Page 31 - 《广西植物》2022年第12期
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                          Guihaia  Dec. 2022ꎬ 42(12): 2021-2031

            DOI: 10.11931/ guihaia.gxzw202107004
            马宇辰ꎬ 赵玉梅ꎬ 黄丹霖ꎬ 等. 白菜 CesA 基因家族鉴定及表达模式分析 [J]. 广西植物ꎬ 2022ꎬ 42(12): 2021-2031.
            MA YCꎬ ZHAO YMꎬ HUANG DLꎬ et al. Identification and expression analysis of CesA gene family in Brassica rapa var. glabra
            [J]. Guihaiaꎬ 2022ꎬ 42(12): 2021-2031.



                         白菜 CesA 基因家族鉴定及表达模式分析



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                        马宇辰 ꎬ 赵玉梅 ꎬ 黄丹霖 ꎬ 张梦晴 ꎬ 吴晓宇 ꎬ 王  洁 ꎬ
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                                          陈  雨 ꎬ 黄家保 ꎬ 段巧红                 1ꎬ2∗
                                                              1ꎬ2
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                   ( 1. 山东农业大学 园艺科学与工程学院ꎬ 山东 泰安 271000ꎻ 2. 作物生物学国家重点实验室ꎬ 山东 泰安 271000 )
                 摘  要: 为探究 CesA 基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制ꎬ该文通过生物信息学的方
                 法ꎬ以白菜的全基因组序列为研究区域ꎬ进行理化特征、基因结构、进化特征、保守基序及结构域、顺式作用元
                 件和组织表达等鉴定分析ꎮ 结果表明:(1)共鉴定出 16 个编码纤维素合成酶亚基的 CesA 基因ꎬ该家族成员所
                 编码蛋白的理论等电点为 4.76~9.12ꎬ相对分子量为 17.76~122.67 kDꎬ长度为 153~1 089 aaꎮ (2)15 个基因不

                 均匀地分布于白菜的 7 条染色体上ꎬBra036008 定位于 scaffold 上ꎮ (3)大部分成员包含 4~14 个外显子ꎬ1~11
                 个保守基序ꎮ (4)该家族具有保守的 DDD-QXXRW 保守功能域ꎮ (5)该家族编码蛋白主要分布在质膜上ꎬ二
                 级结构以无规则卷曲与 α-螺旋为主ꎬ多数成员都含有 CesA 蛋白典型的 N 端、C 端和跨膜区ꎮ (6)CesA 基因在
                 茎中表达量相对较高ꎬ其中 Bra011865、Bra023952 和 Bra029874 在茎、叶、花中显著表达ꎮ 该研究结果为后续
                 深入研究 CesA 基因功能以及白菜生长发育研究奠定了基础ꎮ
                 关键词: 纤维素合成酶ꎬ 白菜ꎬ CesAꎬ 基因家族ꎬ 基因表达
                 中图分类号: Q943.2    文献标识码: A    文章编号: 1000 ̄3142(2022)12 ̄2021 ̄11



                       Identification and expression analysis of CesA

                            gene family in Brassica rapa var. glabra


                           1                1ꎬ2                  1                      1              1ꎬ2
              MA Yuchen ꎬ ZHAO Yumei ꎬ HUANG Danlin ꎬ ZHANG Mengqing ꎬ WU Xiaoyu ꎬ
                                    1ꎬ2            1                   1ꎬ2                  1ꎬ2∗
                         WANG Jie ꎬ CHEN Yu ꎬ HUANG Jiabao ꎬ DUAN Qiaohong
                      ( 1. College of Horticultural Science and Engineeringꎬ Shandong Agricultural Universityꎬ Tai’an 271000ꎬ Shandongꎬ
                                Chinaꎻ 2. State Key Laboratory of Crop Biologyꎬ Tai’an 271000ꎬ Shandongꎬ China )

                 Abstract: In order to explore the role of CesA gene family in cellulose synthesis and development of Brassica rapa
                 var. glabraꎬ we identified the members of CesA genes in B. rapa var. glabra genome via bioinformatic method and the
                 physiochemical propertiesꎬ gene structuresꎬ evolutionary characteristicsꎬ conserved inotifs and domainsꎬ cis ̄acting


              收稿日期: 2021-12-28
              基金 项 目: 山 东 省 自 然 科 学 基 金 重 点 项 目 ( ZR2020KC017 ) [ Supported by Natural Science Foundation Shandong Province
              (ZR2020KC017)]ꎮ
              第一作者: 马宇辰(2000-)ꎬ研究方向为园艺科学与工程ꎬ(E ̄mail)2586922861@ qq.comꎮ
            ∗
              通信作者: 段巧红ꎬ博士ꎬ教授ꎬ研究方向为远源杂交中生殖隔离的形成机理ꎬ(E ̄mail)duanqh@ sdau.edu.cnꎮ
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