Page 24 - 广西植物2024年1期
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2 0 广 西 植 物 44 卷
表 1 川柿叶绿体基因组注释基因表
Table 1 List of annotated genes in Diospyros sutchuensis chloroplast genome
基因分类 基因分组 基因名称
Category of gene Group of gene Name of gene
自我复制相关基因 核糖体 RNA 基因 rrn16( ×2)ꎬ rrn23 ( ×2)ꎬ rrn4.5 ( ×2)ꎬ rrn5 ( ×2)
Self ̄replicating Ribosomal RNAs gene
related gene
转运 RNA 基因 trnA ̄UGC( ×2)ꎬ trnC ̄GCAꎬ trnD ̄GUCꎬ trnE ̄UUCꎬ trnF ̄GAAꎬ trnfM ̄
Transfer RNAs gene CAUꎬ trnG ̄GCCꎬ trnG ̄UCCꎬ trnH ̄GUGꎬ trnI ̄CAU ( ×2)ꎬ trnI ̄GAU
( ×2)ꎬ trnK ̄UUUꎬ trnL ̄CAA ( ×2)ꎬ trnL ̄UAAꎬ trnL ̄UAGꎬ trnM ̄CAUꎬ
trnN ̄GUU ( ×2)ꎬ trnP ̄UGGꎬ trnQ ̄UUGꎬ trnR ̄ACG ( ×2)ꎬ trnR ̄
UCUꎬ trnS ̄GCUꎬ trnS ̄GGAꎬ trnS ̄UGAꎬ trnT ̄GGUꎬ trnT ̄UGUꎬ trnV ̄
GAC ( ×2)ꎬ trnV ̄UACꎬ trnW ̄CCAꎬ trnY ̄GUA
核糖体蛋白小亚基基因 rps2ꎬ rps3ꎬ rps4ꎬ rps7 ( ×2)ꎬ rps8ꎬ rps11ꎬ rps12 ( ×2)ꎬ rps14ꎬ rps15ꎬ
Small subunit of ribosomal proteins gene rps16ꎬ rps18ꎬ rps19ꎬ rpoAꎬ rpoBꎬ rpoC1ꎬ rpoC2
核糖体蛋白大亚基基因 rpl2 ( ×2)ꎬ rpl14ꎬ rpl16ꎬ rpl20ꎬ rpl22ꎬ rpl23 ( ×2)ꎬ rpl32ꎬ
Large subunit of ribosomal proteins gene rpl33ꎬ rpl36
光合作用相关基因 ATP 酶合成基因 atpAꎬ atpBꎬ atpEꎬ atpFꎬ atpHꎬ atpI
Gene involving in ATP synthase gene
photosynthesis
装配 / 稳定光系统 Ⅰ 基因 ycf3ꎬ ycf4
Assembly / stability of photosystem Ⅰ gene
细胞色素 b / f 复合物基因 petAꎬ petBꎬ petDꎬ petGꎬ petLꎬ petN
Cytochrome b / f complex gene
c 型细胞色素合成基因 ccsA
c type cytochrome synthesis gene
NADH 脱氢酶基因 ndhAꎬ ndhB ( ×2)ꎬ ndhCꎬ ndhDꎬ ndhEꎬ ndhFꎬ ndhGꎬ ndhHꎬ ndhIꎬ
NADPH dehydrogenase gene ndhJꎬ ndhK
光系统 Ⅰ 基因 psaAꎬ psaBꎬ psaCꎬ psaJ
Photosystem Ⅰ gene
光合系统 Ⅱ 基因 psbAꎬ psbBꎬ psbCꎬ psbDꎬ psbEꎬ psbFꎬ psbHꎬ psbIꎬ psbJꎬ psbKꎬ psbLꎬ
Photosystem Ⅱ gene psbMꎬ psbNꎬ psbTꎬ psbZ
二磷酸核酮糖羧化酶大亚基基因 rbcL
RubisCO large subunit gene
其他基因 蛋白水解作用基因 clpP
Other gene Proteolysis gene
成熟酶基因 matK
Maturase gene
包裹膜蛋白基因 cemA
Envelop membrane protein gene
乙酰辅酶 A 羧化酶亚基基因 accD
Subunit of acetyl CoA ̄carboxylase gene
转录起始因子基因 Inf A
Transcription initiation factor IF ̄1 gene
TIC 复合体组成基因 ycf1
Component of TIC complex gene
假定叶绿体开放性阅读框 ycf2 ( ×2)ꎬ ycf15 ( ×2)
Hypothetical chloroplast reading frames gene