Page 138 - 《广西植物》2022年第8期

ऐ 期 牟少华等᧥ 四个竹秆变异毛竹变型的全基因组序列分析 ϟ ሕ ऐ Ꭾ
表 ጇই 四个样品 ᧇႥᦵᓣᤀ 统计表
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ጢজ ୩ࣼቝቝᑕʢᢃ ᆍ஦ ᧧Ⴟ᧕ᔀ᤟༁ ʛᔀᡷᔀዹᡷᔀʛ ᔽႿ ஦ᆍࣼʢ ༁ᑕቝᡱ᤟ᔀ༁

编码区 ऊ᧕୩ 基因组 ᥈ᔀႿᆍቝᔀ
编号 ᧧᧕
插入 缺失 杂合 纯合 总数 插入 缺失 杂合 纯合 总数
᧧Ⴟ༁ᔀʢᡷᔽᆍႿ ᧕ᔀ᤟ᔀᡷᔽᆍႿ ̀ᔀᡷ ̀ᆍቝᆍ ఋᆍᡷᑕ᤟ ᧧Ⴟ༁ᔀʢᡷᔽᆍႿ ᧕ᔀ᤟ᔀᡷᔽᆍႿ ̀ᔀᡷ ̀ᆍቝᆍ ఋᆍᡷᑕ᤟
኏ԡϟ ԰ ँँϟ ϟ Ꭾ԰Ꭾ ԰ ጢ࿗ᤃ ԰ ϟᎮ԰ ࿗ Ꭾϟऐ ϟሕँ ጢሕऐ ϟ࿗ሕ ԰԰ँ ँ࿗ ࿗ሕँ ϟऐऐ ሕ԰ऐ ԰ऐ԰ ᎮᤃᎮ
኏ԡ԰ ሕ ԡԡᎮ ϟ Ꭾ԰ँ ԰ ጢᤃऐ ԰ ϟᤃऐ ࿗ Ꭾሕᤃ ϟሕँ ԡ԰ሕ ϟ࿗԰ ԰԰ϟ ँ࿗ ऐϟԡ ϟऐᤃ ࿗ሕ࿗ ԰ऐϟ ԰࿗࿗
኏ԡሕ ԰ ँँᤃ ϟ Ꭾϟጢ ԰ ጢᎮ԰ ԰ ϟሕँ ࿗ Ꭾϟϟ ϟሕ࿗ ᤃ࿗ϟ ϟሕᎮ ԡԡᎮ ँᤃ ϟϟᎮ ϟᎮጢ ጢሕϟ ԰Ꭾϟ ᤃ࿗ऐ
኏ԡ࿗ ሕ ԡᎮϟ ϟ ऐԡᤃ ԰ ጢጢሕ ԰ ሕ԰࿗ ࿗ ऐᎮᎮ ϟ࿗࿗ ᤃऐᎮ ϟ࿗Ꭾ ጢᤃᤃ ँ԰ ँᎮᤃ ϟँँ ԰ᎮᎮ ԰ँ԰ ԰ጢሕ

表 ᣤই 毛竹变型间的 ᧇႥᦵᓣᤀ 统计表 变异基因 ऊᨃ᥈ 注释分类图ྉ图 ࿗ɯ 直观显示出
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ᤃজ ୩ࣼቝቝᑕʢᢃ ᆍ஦ ᧧Ⴟ᧕ᔀ᤟༁ ʛᔀᡷᔀዹᡷᔀʛ ᤦᔀᡷऔᔀᔀႿ ऊᨃ᥈ 功能分类条目上分别对应的频率ᖔ其中涉及
׹ᑕʢᔽᑕႿᡷ༁ ᆍ஦ ᥘᆍ༁ᆍ ᤦᑕቝᤦᆍᆍ
到功能注释ܦ转录ܦ复制重组修复和信号转导机制
的对应数值高ᤥ 获得的功能注释基因为 ϟ ᤃሕԡ 个ᖔ
编号 ᧧ ᧕ ኏ ԡ ϟ ኏ ԡ ԰ ኏ ԡ ሕ ኏ ԡ ࿗
参与复制ܦ重组和修复的基因数为 ሕᤃँ 个ᖔ信号转
኏ԡϟ ԡ
导机制的基因数为 ԰ँϟ 个ᖔ 转 录 的 相关基因为
኏ԡ԰ ऐᤃ ጢ԰ሕ ԡ
԰԰԰ 个ᤥ
኏ԡሕ ऐᎮ Ꭾԡԡ ऐऐ ऐϟሕ ԡ
᣽ጶ᥈᥈ 数据库系统地分析 ࿗ 个毛竹变型的基
኏ԡ࿗ ऐԡ ࿗ጢԡ ऐሕ ԰ԡ࿗ ऐᤃ ᤃᤃԡ ԡ
因产物 在 生 物 学过程中的功能ᤥ 以黄皮毛竹
ྉ኏ԡϟɯ的缬氨酸ܦ亮氨酸和异亮氨酸生物合成通
因变异ᖔ其中ᖔ非同义突变 ୩શ۪ 基因为 ጢ ጢᤃሕ 个ᖔ
路为例ྉ图 ጢɯᖔ注释到 ጢᎮ 个基因参与该通路ᖔ其中
᧧Ⴟ᧕ᔀ᤟ 基因为 ࿗ ԡԡᤃ 个ᖔ୩჆ 突变的基因为 ԰ ँऐᤃ 个ᖔ
԰ሕ 个变异基因ᤥ 整个通路涉及不同的酶连接一系
差异基因总数和 ୩჆ 突变基因数最多ᤥ 在 ሕ 类变
列生化反应形成ᖔ其中ᖔ框内的数字代表 ᔀႿझᢃቝᔀ 的
异基因中ᖔ非同义突变 ୩શ۪ 基因数最多ᖔ᧧Ⴟ᧕ᔀ᤟ 基
号码ᖔ红色的框代表通路相关变异基因ᤥ
因数量次之ᖔ୩჆ 突变的基因最少ᤥ
԰঎ጢ঎԰ 变异基因的功能注释জ 黄皮毛竹ܦ金丝毛
竹ܦ绿皮花毛竹和花毛竹注释到数据库中的变异 ሕজ 讨论
基因数分别为 Ꭾ ጢᎮጢܦᎮ ጢሕऐܦᎮ ࿗Ꭾᤃ 和 Ꭾ Ꭾ԰ऐᤥ 变异
全基因组重测序可以在已知植物的基因组序
基因 ᥈ᨃ 分类统计结果图ྉ图 ሕɯ 中ᖔ显示出在 ሕ 大
基因功能分类体系ྉ分子功能ܦ细胞组件和生物过 列基础上ᖔ对其不同品种的基因组序列进行测序ᖔ
程ɯ的 ጢᤃ 个分类内容中所对应的基因数和基因占 从而找出个体与该物种间的差异性 ྉ ᓂᔀᢃ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ
比ᤥ 其中ᖔ在细胞组件分类中ᖔ与叶绿素合成相关 ԰ԡԡऐɯᤥ 随着毛竹全基因组序列的公开发表ྉ۪ᔀႿ੫
的基因有 ԰ ࿗ሕϟ 个ଫ在生物过程分类中ᖔ参与类胡 ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟሕɯᖔ研究毛竹不同变种或变型基因组序
萝卜素合成过程的基因有 Ꭾጢ 个ଫ在分子功能分类 列差异成为可能ᤥ 全基因组重测序可以检测个体
中ᖔ与花青素合成调控以及紫外光下组织中花青 的全部基因组序列ᖔ扫描出一些与该个体生长性
素积累的相关基因有 ऐԡ 个ᤥ࿗ 个毛竹变型在相应 状密切相关的变异位点ྉ 宋志芳等ᖔ԰ԡϟᎮɯᤥ 毛竹
的基因功能中的变异基因数目有差异ᖔ例如᧥花毛 的地下茎中单轴散生ᖔ其不同变异类型也都是散
竹有 ԰ϟ 个与类胡萝卜素合成相关的基因ଫ绿皮花 生竹ᤥ 在毛竹自身的遗传基因漂移ᖔ以及长期的
毛竹有 ϟᎮ 个相关基因ଫ而黄皮毛竹有 ϟऐ 个相关基 栽培措施和自然环境变迁等因素的影响下ᖔ毛竹
因ᖔ基因数量和种类的差异ᖔ可能引起相应的功能 种内产生了很多遗传变异ᖔ产生各种独特的结构
变化ᤥ 深入研究叶绿素ܦ类胡萝卜素和花青素合 形态ᖔ表现出丰富的园林观赏性状ᤥ 其中ᖔ黄皮毛
成相关基因以及这些差异基因的调控途径ᖔ有利 竹ܦ花毛竹ܦ绿皮花毛竹在竹秆颜色方面表现出不

于从 ᧕શዶ 水平上解释秆色的变异ᤥ 同程度的变异ᖔ使其具有更高的园林观赏价值ᤥ