Page 38 - 广西植物2024年1期

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３４广西植物４４卷
表１越南小花金花茶叶绿体基因组的注释基因信息
Ｔａｂｌｅ１ＡｎｎｏｔａｔｅｄｇｅｎｅｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｏｆＣａｍｅｌｌｉａｍｉｎｉｍａｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔｇｅｎｏｍｅ
功能家族基因名称
ＦｕｎｃｔｉｏｎＦａｍｉｌｙｎａｍｅＧｅｎｅｎａｍｅ
自我复制核糖体蛋白小亚基ｒｐｓ２ꎬ ｒｐｓ３ ꎬ ｒｐｓ４ꎬ ｒｐｓ８ꎬ ｒｐｓ１１ꎬ ｒｐｓ１４ꎬ ｒｐｓ１５ꎬ ｒｐｓ１６ꎬ ｒｐｓ１８ꎬ ｒｐｓ１９ꎬ ｒｐｓ７ ꎬ
Ｓｅｌｆ￣ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎＳｍａｌｌｓｕｂｕｎｉｔｏｆｒｉｂｏｓｏｍａｌｐｒｏｔｅｉｎｓ (ＳＳＵ) ｒｐｓ１２

核糖体ＲＮＡｒｒｎ４.５Ｓ ꎬ ｒｒｎ５Ｓ ꎬ ｒｒｎ１６Ｓ ꎬ ｒｒｎ２３Ｓ
ＴｒａｎｓｆｅｒＲＮＡ (ｒＲＮＡｓ)
核糖体蛋白大亚基ｒｐｌ１４ꎬ ｒｐｌ１６ꎬ ｒｐｌ２０ꎬ ｒｐｌ２２ꎬ ｒｐｌ３２ꎬ ｒｐｌ３３ꎬ ｒｐｌ３６ꎬ ｒｐｌ２ ꎬ ꎬ ｒｐｌ２３
Ｌａｒｇｅｓｕｂｕｎｉｔｏｆｒｉｂｏｓｏｍａｌｐｒｏｔｅｉｎｓ (ＬＳＵ)

ＤＮＡ依赖性ＲＮＡ聚合酶ｒｐｏＡꎬ ｒｐｏＢꎬ ｒｐｏＣ１ꎬ ｒｐｏＣ２
ＤＮＡ￣ｄｅｐｅｎｄｅｎｔＲＮＡｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ
转运ＲＮＡｔｒｎＣ￣ＧＣＡꎬ ｔｒｎＤ￣ＧＵＣꎬ ｔｒｎＥ￣ＵＵＣꎬ ｔｒｎＦ￣ＧＡＡꎬ ｔｒｎｆＭ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎＧ￣ＧＣＣꎬ ｔｒｎＧ￣
ＴｒａｎｓｆｅｒＲＮＡ (ｔＲＮＡｓ) ＵＣＣꎬ ｔｒｎＨ￣ＧＵＧꎬ ｔｒｎＫ￣ＵＵＵꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＡꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＧꎬ ｔｒｎＭ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎＰ￣ＵＧＧꎬ
ｔｒｎＱ￣ＵＵＧꎬ ｔｒｎＲ￣ＵＣＵꎬ ｔｒｎＳ￣ＧＣＵꎬ ｔｒｎＳ￣ＧＧＡꎬ ｔｒｎＳ￣ＵＧＡꎬ ｔｒｎＴ￣ＧＧＵꎬ ｔｒｎＴ￣
ＵＧＵꎬ ｔｒｎＶ￣ＵＡＣꎬ ｔｒｎＷ￣ＣＣＡꎬ ｔｒｎＹ￣ＧＵＡꎬ ｔｒｎＲ￣ＡＣＧ ꎬ ｔｒｎＬ￣ＣＡＡ ꎬ ｔｒｎＶ￣
ＧＡＣ ꎬ ｔｒｎＮ￣ＧＵＵ ꎬ ｔｒｎＩ￣ＣＡＵ ꎬ ｒｎＡ￣ＵＧＣ ꎬ ｔｒｎＩ￣ＧＡＵ
光合作用ＡＴＰ合成酶ａｔｐＡꎬ ａｔｐＢꎬ ａｔｐＥꎬ ａｔｐＦꎬ ａｔｐＨꎬ ａｔｐＩ
ＰｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓＡＴＰｓｙｎｔｈａｓｅ
ＮＡＤＨ－脱氢酶ｎｄｈＡꎬ ｎｄｈＣꎬ ｎｄｈＤꎬ ｎｄｈＥꎬ ｎｄｈＦꎬ ｎｄｈＧꎬ ｎｄｈＨꎬ ｎｄｈＩꎬ ｎｄｈＪꎬ ｎｄｈＫꎬ
ＮＡＤＨ￣ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅｎｄｈＢ
细胞色素ｂ / ｆ复合物ｐｅｔＡꎬ ｐｅｔＢꎬ ｐｅｔＤꎬ ｐｅｔＧꎬ ｐｅｔＬꎬ ｐｅｔＮ
Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅｂ / ｆｃｏｍｐｌｅｘ
光系统Ⅰ ｐｓａＡꎬ ｐｓａＢꎬ ｐｓａＣꎬ ｐｓａＩꎬ ｐｓａＪ
ＰｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍＩ
光系统Ⅱ ｐｓｂＡꎬ ｐｓｂＢꎬ ｐｓｂＣꎬ ｐｓｂＤꎬ ｐｓｂＥꎬ ｐｓｂＦꎬ ｐｓｂＨꎬ ｐｓｂＩꎬ ｐｓｂＪꎬ ｐｓｂＫꎬ ｐｓｂＬꎬ
Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ⅱ ｐｓｂＭꎬ ｐｓｂＮꎬ ｐｓｂＴꎬ ｐｓｂＺ
二磷酸核酮糖氧合酶大亚基ｒｂｃＬ
ＲｕｂｉｓＣＯｌａｒｇｅｓｕｂｕｎｉｔ
其他假定叶绿体阅读框 (ｙｃｆ) ｙｃｆ１ꎬ ｙｃｆ３ꎬ ｙｃｆ４ꎬ ｙｃｆ１５ ꎬ ｙｃｆ２
ＯｔｈｅｒＨｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔｒｅａｄｉｎｇｆｒａｍｅｓ (ｙｃｆ)
乙酰－ＣｏＡ－羧化酶ａｃｃＤ
Ａｃｅｔｙｌ￣ＣｏＡ￣ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ
包膜蛋白基因ｃｅｍＡ
Ｅｎｖｅｌｏｐｅｐｒｏｔｅｉｎｇｅｎｅ
ｃ型细胞色素合成基因ｃｃｓＡ
Ｔｙｐｅｃｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅｓｙｎｔｈｅｓｉｓｇｅｎｅ
蛋白酶基因ｃｌｐＰ
Ｐｒｏｔｅａｓｅｇｅｎｅ (ｃｌｐＰ)
成熟酶基因ｍａｔＫ
Ｍａｔｕｒｅｅｎｚｙｍｅｇｅｎｅ (ｍａｔＫ)
转录起始因子ｉｎｆＡ
Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎｉｎｉｔｉａｔｉｏｎｆａｃｔｏｒ
注: 表示存在一个内含子ꎻ 表示存在两个内含子ꎮ
Ｎｏｔｅ: ｉｎｄｉｃａｔｅｓｔｈｅｐｒｅｓｅｎｃｅｏｆｏｎｅｉｎｔｒｏｎꎻ ｉｎｄｉｃａｔｅｓｔｈｅｐｒｅｓｅｎｃｅｏｆｔｗｏｉｎｔｒｏｎｓ.

研究中ꎬＰＲ２平面的４个区域并非均匀分布ꎮ 由基因组的密码子偏好性同时受到突变压力和自然
图４:Ｃ可知ꎬ大部分基因位于平面的下半部分ꎬ尤选择等因素的影响ꎮ
其是右下方ꎮ 因此ꎬ从碱基的使用频率来看ꎬＴ>Ａꎬ ２.４ＩＲ边界分析
Ｇ>Ｃꎬ表明叶绿体基因组中Ａ / Ｔ和Ｇ / Ｃ的密码子叶绿体基因组在ＬＳＣ、ＩＲｂ、ＩＲａ和ＳＳＣ之间有
使用偏好性不平衡ꎬ推断越南小花金花茶叶绿体４个边界ꎬ即ＬＳＣ / ＩＲｂ边界、ＩＲｂ / ＳＳＣ边界、ＳＳＣ /

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