Page 54 - 《广西植物》2023年第11期
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表 3 桃叶珊瑚属 6 种植物叶绿体基因组的基因组成
Table 3 Chloroplast genome compositions of six Aucuba species
基因功能 基因分类 基因名称
Gene function Gene category Gene name
核糖体蛋白大亚基
自我复制
a
Large subunit of rpl2 aꎬ ∗ ×2、rpl14、rpl16 、rpl20、rpl22、rpl23 ×2、rpl32、rpl33、rpl36
Self ̄replication
ribosome protein
核糖体蛋白小亚基 a aꎬbꎬ ∗∗
rps2、 rps3、 rps4、 rps7 × 2、 rps8rps11、rps12 × 2、 rps14、 rps15、 rps16 、
Small subunit of
rps18、rps19 a
ribosome protein
RNA 聚合酶亚基
rpoA、rpoB、rpoC1 、rpoC2
Subunit RNA polymerase
核糖体 RNAs
a
a
a
a
rrn4.5 ×2、rrn5 ×2、rrn16 ×2、rrn23 ×2
Ribosomal RNAs
trnA-UGC aꎬ ∗ ×2、trnC- GCA、trnD- GUC、trnE - UUC、trnF- GAA、trnfM-
a aꎬ ∗
CAU、trnG-UCC 、trnG-UCC、trnH-GUG、trnI-CAU × 2、trnI-GAU ×
a
转运 RNAs 2、trnK-UUU 、trnL-CAA ×2、trnL-UAA 、trnL-UAG、trnM-CAU、trnN-
a
a
Transfer RNAs GUU ×2、trnP-GGG、trnQ-UUG、trnR-ACG × 2、trnR-UCU、trnS-GCU、
a
trnS - GGA、 trnS - UGA、 trnT - GGU、 trnT - UGU、 trnV - GAC × 2、
trnV-UAC 、trnW-CCA、trnY-GUA
光合作用 光系统Ⅰ亚基
psaA、psaB、psaC、psaI、psaJ
Photosynthesis Subunit of photosystem I
光系统Ⅱ亚基 psbA、psbB、psbC、psbD、psbE、psbF、psbH、psbI、psbJ、psbK、psbL、psbM、psbN、
Subunit of photosystem Ⅱ psbT、psbZ、ycf3
NADH 脱氢酶亚基
ndhA 、ndhB aꎬ ∗ ×2、ndhC、ndhD、ndhE、ndhF a
Subunit of NADH ̄
ndhG、ndhH、ndhI、ndhJ、ndhK
dehydrogenase
细胞色素 b / f 复合物亚基
Subunit of cytochrome petA、petB 、petD 、petG、petL、petN
b / f complex
ATP 合成酶亚基
atpA、atpB、atpE、atpF 、atpH、atpI
Subunit of ATP synthase
核酮糖二磷酸羧化酶大亚基
rbcL
RubisCO large subunit
其他基因 翻译起始因子
infA
Other genes Translation initiation factor
成熟酶
matK
Maturase
蛋白酶 clpP
Protease
被膜蛋白
cemA
Envelope membrane protein
乙酰 ̄CoA ̄羧化酶亚基
Subunit of acetyl ̄ accD
CoA ̄carboxylase
C 类型细胞色素合成酶
ccsA
C ̄type cytochrome synthase
未知功能基因 开放阅读框
a
a
ycf1、ycf2 ×2、ycf4、ycf15 ×2
Unknown function gene Open reading frames
注: 表示位于反向重复区的基因ꎻ 表示反式剪接基因ꎻ 表示含有一个内含子的基因ꎻ 表示含有两个内含子的基因ꎻ ×2 表
b
a
示双拷贝基因ꎮ
a b
Note: indicates gene in inverted repeat regionꎻ indicates trans ̄splinting geneꎻ indicates gene containing one intronꎻ indicates gene
containing two intronsꎻ ×2 indicates gene with duplicate copy.