Page 42 - 广西植物2024年1期
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３ ８ 广 西 植 物 ４４ 卷
Ａ. 中性绘图分析ꎻ Ｂ. ＥＮＣ￣ＧＣ３ 关联分析ꎻ Ｃ. ＰＲ２￣ｐｌｏｔ 关联分析ꎮ
Ａ. Ｎｅｕｔｒａｌｉｔｙ ｐｌｏｔ ａｎａｌｙｓｉｓꎻ Ｂ. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ ＥＮＣ￣ＧＣ３ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐꎻ Ｃ. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ ＰＲ２￣ｐｌｏｔ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ.
图 ４ 越南小花金花茶叶绿体基因的进化因素分析
Ｆｉｇ. ４ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｆｏｒｃｅｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｅｓ ｉｎ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｍｉｎｉｍａ
码ꎬ叶绿体基因倾向于使用 Ａ/ Ｕ 密码子ꎬ与耿晓姗 在叶绿体基因组中ꎬＩＲ 的收缩和扩张时常发
等(２０２２) 对金花茶的密码子分析研究结果一致ꎮ 生ꎬ这些差异会导致假基因的产生、基因重复和基
通过进行中性绘图分析ꎬ本研究发现 ＧＣ１２ 和 ＧＣ３ 因缺失ꎬ进一步造成 ＩＲ/ ＳＣ 连接处的位置变化ꎬ高
之间并无显著相关性且基因分布相对集中ꎬ表明自 等植物叶绿体基因组长度变异就是由这种位置变
然选择是影响密码子偏好的主要因素(Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ 化而造成(Ｌｉ ＤＭ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１)ꎮ 本研究对越南小花
２０１２)ꎮ 进一步结合 ＥＮＣ 绘图、ＰＲ２￣ｐｌｏｔ 分析结果ꎬ 金花茶及 ６ 个近缘金花茶组植物的叶绿体基因组边
表明越南小花金花茶的密码子使用偏好性受多个 界进行比较分析ꎬ结果表明 ７ 个物种 ＩＲ 区长度(２５
因素影响ꎬ包括突变压力、碱基组成和基因长度ꎬ其 ９９６~２６ ０９６ ｂｐ)基本一致ꎬ未检测到基因丢失ꎬ表明
中自然选择是主导影响因素ꎬ这与丁祥青等(２０２３) ＩＲ 区的高度保守可能对于维持其长度和结构稳定
和李清等(２０２２) 的研究结果一致ꎮ 自然选择是叶 至关重要ꎮ 通过边界收缩和扩张分析ꎬ本研究发现
绿体基因组进化的主要驱动力ꎬ这一发现加深了我 ｙｃｆ１ 基因的长度和位置在不同金花茶组植物间存在
们对越南小花金花茶进化历史的理解ꎬ特别是与自 差异ꎬ可能是潜在的突变热点区域ꎮ Ｌｉ Ｌ 等(２０２１)
然选择有关的进化历史ꎮ 对密码子偏好性的分析 研究表明ꎬｙｃｆ１ 基因因其高度的多态性而被推荐作
结果有利于密码子优化ꎬ可为今后金花茶组植物转 为植物的核心 ＤＮＡ 条形码ꎬ然而这一潜在的高变区
基因技术提供理论依据(段义忠和张凯ꎬ２０２０ꎻ Ｚｈａｏ 是否可以作为金花茶组植物有效的 ＤＮＡ 条形码还
ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６)ꎮ 需要进一步的验证ꎮ 此外ꎬ越南小花金花茶及 ６ 个
