣꎬＤꎬＭꎬＩꎬＫꎬＡ
１１ 个ꎻ‘ 单瓣白’ 和‘ 牡丹粉’ 的互补重复 均 为 ２
ＮＡＤＨ 氧化还原酶 亚 基 ｎｄｈＢａ ꎬ Ｈꎬ Ａ ꎬ Ｉꎬ Ｇꎬ Ｅꎬ １２
基因 个ꎬ而‘金秋颂’为 １ 个ꎮ
ＤꎬＦꎬＣꎬＫꎬＪ
Ｓｕｂｕｎｉｔｓ ｏｆ ＮＡＤＨ￣
２.４ 核苷酸多态性分析
ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ ｇｅｎｅ
细胞 色 素 复 合 物 亚 基 ｐｅｔＤ ꎬＢ ꎬＧꎬＬꎬＡꎬＮ ６ 利用 ｍＶＩＳＴＡ 在线程序ꎬ比对了木芙蓉 ３ 个品
基因
Ｓｕｂｕｎｉｔｓ ｏｆ ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ / 种即台湾芙蓉、朱槿、木槿的 ｃｐＤＮＡꎮ 其中ꎬ‘ 单瓣
ｆ ｃｏｍｐｌｅｘ ｇｅｎｅ
ＡＴＰ 合酶亚基基因 ａｔｐＢꎬＥꎬＩꎬＨꎬＦ ꎬＡ ６ 白’作为参考序列ꎬ朱槿和木槿则作为对照ꎮ 从图
Ｓｕｂｕｎｉｔｓ ｏｆ ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ ｇｅｎｅ
５ 可以明显观察到朱槿、木槿均与参考序列差异较
核酮糖二磷酸羧化酶大 ｒｂｃＬ １
亚基基因 大ꎬ而‘牡丹粉’‘金秋颂’台湾芙蓉则与参考序列差
ＲｕｂｉｓＣＯ ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｇｅｎｅ
翻译起始因子 ｉｎｆＡ １ 异较小ꎮ ５ 个 ｃｐＤＮＡ 中高度分化的区域主要位于
Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ
基因间隔区ꎬ但一些蛋白编码区如 ｙｃｆ１ 基因变异度
其他基因 ＡＴＰ 依赖性蛋白酶亚基 ｃｌｐＰ １
Ｏｔｈｅｒ ｇｅｎｅ ｐ 基因 较大ꎬ而最保守的 ４ 个 ｒＲＮＡ 基因ꎬ在木芙蓉 ３ 个品
ＡＴＰ￣ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ｐｒｏｔｅａｓｅ
ｓｕｂｕｎｉｔ ｐ ｇｅｎｅ
种和台湾芙蓉中完全一致ꎮ
成熟酶基因 ｍａｔＫ １
为了更加精确地反映木芙蓉 ３ 个品种之间以
Ｍａｔｕｒａｓｅ ｇｅｎｅ
包裹酶蛋白基因 ｃｅｍＡ １ 及与台湾芙蓉间的核苷酸多态性ꎬ我们分别计算
Ｅｎｖｅｌｏｐｅ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｐｒｏｔｅｉｎ
ｇｅｎｅ
了‘金秋颂’ ‘ 牡丹粉’ 台湾芙蓉的 ＣＤＳ 和基因间
乙酰辅酶 Ａ 羧化酶亚基 ａｃｃＤ １
基因 隔区相对于参考序列单瓣白的核苷酸多样性值
Ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ａｃｅｔｙｌ￣ＣｏＡ￣
ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ ｇｅｎｅ
( ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｖａｌｕｅｓꎬ Ｐ )ꎮ 如图 ６ 所示ꎬＣＤＳ
ｉ
Ｃ 型细胞色素合成基因 ｃｃｓＡ １
Ｃ￣ｔｙｐｅ ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ 序列较为保守ꎬ其 Ｐ 普遍较小ꎮ 就 ＣＤＳ 序列来
ｉ
ｇｅｎｅ ｇｅｎｅ
看ꎬ‘金秋颂’仅在 ｙｃｆ１ 基因处出现多态性ꎬ‘ 牡丹
假设的叶绿体阅读框 ｙｃｆ２ａꎬｙｃｆ１ꎬｙｃｆ４ꎬｙｃｆ３ ５
Ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ 粉’ 仅 在 ｎｄｈＢ 基 因 处 出 现ꎬ 台 湾 芙 蓉 在 ａｃｃＤ、
ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅｓ(ｙｃｆ)
ａｔｐＡ、ｃｌｐＰ、ｎｄｈＢ、ｎｄｈＤ、ｍａｔＫ、ｙｃｆ１ 均出现ꎬ但 Ｐ 最
总和 Ｔｏｔａｌ １３０ ｉ
大不超过 ０.００１ ７ꎮ 而在基因间隔区中ꎬ台湾芙蓉
注: １ 个内含子ꎻ ２ 个内含子ꎻ ａ. 重复基因ꎮ
Ｎｏｔｅ: Ｏｎｅ ｉｎｔｒｏｎꎻ Ｔｗｏ ｉｎｔｒｏｎｓꎻ ａ. Ｄｕｐｌｉｃａｔｅｄ ｇｅｎｅ. 有 １４ 个基因间隔区有差异ꎬ其中 ｔｒｎＲ￣ＵＣＵ~ ａｔｐＡ、
