Page 134 - 《广西植物》2022年第8期
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牟少华ᖔ 李娟ᖔ 李雪平ᖔ 等 四个竹秆变异毛竹变型的全基因组序列分析 ЏȮ 广西植物ᖔ ԡᖔ ࿗ྉऐɯ᧥ ϟሕऐሕͱϟሕँሕ
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四个竹秆变异毛竹变型的全基因组序列分析
牟少华 ᕷ 李জ 娟ᕷ 李雪平ᕷ 高জ 健
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ྉ 国际竹藤中心 竹藤科学与技术重点实验室ᖔ 北京 ϟԡԡϟԡ ɯ
摘জ 要ᧅ 毛竹是我国重要的经济竹种ᖔ在长期栽培适应过程中产生了丰富的变异ᤥ 为揭示毛竹竹秆变异变
型的全基因组突变类型ᖔ以黄皮毛竹ܦ金丝毛竹ܦ绿皮花毛竹和花毛竹 ࿗ 个毛竹变型为实验材料ᖔ采用高通
量重测序技术获得全基因组序列ᖔ进行单核苷多态性ྉ୩શ۪ɯܦ小片段插入缺失ྉ᧧Ⴟ᧕ᔀɯ和结构变异ྉ୩ɯ检测
和注释ᖔ并将变异基因进行功能注释ᤥ 结果表明᧥花毛竹基因组检测得到的基因变异数最多ᖔ为 ϟ ጢጢጢ 个ଫ
金丝毛竹样品变异位点数最少ᖔ为 ϟϟ ँሕ 个ଫ࿗ 个样品都有 Ꭾ ԡԡԡ 多个变异基因得到功能注释ᤥ᥈ᨃ 注释分
类包括细胞组件ܦ分子功能和生物过程三个基因功能分类体系的 ጢᤃ 个功能组ᤥ 在细胞组件方面ᖔ叶绿素合
成相关基因有 ࿗ሕϟ 个ଫ在生物过程方面ᖔ参与类胡萝卜素合成过程的基因有 Ꭾጢ 个ᖔ参与花青素合成过程中
的调控以及紫外光下组织中花青素积累的相关基因有 ऐԡ 个ᤥऊᨃ᥈ 分类表明参与复制ܦ重组和修复的基因
数为 ሕᤃँ 个ᖔ信号转导机制的基因数为 ँϟ 个ᖔ转录的相关基因为 个ᤥ 通过 ጶ᥈᥈ 数据库系统地分析
变异基因参与的黄酮类ܦ类胡萝卜素等物质代谢合成途径ᤥ 深入研究这些差异基因的调控途径ᖔ从 ᧕શዶ 水
平上解释竹秆的变异机制ᖔ可为深入研究毛竹种内丰富的多态性和遗传变异提供数据支持ᖔ阐析不同变异
类型的基因家族ܦ功能基因等遗传基础ᤥ
关键词ᧅ 毛竹ᖔ 变型ᖔ 全基因组重测序ᖔ 基因注释
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗ྉԡɯԡऐ᥋ϟሕऐሕ᥋ϟϟ
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收稿日期ᧅ ԡϟͱԡϟͱϟ࿗
基金项目ᧅ 国家林草局ᥥँ࿗ऐɼ项目ྉԡϟጢ᥋࿗᥋ϟሕɯଫ国际竹藤中心基本科研业务费项目ྉϟᤃሕԡϟᤃԡԡሕɯ Џ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ۪ʢᆍᢼᔀዹᡷ ጸँ࿗ऐᆥ ᆍ
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第一作者ᧅ 牟少华ྉϟँᎮᤃͱɯᖔ博士ᖔ副研究员ᖔ主要从事竹类植物种质资源与遗传多样性研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯቝࣼ༁ၤ݀ ᔽዹᤦʢᑕዹዹႿᤥ
通信作者
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