Page 84 - 《广西植物》2023年第10期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｏｃｔ. ２０２３ꎬ ４３(１０): １８３８－１８４８
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２２０９００７
邓颢珂ꎬ 罗凌ꎬ 王若秋ꎬ 等ꎬ ２０２３. 海三棱藨草及其近缘种基因组大小的测定 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４３(１０): １８３８－１８４８.
ＤＥＮＧ ＨＫꎬ ＬＵＯ Ｌꎬ ＷＡＮＧ ＲＱꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｇｅｎｏｍｅ ｓｉｚｅ ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ Ｓｃｉｒｐｕｓ ｍａｒｉｑｕｅｔｅｒ ａｎｄ ｉｔｓ ｒｅｌａｔｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ [Ｊ].
Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４３(１０): １８３８－１８４８.
海三棱藨草及其近缘种基因组大小的测定
邓颢珂 ꎬ 罗 凌 ꎬ 王若秋 ꎬ 高少羽 ꎬ 张文驹 １ꎬ２∗
１ꎬ２
１ꎬ２
１ꎬ２
１ꎬ２
( １. 复旦大学生物多样性与生态工程教育部重点实验室ꎬ 上海 ２００４３８ꎻ ２. 复旦大学
上海长江河口湿地生态系统国家野外科学观测研究站ꎬ 上海 ２００４３８ )
摘 要: 基因组大小是物种基因组的重要特征ꎬ通常用 ＤＮＡ Ｃ 值来衡量ꎬ能够用于快速判断基因组倍性ꎬ并
为分类学与进化生物学提供重要依据ꎮ 海三棱藨草(Ｓｃｉｒｐｕｓ ｍａｒｉｑｕｅｔｅｒ)是长江口和杭州湾具有重要生态意
义的标志性物种ꎬ被认为是扁秆藨草(Ｓ. ｐｌａｎｉｃｕｌｍｉｓ)和藨草(Ｓ. ｔｒｉｑｕｅｔｅｒ) 的杂交种ꎬ因染色体小而难以准确
确定倍性ꎮ 近年来ꎬ部分研究者指出该物种的分类和命名存在疑点ꎮ 该研究通过基因组 Ｓｕｒｖｅｙ 分析检测海
三棱藨草样本 ＣＪ１ 的基因组特征ꎬ测序深度约为 １２０ ×ꎬ并以绿豆(Ｖｉｇｎａ ｒａｄｉａｔａ)为参考标准ꎬ利用流式细胞
术测定了海三棱藨草及其同域近缘种扁秆藨草和藨草以及海三棱藨草和扁秆藨草的杂交 Ｆ１ 共 １３ 个样本
的 ＤＮＡ Ｃ 值和相对倍性ꎮ 结果表明:(１)基因组 Ｓｕｒｖｅｙ 分析测得 ＣＪ１ 的基因组大小为 ２４４.１２ Ｍｂｐꎬ杂合率
为 ０.６８％ꎬ重复序列比例为 ４２.３８％ꎬＧＣ 含量为 ３７.２５％ꎮ (２) 流式细胞术测得来自不同区域的海三棱藨草
各样本的基因组倍性相同ꎬ１Ｃ 值在 ２３４.８７ ~ ２４２.５ Ｍｂｐ 之间ꎬ其中 ＣＪ１ 的基因组大小与基因组 Ｓｕｒｖｅｙ 检测
结果高度一致ꎮ (３)扁秆藨草的 １Ｃ 值在 ２５１.７７ ~ ２６４.１３ Ｍｂｐ 之间ꎬ藨草 １Ｃ 值为 ５３７.３３ Ｍｂｐꎮ 根据上述基
因组大小ꎬ认为海三棱藨草不可能是这两者的杂交种ꎮ 该研究补充了海三棱藨草及其近缘种的基因组特
征ꎬ为后续全基因组测序奠定基础ꎬ同时也否定了海三棱藨草起源于扁杆藨草和藨草杂交的假说ꎮ
关键词: 流式细胞术ꎬ 基因组大小ꎬ 基因组 Ｓｕｒｖｅｙ 分析ꎬ 海三棱藨草ꎬ 藨草属
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２３)１０￣１８３８￣１１
Ｇｅｎｏｍｅ ｓｉｚｅ ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ Ｓｃｉｒｐｕｓ
ｍａｒｉｑｕｅｔｅｒ ａｎｄ ｉｔｓ ｒｅｌａｔｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ
１ꎬ２ １ꎬ２ １ꎬ２ １ꎬ２ １ꎬ２∗
ＤＥＮＧ Ｈａｏｋｅ ꎬ ＬＵＯ Ｌｉｎｇ ꎬ ＷＡＮＧ Ｒｕｏｑｉｕ ꎬ ＧＡＯ Ｓｈａｏｙｕ ꎬ ＺＨＡＮＧ Ｗｅｎｊｕ
( １. Ｍｉｎｉｓｔｒｙ ｏｆ Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｆｏｒ Ｂｉｏｄｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇꎬ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｂｉｏｄｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｃｉｅｎｃｅꎬ
Ｆｕｄａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｓｈａｎｇｈａｉ ２００４３８ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ２. Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｏｂｓｅｒｖａｔｉｏｎｓ ａｎｄ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｔａｔｉｏｎ ｆｏｒ Ｗｅｔｌａｎｄ
Ｅｃｏｓｙｓｔｅｍｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｙａｎｇｔｚｅ Ｅｓｔｕａｒｙꎬ Ｆｕｄａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｓｈａｎｇｈａｉ ２００４３８ꎬ Ｃｈｉｎａ )
收稿日期: ２０２２－１２－２９
基金项目: 国家自然科学基金(３２１７０２２５) ꎮ
第一作者: 邓颢珂(１９９７－)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为生态与进化生物学ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)１９２１０７００００１＠ ｆｕｄａｎ.ｅｄｕ.ｃｎꎮ
∗
通信作者: 张文驹ꎬ博士ꎬ教授ꎬ研究方向为生态与进化生物学ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｗｊｚｈａｎｇ＠ ｆｕｄａｎ.ｅｄｕ.ｃｎꎮ
