Page 25 - 广西植物2024年1期
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１ 期 杨楠等: 极小种群植物川柿叶绿体基因组特征与系统发育分析 ２ １
表 ２ 川柿叶绿体基因组所含简单重复序列 (ＳＳＲ)
Ｔａｂｌｅ ２ Ｓｉｍｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｒｅｐｅａｔｓ (ＳＳＲ) ｉｎ Ｄｉｏｓｐｙｒｏｓ ｓｕｔｃｈｕｅｎｓｉｓ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ
类型 简单重复序列 大小 起始位点 终止位点 序列所在区域
Ｔｙｐｅ ＳＳＲ Ｓｉｚｅ Ｓｔａｒｔ Ｅｎｄ Ｌｏｃａｔｉｏｎ
ｐ１ (Ａ) １４ ３９１ ４０４ ＩＧＳ (ｔｒｎＨ￣ＧＵＧ￣ｐｓｂＡ)
ｐ１ (Ａ) １１ ４ ８３２ ４ ８４２ ＩＧＳ (ｔｒｎＫ￣ＵＵＵ￣ｒｐｓ１６)
ｐ１ (Ｔ) １０ １１ ２２８ １１ ２３７ ＩＧＳ (ｔｒｎＲ￣ＵＣＵ￣ａｔｐＡ)
ｐ１ (Ａ) １０ １３ ６７０ １３ ６７９ ａｔｐＦ
ｐ１ (Ｔ) １１ １４ １８２ １４ １９２ ＩＧＳ (ａｔｐＦ￣ａｔｐＨ)
ｐ１ (Ｔ) １０ １５ ５３４ １５ ５４３ ＩＧＳ (ａｔｐＨ￣ａｔｐＩ)
ｐ１ (Ｔ) １１ １６ ７２７ １６ ７３７ ＩＧＳ (ａｔｐＩ￣ｒｐｓ２)
ｐ１ (Ａ) １０ １７ ５４８ １７ ５５７ ＩＧＳ (ｒｐｓ２￣ｒｐｏＣ２)
ｐ１ (Ｔ) １１ １９ ７５５ １９ ７６５ ｒｐｏＣ２
ｐ１ (Ｔ) １０ ２７ ４７４ ２７ ４８３ ｒｐｏＢ
ｐ１ (Ａ) １０ ４９ ３２７ ４９ ３３６ ＩＧＳ (ｔｒｎＴ￣ＵＧＵ￣ｔｒｎＬ￣ＵＡＡ)
ｐ１ (Ｔ) １２ ５２ ６５０ ５２ ６６１ ＩＧＳ (ｎｄｈＫ￣ｎｄｈＣ)
ｐ１ (Ｔ) １０ ５３ ４５３ ５３ ４６３ ＩＧＳ (ｎｄｈＣ￣ｔｒｎＶ￣ＵＡＣ)
ｐ１ (Ｔ) １０ ５７ ０７４ ５７ ０８３ ａｔｐＢ
ｐ１ (Ｇ) １０ ５７ ６７０ ５７ ６７９ ＩＧＳ (ａｔｐＢ￣ｒｂｃＬ)
ｐ１ (Ａ) １０ ６６ ６７０ ６６ ６７９ ＩＧＳ (ｐｅｔＡ￣ｐｓｂＪ)
ｐ１ (Ｔ) １３ ６９ ８７４ ６９ ８８６ ＩＧＳ (ｔｒｎＰ￣ＵＧＧ￣ｐｓａＪ)
ｐ１ (Ｔ) １０ ７４ ３４９ ７４ ３５８ ｃｌｐＰ
ｐ１ (Ａ) １１ ７８ ４５４ ７８ ４６４ ｐｅｔＢ
ｐ１ (Ｔ) １０ ８１ ０１０ ８１ ０１９ ＩＧＳ (ｐｅｔＤ￣ｒｐｏＡ)
ｐ１ (Ｔ) １０ ８１ ２６７ ８１ ２７６ ｒｐｏＡ
ｐ１ (Ｔ) １０ ８３ １８４ ８３ １９３ ＩＧＳ (ｉｎｆＡ￣ｒｐｓ８)
ｐ１ (Ｔ) １０ ８７ ３２４ ８７ ３３３ ＩＧＳ (ｒｐｓ１９￣ｒｐｌ２)
ｐ１ (Ａ) １０ １１０ ９７６ １１０ ９８５ ＩＧＳ (ｒｒｎ５￣ｔｒｎＲ￣ＡＣＧ)
ｐ５ (ＡＧＴＴＴ) ３ １５ １１７ １６４ １１７ １７８ ＩＧＳ (ｒｐｌ３２￣ｔｒｎＬ￣ＵＡＧ)
(Ｔ) １０ ｃａｔｔｔｔｔｔａａｔｇａｔｔｃａｔｔｔｔ
ｃ ｔｃａｔｔｔａｔｃｔｇａｔｔｔｃａｔａａａｔａｔｇ (Ａ) ８７ １１７ ３５９ １１７ ３６８ ＩＧＳ (ｒｐｌ３２￣ｔｒｎＬ￣ＵＡＧ)
１０ ｃｇｔｔｔｔｔｔｇ (Ｔ) １２
ｐ１ (Ｔ) １０ １２４ ０３１ １２４ ０４０ ｎｄｈＡ
ｐ１ (Ｔ) １１ １２４ ２８８ １２４ ２９８ ｎｄｈＡ
ｐ１ (Ｔ) １１ １２９ ０１５ １２９ ０２５ ｙｃｆ１
ｐ１ (Ｔ) １０ １２９ ５０６ １２９ ５１５ ｙｃｆ１
ｐ１ (Ｔ) １０ １２９ ９７４ １２９ ９８３ ｙｃｆ１
ｐ１ (Ｔ) １０ １３１ １２０ １３１ １２９ ｙｃｆ１
ｐ１ (Ｔ) １０ １３４ ２３６ １３４ ２４５ ＩＧＳ (ｔｒｎＲ￣ＡＣＧ￣ｒｒｎ５)
ｐ１ (Ａ) １０ １５７ ８８８ １５７ ８９７ ＩＧＳ (ｒｐｌ２３￣ｔｒｎＨ￣ＧＵＧ)
注: ｐ１ / ｐ５. 单核苷酸 / ５ 核苷酸重复数ꎻ ｃ. 复合 ＳＳＲｓꎻ ＩＧＳ. 基因间隔区ꎮ
Ｎｏｔｅ: ｐ１ / ｐ５. Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｍｏｎｏ￣ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｒｅｐｅａｔｓ/ ｐｅｎｔａ￣ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｒｅｐｅａｔｓꎻ ｃ. Ｃｏｍｐｏｕｎｄ ＳＳＲｓꎻ ＩＧＳ. Ｉｎｔｅｒｇｅｎｉｃ ｓｐａｃｅｒ ｒｅｇｉｏｎｓ.
