Page 89 - 《广西植物》2023年第10期

１０ 期 邓颢珂等: 海三棱藨草及其近缘种基因组大小的测定 １ ８ ４ ３

表 ２ 海三棱藨草样本 ＣＪ１ 的基因组组装结果统计
Ｔａｂｌｅ ２ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｇｅｎｏｍｅ ａｓｓｅｍｂｌｙ ｒｅｓｕｌｔｓ ｏｆ Ｓｃｉｒｐｕｓ ｍａｒｉｑｕｅｔｅｒ ｓａｍｐｌｅ ＣＪ１
项目 总长 总数 最大长度 Ｎ５０ Ｎ９０
Ｔｉｔｌｅ Ｔｏｔａｌ ｌｅｎｇｔｈ (ｂｐ) Ｔｏｔａｌ ｎｕｍｂｅｒ Ｍａｘ ｌｅｎｇｔｈ (ｂｐ) (ｂｐ) (ｂｐ)

Ｃｏｎｔｉｇ １８８ ３６４ ８７７ １１８ ２８２ ９０ ７０３ ９ ０９６ ７０８
Ｓｃａｆｆｏｌｄ １８９ ８１９ ２１９ ９６ ９４０ １４３ １６３ １７ ２８７ ８９０

Ａ. Ｃｏｎｔｉｇ 覆盖深度和长度分布图ꎻ Ｂ. ＧＣ 含量分布ꎬ其横坐标与 Ｄ 分图横坐标对应ꎻ Ｃ. Ｃｏｎｔｉｇ 覆盖深度和数量分布图ꎻ Ｄ. 横坐
标为 ＧＣ 含量ꎬ纵坐标为测序深度ꎬ深色代表点密度大的区域ꎻ Ｅ. Ｃｏｎｔｉｇ 覆盖深度分布ꎬ其纵坐标与 Ｄ 分图纵坐标对应ꎮ
Ａ. Ｃｏｎｔｉｇ ｃｏｖｅｒａｇｅ ｄｅｐｔｈ ａｎｄ ｌｅｎｇｔｈ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎꎻ Ｂ. ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎꎬ ｉｔｓ ａｂｓｃｉｓｓａ ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｓ ｔｏ ｔｈｅ ａｂｓｃｉｓｓａ ｏｆ Ｆｉｇ. Ｄꎻ Ｃ. Ｃｏｎｔｉｇ
ｃｏｖｅｒａｇｅ ｄｅｐｔｈ ａｎｄ ｎｕｍｂｅｒ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎꎻ Ｄ. Ａｂｓｃｉｓｓａ ｉｓ ｔｈｅ ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔꎬ ｔｈｅ ｏｒｄｉｎａｔｅ ｉｓ ｔｈｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｄｅｐｔｈꎬ ａｎｄ ｔｈｅ ｄａｒｋ ｃｏｌｏｕｒ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ
ｔｈｅ ａｒｅａ ｗｉｔｈ ｈｉｇｈ ｄｏｔ ｄｅｎｓｉｔｙꎻ Ｅ. Ｃｏｎｔｉｇ ｃｏｖｅｒａｇｅ ｄｅｐｔｈ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎꎬ ｉｔｓ ｏｒｄｉｎａｔｅ ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｓ ｔｏ ｔｈｅ ｏｒｄｉｎａｔｅ ｏｆ Ｆｉｇ. Ｄ.
图 ２ 海三棱藨草样本 ＣＪ１ 的 Ｃｏｎｔｉｇ 分布及 ＧＣ 含量与测序深度关联分析
Ｆｉｇ. ２ Ｃｏｎｔｉｇ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ａｎｄ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ ａｎｄ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｄｅｐｔｈ ｏｆ Ｓｃｉｒｐｕｓ ｍａｒｉｑｕｅｔｅｒ ｓａｍｐｌｅ ＣＪ１

测量的藨草属内不同物种 １Ｃ 均值从小到大 呈现一定的波动ꎬ但变化较小( 表 ３)ꎬ同一物种各
排列为海三棱藨草<杂交材料≈扁秆藨草<藨草ꎬ 样本和同物种样本 １(ＣＪ１ 或 ＳＰ１ 或 ＭＰ１)的 １Ｃ 值
杂交材料 １Ｃ 均值(２５７.２５ Ｍｂｐ) 处于父本扁秆藨 比率在 ０.９１ ~ １.１６ 之间ꎬ即同一物种的各样本拥
草(２５９.０８ Ｍｂｐ)和母本海三棱藨草(２３８.２８ Ｍｂｐ) 有相同倍性ꎮ
之间ꎮ 对藨草属内不同物种间基因组大小差异进
３ 讨论与结论
行显著性分析ꎬ结果有显著差异( Ｐ<０.０５ꎬｎ ＝ ３)ꎮ
对内标法测得结果进行物种间两两比较ꎬ海三棱
藨草与扁秆藨草、杂交材料以及藨草之间有显著 ３.１ 海三棱藨草及其近缘种基因组特征测定
差异ꎬ扁秆藨草与藨草之间差异显著ꎬ而与杂交材 本研究首次通过基因组 Ｓｕｒｖｅｙ 分析对海三棱
料之间差异不显著(表 ３)ꎮ 藨草基因组特征进行了评估ꎬ为流式细胞术测量
测量结果显示同一物种不同样本之间 １Ｃ 值 藨草属植物基因组大小提供参考ꎬ 同时 Ｓｕｒｖｅｙ 分