Page 87 - 《广西植物》2023年第10期
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１０ 期 邓颢珂等: 海三棱藨草及其近缘种基因组大小的测定 １ ８ ４ １
表 １ 实验材料及来源
Ｔａｂｌｅ １ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｎ ｍａｔｅｒｉａｌｓ ｕｓｅｄ ｉｎ ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ
物种 样本 采样点 生境 采样时间
Ｓｐｅｃｉｅｓ Ｓａｍｐｌｅ Ｓａｍｐｌｉｎｇ ｌｏｃａｔｉｏｎ Ｈａｂｉｔａｔ Ｓａｍｐｌｉｎｇ ｔｉｍｅ
海三棱藨草 ＣＪ１ 启东ꎬ江苏 低盐围垦地 ２０１６
Ｓｃｉｒｐｕｓ ｍａｒｉｑｕｅｔｅｒ Ｑｉｄｏｎｇꎬ Ｊｉａｎｇｓｕ Ｌｏｗ ｓａｌｉｎｉｔｙ ｒａｃｌａｉｍｅｄ ｌａｎｄ
ＣＪ２ 崇明ꎬ上海 中盐滩涂 ２０１３
Ｃｈｏｎｇｍｉｎｇꎬ Ｓｈａｎｇｈａｉ Ｍｅｄｉｕｍ ｓａｌｉｎｉｔｙ ｍｕｄｆｌａｔ
ＣＪ３ 横沙ꎬ上海 低盐围垦地 ２０１４
Ｈｅｎｇｓｈａꎬ Ｓｈａｎｇｈａｉ Ｌｏｗ ｓａｌｉｎｉｔｙ ｒａｃｌａｉｍｅｄ ｌａｎｄ
ＨＺ１ 乍浦ꎬ浙江 高盐滩涂 ２０１６
Ｚｈａｐｕꎬ Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｈｉｇｈ ｓａｌｉｎｉｔｙ ｍｕｄｆｌａｔ
ＨＺ２ 慈溪ꎬ浙江 高盐滩涂 ２０１５
Ｃｉｘｉꎬ Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｈｉｇｈ ｓａｌｉｎｉｔｙ ｍｕｄｆｌａｔ
ＨＺ３ 宁波ꎬ浙江 中盐滩涂 ２１０５
Ｎｉｎｇｂｏꎬ Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｍｅｄｉｕｍ ｓａｌｉｎｉｔｙ ｍｕｄｆｌａｔ
扁秆藨草 ＳＰ１ 杭州ꎬ浙江 湿地 ２００７
Ｓ. ｐｌａｎｉｃｕｌｍｉｓ Ｈａｎｇｚｈｏｕꎬ Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｗｅｔｌａｎｄ
ＳＰ２ 杭州ꎬ浙江 湿地 ２００８
Ｈａｎｇｚｈｏｕꎬ Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｗｅｔｌａｎｄ
ＳＰ３ 杭州ꎬ浙江 湿地 ２００９
Ｈａｎｇｚｈｏｕꎬ Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｗｅｔｌａｎｄ
海三棱藨草(♀) ×扁秆藨草 (♂) ＭＰ１ 复旦大学ꎬ上海 淡水 ２００９
Ｓ. ｍａｒｉｑｕｅｔｅｒ(♀) ×Ｓ. ｐｌａｎｉｃｕｌｍｉｓ (♂) Ｆｕｄａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｓｈａｎｇｈａｉ Ｆｒｅｓｈｗａｔｅｒ
ＭＰ２ 复旦大学ꎬ上海 淡水 ２００９
Ｆｕｄａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｓｈａｎｇｈａｉ Ｆｅｓｈｗａｔｅｒ
ＭＰ３ 复旦大学ꎬ上海 淡水 ２００９
Ｆｕｄａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｓｈａｎｇｈａｉ Ｆｒｅｓｈｗａｔｅｒ
藨草 ＳＴ１ 启东ꎬ江苏 湿地 ２０１６
Ｓ. ｔｒｉｑｕｅｔｅｒ Ｑｉｄｏｎｇꎬ Ｊｉａｎｇｓｕ Ｗｅｔｌａｎｄ
组数据进行初步拼接ꎮ 将 ＤＮＡ 片段随机截断成 保存ꎮ Ｇａｌｂｒａｉｔｈ 裂解液和 ＷＰＢ 裂解液的成分参照
更小的序列ꎬ利用序列间重叠关系构建 ｄｅ Ｂｒｕｉｊｉｎ 汪艳等(２０１５)对多种裂解液的总结ꎮ
图ꎬ对 ｄｅ Ｂｒｕｉｊｉｎ 图进行化简ꎬ截断重复区域边界获 １.３.２ 内标和外标 采用绿豆作为内标ꎬ绿豆的 １Ｃ
得 Ｃｏｎｔｉｇ 序列ꎬ将 Ｃｏｎｔｉｇ 序列构建成 Ｓｃａｆｆｏｌｄ 序列 值为 １Ｃ ＝ ０.５３ ｐｇ(５１８.３４ Ｍｂｐ)(Ｂｅｎｎｅｔｔ ＆ Ｓｍｉｔｈꎬ
并对其 Ｇａｐ 区域进行填补ꎮ 对组装的 Ｃｏｎｔｉｇ 绘制 １９９１)ꎮ 测定藨草属各物种样本的相对倍性时ꎬ以
ＧＣ 含量深度图(Ｌｉ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１０)ꎮ 同物种的一个样本(ＣＪ１ 或 ＳＰ１ 或 ＭＰ１) 作为外标
１.３ 流式细胞仪检测藨草属植物基因组大小 参考样品ꎮ
１.３.１ 酶和裂解液 纤维素酶和果胶酶分别购买 １.３.３ 细 胞 悬 液 制 备 细 胞 核 悬 液 的 制 备 参 照
自麦克林试剂公司的生物技术级 Ｃ６３３９ 纤维素 Ｄｏｌｅｚｅｌ 等(２００３) 的实验方法并进行了部分改进ꎮ
酶、Ｍ６３４６ 果胶酶ꎬ配置 １００ ｍＬ ２％ 的酶制剂:称 取新鲜的植物叶片ꎬ洗净并擦干ꎬ切成 １ ｃｍ 左右的
取 ２ ｇ 纤维素酶和 ２ ｇ 果胶酶ꎬ加纯水定容至 １００ 小段ꎮ 取 １.５ ｍＬ 预先配置的混合均匀的酶溶液置
ｍＬꎬ４ ℃ 保存ꎮ 选取 Ｇａｌｂｒａｉｔｈ 和 ＷＰＢ 两种裂解液 于 ２ ｍＬ ＥＰ 管 中ꎻ 在 使 用 内 标 测 定 时 分 别 加 入
用于细胞核悬液制备ꎬ裂解液购买自青岛捷世康 ０.１５ ｇ 待测植株叶片和 ０.１５ ｇ 内标叶片ꎬ使用外标
生物科技有限公司所配置好的 １００ ｍＬ 成液ꎬ４ ℃ 测定时加入 ０.３ ｇ 待测植株叶片或外标叶片ꎬ进行
