Page 25 - 《广西植物》2022年第12期
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12 期 李镇兵等: 木芙蓉三个品种及近缘种的叶绿体基因组比较分析 2 0 1 5
A. 4 种重复序列类型的数量ꎻ B. 不同长度的重复序列数量ꎮ
A. Number of four repeat typesꎻ B. Number of repeat sequences by length.
图 4 台湾芙蓉和木芙蓉 3 个品种 cpDNA 的重复序列分析
Fig. 4 Analysis of repeated sequences of cpDNAs in Hibiscus taiwanensis and three cultivars of H. mutabilis
和自展值 (Bootstrap values)ꎮ 如图 8 所示ꎬ木芙蓉
3 个品种和台湾芙蓉同属于木槿属ꎬ并聚在同一枝
亲缘关系最近ꎬ自展值和后验概率均为最大值ꎮ
3 讨论与结论
3.1 木芙蓉及近缘种的 cpDNA 比较
cpDNA 比较分析表明ꎬ木芙蓉的种下 3 品种
及其近缘种台湾芙蓉在 cpDNA 上高度保守ꎬ反向
重复区 (IR) 均为 26 300 bpꎬ木芙蓉与该属的木
槿和朱槿比较ꎬ后两者在 IR 区发生了收缩分别为
25 745、25 598 bpꎮ 3 个木芙蓉品种 cpDNA 上的
大 / 小单拷贝区在长度上存在差异且‘ 单瓣白’ 和
‘金秋 颂’ 差 异 更 小ꎬ 在 大 / 小 单 拷 贝 区 ( LSC /
SSC) 长度上ꎬ‘单瓣白’ ‘ 金秋颂’ ‘ 牡丹粉’ 分别
为 89 355 bp / 18 925 bp、 89 353 bp / 18 926 bp、
89 400 / 18 920 bpꎮ GC 含量是判断物种间亲缘关
系的重要指标 (Li et al.ꎬ 2018)ꎬ木芙蓉 3 个品种
与台湾芙蓉的总 GC 含量、IR 区和 SC 区的 GC 含
量均完全一致ꎬ木槿和朱槿的 GC 含量则有明显差
异ꎮ 此外ꎬ木芙蓉 3 个品种与台湾芙蓉的 IR 区边
界分布的 ycf1、trnH、ndhF、rpl2、rps19 基因均未发
Y 轴表示介于 50% ~ 100%之间平均的相似性百分比ꎮ
生扩张或收缩ꎬ而同属的木槿和朱槿相对木芙蓉
Y axis indicates the percent identity ranging from 50% to 100%.
和台湾芙蓉发生了明显的波动ꎮ 不同物种之间的
图 5 6 个 cpDNAs 的序列相似度图(以单瓣白为参考)
IR 边界是不同的ꎬ其中 IR 边界的波动是造成这种
Fig. 5 Sequence identity plot of the six cpDNAs
(using Hibiscus mutabilis cv. Danbanbai as a reference) 差异的主要原因 ( Ravi et al.ꎬ 2008) ꎮ 因此ꎬ GC