Page 28 - 《广西植物》2022年第12期

２ ０ １ ８ 广 西 植 物 ４２ 卷
定的分子条码ꎮ 我们筛选出了木槿属下种级、木 度快ꎬ是植物中非常有用的分子标记ꎬ能够揭示低
芙蓉种下 ３ 个品种级 ｃｐＤＮＡ 的候选特异性分子标 分类水平上的系统发育关系 ( Ａｍａｒꎬ ２０２０)ꎮ 因
记和 ＤＮＡ 条形码ꎬ利用所筛选的这些特异性的标 此ꎬ木芙蓉品种之间以及与近缘种之间可以通过
记ꎬ可将种级水平物种区分开ꎻ再将其用于观赏花 一些基因间隔区和个别特殊基因 ( 如 ｙｃｆ１、ｎｄｈＢ)
卉价值极高的木芙蓉种下品种间ꎬ亦可将‘ 单瓣 进行快速、且准确地鉴定ꎮ
白’‘金秋颂’‘牡丹粉’这 ３ 个区分开ꎮ
微卫星和重复序列广泛存在于 ｃｐＤＮＡ 中ꎬ可
参考文献:
用于种群遗传学研究和分子标记的开发 ( Ｂｕｌｌ ｅｔ
ａｌ.ꎬ １９９９ꎻ Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５)ꎮ 木芙蓉的微卫星结
ＡＢＤＵＬＬＡＨꎬ ＭＥＨＭＯＯＤ ＴＷꎬ ＦＵＲＲＵＫＨ Ｍꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ
构与木槿和朱槿有明显的区别ꎬ但与台湾芙蓉区 ２０２１. Ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎｓ ａｍｏｎｇ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｒｅｐｅａｔｓꎬ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ
别不太明显ꎬ且在木芙蓉品种内部ꎬ通过微卫星结 ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎｓꎬ ａｎｄ ｉｎｓｅｒｔｉｏｎ￣ｄｅｌｅｔｉｏｎ ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ

构无法区分‘单瓣白’ 和‘ 金秋颂’ꎮ 相比较而言ꎬ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｐｌａｎｔ ｆａｍｉｌｙ Ｍａｌｖａｃｅａｅ [Ｊ]. Ｊ Ｓｙｓｔ Ｅｖｏｌꎬ ５９(２):
重复序列结构分析则能明显地区别台湾芙蓉和 ３８８－４０２.
ＡＭＡＲ ＭＨꎬ ２０２０. ｙｃｆ１￣ｎｄｈＦ ｇｅｎｅｓꎬ ｔｈｅ ｍｏｓｔ ｐｒｏｍｉｓｉｎｇ ｐｌａｓｔｉｄ
‘木芙蓉’ꎬ并能对木芙蓉 ３ 个品种进行明显区分ꎮ
ｇｅｎｏｍｉｃ ｂａｒｃｏｄｅꎬ ｓｈｅｄｓ ｌｉｇｈｔ ｏｎ ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ａｔ ｌｏｗ ｔａｘｏｎｏｍｉｃ
所以ꎬ重复序列分析能够更加有效地鉴定木芙蓉
ｌｅｖｅｌｓ ｉｎ Ｐｒｕｎｕｓ ｐｅｒｓｉｃａ [ Ｊ]. Ｊ Ｇｅｎｅｔ Ｅｎｇ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌꎬ
品种ꎮ 叶绿体 ＤＮＡ 条形码是指具有足够变异的 １８(１): ５３１－５４７.
短 ＤＮＡ 序列ꎬ通常被认为有助于快速、准确地鉴 ＡＭＡＲ ＭＨꎬ ＭＡＧＤＹ Ｍꎬ ＷＡＮＧ Ｌꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９. Ｐｅａｃｈ
定物种 (程芳婷等ꎬ２０１５)ꎮ 通过核苷酸多态性分 ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ａｒｃｈｉｔｅｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｏｍｉｃ
析我们筛选出了台湾芙蓉与木芙蓉之间的叶绿体 ｓｉｇｎａｔｕｒｅｓ ｏｆ ｃｐＤＮＡ ｉｎｔｒｏｇｒｅｓｓｉｏｎ ｉｎ Ｐｒｕｎｕｓ[Ｊ]. Ｃａｎ Ｊ Ｐｌａｎｔ
Ｓｃｉꎬ ９(６): ８８５－８９６.
ＤＮＡ 条 形 码ꎬ 包 括 ｔｒｎＲ￣ＵＣＵ ~ ａｔｐＡ、 ｐｓｂＺ ~ ｔｒｎＧ￣
ＡＭＩＲＹＯＵＳＥＦＩ Ａꎬ ＨＹＶÖＮＥＮ Ｊꎬ ＰＯＣＺＡＩ Ｐꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ
ＧＣＣ、ｉｎｆＡ~ ｒｐｓ８ 和 ｎｄｈＥ ~ ｎｄｈＧꎮ 也筛选出了木芙
２０１８. ＩＲｓｃｏｐｅ: ａｎ ｏｎｌｉｎｅ ｐｒｏｇｒａｍ ｔｏ ｖｉｓｕａｌｉｚｅ ｔｈｅ ｊｕｎｃｔｉｏｎ
蓉 ３ 个 品 种 之 间 的 ＤＮＡ 条 形 码ꎬ 分 别 为 ｐｓｂＺ ~
ｓｉｔｅｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ ３４(１７):
ｔｒｎＧ￣ＧＣＣ、ｙｃｆ４ ~ ｃｅｍＡ、ｎｄｈＢ 和 ｙｃｆ１ꎮ 可 以 看 出 大 ３０３０－３０３１.
部分热点区域为基因间隔区ꎬ这是因为基因间隔 ＢＥＨＵＲＡ ＳＫꎬ ＳＥＶＥＲＳＯＮ ＤＷꎬ ２０１２. Ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ:
区处于较弱的选择压力下ꎬ并且具有比基因更高 Ｃａｕｓａｔｉｖｅ ｆａｃｔｏｒｓꎬ ｑｕａｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅ
的进化速度ꎬ它们更适合于低分类阶元的系统发 ｐａｔｔｅｒｎｓ: Ｗｉｔｈ ｅｍｐｈａｓｉｓ ｏｎ ｉｎｓｅｃｔ ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｂｉｏｌ Ｒｅｖꎬ
８８(１): ４９－６１.
育和进化研究(陈士林等ꎬ２００９)ꎮ 台湾芙蓉与‘ 单
ＢＥＩＥＲ Ｓꎬ ＴＨＩＥＬ Ｔꎬ ＭＵＮＣＨ Ｔꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. ＭＩＳＡ￣ｗｅｂ: ａ
瓣白’差异最大ꎬ有 ７ 个基因和 １４ 个基因间隔区
ｗｅｂ ｓｅｒｖｅｒ ｆｏｒ ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ [Ｊ]. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ
出现不同程度的差异ꎮ ‘ 牡丹粉’ 与‘ 单瓣白’ 之 ３３(１６): ２５８３－２５８５.
间的差异仅有 １ 个 ｎｄｈＢ 基因和 ３ 个基因间隔区ꎮ ＢＵＬＬ ＬＮꎬ ＰＡＢＯＮ￣ＰＥＮＡ ＣＲꎬ ＦＲＥＩＭＥＲ ＮＢꎬ １９９９.
ｎｄｈＢ 基因属于 ＮＡＤＨ 脱氢酶基因ꎬ其缺失突变会 Ｃｏｍｐｏｕｎｄ ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ ｒｅｐｅａｔｓ: ｐｒａｃｔｉｃａｌ ａｎｄ ｔｈｅｏｒｅｔｉｃａｌ
导致光合作用中碳同化能力严重下降ꎬ植物可以 ｆｅａｔｕｒｅｓ [Ｊ]. Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓꎬ ９(９): ８３０－８３８.
通过对该类基因进行 ＲＮＡ 编辑来保证光调节作 ＣＡＩ Ｌꎬ ＺＥＮＧ ＸＭꎬ ＷＡＮＧ Ｘꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ
ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ ｏｆ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ｉｎ ｆｌｏｗｅｒｓ ｏｆ Ｈｉｂｉｓｃｕｓ
用 (刘佳等ꎬ２０１９)ꎮ 有研究证明ꎬ大豆的 ｎｄｈＢ 基
ｍｕｔａｂｉｌｉｓ Ｌ. ａｍｏｎｇ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｃｕｌｔｉｖａｒｓ [Ｊ]. Ｓｃｉ Ｔｅｃｈｎｏｌ Ｆｏｏｄ
因在水稻中超表达ꎬ提高了水稻的光合效率ꎬ进而
Ｉｎｄꎬ ４２ (２０): ２７９ － ２８５. [ 蔡 露ꎬ 曾 心 美ꎬ 王 希ꎬ 等ꎬ
影响了水稻的农艺性状 ( 王晓曼ꎬ２０１６)ꎮ 因此ꎬ ２０２１. 不同品种木芙蓉花氨基酸组成分析及评价 [Ｊ]. 食
我们推断‘牡丹粉’花径很大ꎬ花量更多ꎬ植株也更 品工业科技ꎬ ４２(２０): ２７９－２８５.]
高大ꎬ或许与 ｎｄｈＢ 基因的改变有关ꎮ ‘ 金秋颂’ 与 ＣＨＥＮ ＪＨꎬ ＨＡＯ ＺＤꎬ ＸＵ ＨＢꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５. Ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ｔｈｅ ｒｅｌｉｃｔ ｗｏｏｄｙ ｐｌａｎｔ
‘单瓣白’差异最小ꎬ仅有 １ 个蛋白编码基因 ｙｃｆ１
Ｍｅｔａｓｅｑｕｏｉａ ｇｌｙｐｔｏｓｔｒｏｂｏｉｄｅｓ Ｈｕ ｅｔ Ｃｈｅｎｇ [Ｊ]. Ｆｒｏｎｔ Ｐｌａｎｔ
基因发生替换ꎮ ｙｃｆ１ 基因是具有未知功能的开放
Ｓｃｉꎬ ６: ４４７.
阅读框ꎬ但是烟草基因敲除实验证明 ｙｃｆ１ 基因编
ＣＨＥＮ ＳＬꎬ ＳＯＮＧ ＪＹꎬ ＹＡＯ Ｈꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００９. Ｓｔｒａｔｅｇｙ ａｎｄ ｋｅｙ
码对细胞存活至 关 重 要 的 产 物 ( Ｄｒｅｓｃｈｅｒ ｅｔ ａｌ.ꎬ ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ ｏｆ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ ｈｅｒｂａｌ ｍｅｄｉｃｉｎｅ ｕｓｉｎｇ
２０００)ꎮ 与其他叶绿体基因相比ꎬｙｃｆ１ 基因进化速 ＤＮＡ ｂａｒｃｏｄｉｎｇ [Ｊ]. Ｃｈｉｎ Ｊ Ｎａｔ Ｍｅｄꎬ ７(５): ３２２－３２７. [陈