Page 139 - 《广西植物》2022年第8期
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表 ᎒ই 四个样品 Ⴌ 数量统计
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染色体内易位 染色体间易位
编号 总数 插入 缺失 反转 ᧧ႿᡷᔀʢႿᑕ ఋʢᑕႿ༁ᆍዹᑕᡷᔽᆍႿ 其他
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表 ࣽই 四个毛竹变型 Ⴌ 注释结果统计表
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外显子区 ጶᆍႿ 内含子区 ᧧ႿᡷʢᆍႿ 基因间区 ᧧Ⴟᡷᔀʢ੫ᔀႿᔽዹ
编号
᧧᧕ 缺失 插入 反转 缺失 插入 反转 缺失 插入 反转
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表 ࣮ই 四个毛竹变型的变异基因统计表 能反映不同样品与毛竹基因组之间的差异ᖔ并且
ఋᑕᤦᔀ ँজ ୩ࣼቝቝᑕʢᢃ ᆍ ቝࣼᡷᑕႿᡷ ੫ᔀႿᔀ༁ ᔽႿ 编码区的 ᧧Ⴟ᧕ᔀ 会引起移码突变ᖔ影响基因功能ᤥ
ᆍࣼʢ ᑕʢᔽᑕႿᡷ༁ ᆍ ᥘᆍ༁ᆍ ᤦᑕቝᤦᆍᆍ ୩ 中缺失ܦ插入ܦ反转ܦ易位 ࿗ 种类型的数量ᖔ反映
出基因组水平上大片段的缺失ܦ插入ܦ倒置ܦ易位
非同义突变
୩શ۪ 基因 插入缺失 等序列差异ᤥ 通过生物信息学分析ᖔ比较不同秆
编号 ᥈ᔀႿᔀ औᔽᡷၤ 基因 ୩ 基因 总数
᥈ᔀႿᔀ ᥈ᔀႿᔀ
᧧᧕ ႿᆍႿ᥋ ఋᆍᡷᑕ 色的变异类型在全基因组水平上的结构差异ᖔ并
औᔽᡷၤ औᔽᡷၤ ୩
༁ᢃႿᆍႿᢃቝᆍࣼ༁
᧧Ⴟ᧕ᔀ 进行差异注释ᖔ从而为毛竹选育提供遗传基础ᖔ也
୩શ۪
为重要基因的功能研究提供有利依据ᤥ
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颜色变异是植物中较常见的表型变异ᖔ其中
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关于水稻ܦ拟南芥ܦ菊花等多种植物均有叶色变异
ԡሕ ጢ ሕϟሕ ሕ ऐँँ ऐᎮԡ ϟ ԡऐ
的报道ᤥ 据不完全统计ᖔ水稻叶绿体含量基因超
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过 ϟ࿗ԡ 个ྉ赵绍路等ᖔԡϟऐɯᤥ 竹子中的色素分为 ሕ
大类᧥叶绿素ܦ花青素和类胡萝卜素ᤥ 通过功能数
জজ 对 ࿗ 个毛竹变异类型全基因组重测序ᖔ初步 据库比对ᖔ对 ࿗ 个毛竹变型的变异基因ᖔ进行基因
统计分析了其基因组数据ᖔ与毛竹参考基因组进 功能注释和分析ᤥ᥈ᨃ 数据库注释聚类反映了毛
行比对ᖔ检测其 ୩શ۪ܦ᧧Ⴟ᧕ᔀ 和 ୩ᤥ ୩શ۪ 类型的变 竹变型在不同功能组分类中基因数目和基因产物
异分为转换和颠换两种ᖔ࿗ 个毛竹样品的转换 ᣰ 颠 的属性ᖔ其中与秆色变异有关的叶绿素ܦ类胡萝卜
换ྉఋᔽᣰ ఋɯ的比值均约等于 ሕᖔ说明转换类型比颠 素和花青素等色素合成相关基因作为重点关注对
换类型更容易发生ᤥ୩શ۪ 杂合比例约为 ँԡᠮᖔ说 象进行分析ᤥऊᨃ᥈ 数据库注释了基因产物的直系
明样品有很高的杂合度ᖔ即同源染色体上 ୩શ۪ 位 同源分类ᖔ不同分类对应的基因数目差别很大ᖔ反
点含不同类型的碱基比例高ᤥ᧧Ⴟ᧕ᔀ 位点数同样 映了不同条件下的生理或者代谢偏好等ᤥጶ᥈᥈
