Page 23 - 广西植物2024年1期
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１ 期 杨楠等: 极小种群植物川柿叶绿体基因组特征与系统发育分析 １ ９
图 １ 川柿叶绿体基因组的基因图谱
Ｆｉｇ. １ Ｇｅｎｅ ｍａｐ ｏｆ Ｄｉｏｓｐｙｒｏｓ ｓｕｔｃｈｕｅｎｓｉｓ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ
３ 个序列重复了 ３ 次、２ 个序列重复了 ６ 次、２ 个序 复合 ＳＳＲ(表 ２)ꎮ 单核苷酸重复序列的重复单元
列重复了 ４ 次、１ 个序列重复了 １２ 次、１ 个序列重 大部分为碱基 Ａ 或碱基 Ｔꎬ只在 ＬＳＣ 区出现了一
复了 ５ 次ꎮ １７ 个 串 联 重 复 发 生 在 基 因 间 隔 区 个 Ｇ 碱基的重复单元ꎮ 五核苷酸重复序列 １ 个ꎬ
(ＩＧＳ)、７ 个 发 生 在 基 因 ｙｃｆ２ 上、 １ 个 位 于 基 因 重复单元为 ＡＧＴＴＴꎮ
ｎｄｈＦ、其余 ２ 个分布在基因 ｎｄｈＡ 的内含子上ꎮ 在 ２.３ 序列变异分析
川柿叶绿体基因组共检测到 ３４ 个简单重复序列 通过计算比较了 １２ 个柿属物种叶绿体全基因
ＳＳＲꎬ其中 ３３ 个为单核苷酸重复序列ꎬ另外 １ 个为 组序列间的核苷酸多样性 (Ｐ )ꎮ 图 ２ 结果显示ꎬ
ｉ
