Page 24 - 《广西植物》2022年第12期
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２ ０ １ ４ 广 西 植 物 ４２ 卷
图 ２ 台湾芙蓉、木槿、朱槿与木芙蓉 ３ 个品种 ｃｐＤＮＡ 的反向重复区 (ＩＲ)、
大单拷贝区 (ＬＳＣ)、小单拷贝区 (ＳＳＣ) 边界对比
Ｆｉｇ. ２ Ｃｏｍｐａｒａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｊｕｎｃｔｉｏｎｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ＬＳＣꎬ ＳＳＣ ａｎｄ ＩＲ ｒｅｇｉｏｎｓ ｏｆ ｃｐＤＮＡｓ ａｍｏｎｇ
Ｈｉｂｉｓｃｕｓ ｔａｉｗａｎｅｎｓｉｓꎬ Ｈ. ｓｙｒｉａｃｕｓꎬ Ｈ. ｒｏｓａ￣ｓｉｎｅｎｓｉｓ ａｎｄ ｔｈｒｅｅ ｃｕｌｔｉｖａｒｓ ｏｆ Ｈ. ｍｕｔａｂｉｌｉｓ
台湾芙蓉以及其他 １３ 个相关物种ꎬ测定了每个物
种 ｃｐＤＮＡ 的密码子的数量以及 ＲＳＣＵꎮ 计算结果
表明ꎬ基因组中亮氨酸含量最高ꎬ异亮氨酸和甘氨
酸其次ꎬ编码半胱氨酸的密码子数量最少ꎬ次少为
色氨酸和丝氨酸ꎮ 如图 ７ 所示ꎬ除色氨酸和甲硫
氨酸外ꎬ所有氨基酸都使用 ２ 个或多个同义密码
子ꎬ精氨酸和亮氨酸均由 ６ 个同义密码子表达ꎮ
ＲＳＣＵ 值较大的密码子大部分为 Ａ 或 Ｕ 结尾ꎬ即基
因上的碱基 Ａ / Ｔꎬ这与前人的研究结论一致ꎬ即植
图 ３ 台湾芙蓉、朱槿、木槿与木芙蓉 ３ 个品种
物中 Ａ / Ｔ 结 尾 的 密 码 子 使 用 偏 好 ( Ｘｉｅ ｅｔ ａｌ.ꎬ
ｃｐＤＮＡ 的微卫星分析(ＳＳＲ)
Ｆｉｇ. ３ ＳＳＲ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｐＤＮＡｓ ｉｎ Ｈｉｂｉｓｃｕｓ ２０１８)ꎮ 如图 ７ 所示ꎬ锦葵科植物的密码子偏好表
ｔａｉｗａｎｅｎｓｉｓꎬ Ｈ. ｒｏｓａ￣ｓｉｎｅｎｓｉｓꎬ Ｈ. ｓｙｒｉａｃｕｓ 现出较高的保守性ꎬ但不同属之间存在着一定的
ａｎｄ ｔｈｒｅｅ ｃｕｌｔｉｖａｒｓ ｏｆ Ｈ. ｍｕｔａｂｉｌｉｓ 差异ꎮ 木芙蓉 ３ 个品种和台湾芙蓉紧紧地聚在一
起ꎬ其余物种大致是按照属和族进行聚类ꎮ
变异区域且这 ２ 个热点都在 ＬＳＣ 区ꎮ 显然ꎬＩＲ 区 ２.６ 系统发育关系
的变异低于 ＬＳＣ 区和 ＳＳＣ 区ꎮ ‘金秋颂’无基因间 我们选取 １６ 个锦葵科植物的 ｃｐＤＮＡ 来探讨
隔区差异ꎮ 这些变异度较高的区域ꎬ可用于设计 木芙蓉与其近缘种间的亲缘关系ꎬ并以木棉科植
特定的 ＤＮＡ 条形码ꎮ 物美丽异木棉 (Ｃｅｉｂａ ｓｐｅｃｉｏｓａ) 作为外类群ꎮ 使用
２.５ 选择压力分析和密码子偏好性分析 １７ 个 ｃｐＤＮＡ 中共有的 ７６ 个 ＣＤＳｓ 进行最大似然
相对同义密码子使用度 (ＲＳＣＵ) 用于评估编 分析 (ＭＬ) 和贝叶斯分析 ( ＢＩ)ꎮ 结果显示ꎬＭＬ
码序列中同义密码子的使用情况ꎬ其中 ＲＳＣＵ 越大 和 ＢＩ 分析的拓扑结构完全相同ꎬ并且绝大部分的进
表示偏好性越强ꎮ 我们选取了木芙蓉 ３ 个品种、 化支都具有很高的后验概率 (ｐｏｓｔｅｒｉｏｒ ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｉｅｓ)
