Page 40 - 广西植物2024年1期
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3 6 广 西 植 物 44 卷
A. SSR 的类型与数量ꎻ B. LSC、SSC 和 IR 区域的蛋白编码区、基因间的间隔区和内含子中 SSR 的数量ꎻ C. 不同类型 SSR 的占
比ꎻ D. 散在重复序列类型与数量ꎮ
A. Type and number of SSRsꎻ B. Number of SSRs in the protein coding regionsꎬ intergenic spaces (IGSs) and introns of LSCꎬ SSC and IR
regionsꎻ C. Proportion of different types of SSRsꎻ D. Type and number of interspersed repeats.
图 2 越南小花金花茶叶绿体基因组的简单重复序列分布
Fig. 2 SSR distribution of chloroplast genomes in Camellia minima
表 2 ENC 值频数分布 2016)ꎮ 此外ꎬ越南小花金花茶的叶绿体基因组长
Table 2 Frequency number distribution of ENC value
度、基因的类型和排列顺序、GC 含量等与山茶属的
中值 频数
组限 频率 其他已发表物种 (如山茶、油茶、凹脉金花茶等) 相
Medium Frequency
Class boundary Frequency
value number 似(Li et al.ꎬ 2019)ꎮ 这表明越南小花金花茶叶绿
-0.05 ~ 0.05 0 9 0.17 体基因组的进化可能保守而缓慢(Sophiarani et al.ꎬ
0.05 ~ 0.15 0.1 30 0.58 2019ꎻ 丁祥青等ꎬ2022a)ꎮ
0.15 ~ 0.25 0.2 10 0.19 简单重复序列(SSRs)是由 DNA 链的滑移而产
0.25 ~ 0.35 0.3 2 0.04 生ꎬ在基因组和叶绿体基因组中都有较广分布ꎮ 与
其他中性 DNA 区域相比ꎬSSRs 通常具有更高的突
0.35 ~ 0.45 0.4 1 0.02
变率(Li et al.ꎬ 2018ꎻ Zhangꎬ 2019)ꎮ 由于其具有
和 8 个核糖体 RNA 基因ꎬ 共有 10 个基因含有内 非重组、单倍体和单亲遗传的特性ꎬ因此常被用作
含子ꎬ其中 rpl12 和 ndhB 基因含有 2 个内含子ꎬ与 遗传标记ꎬ为植物群体遗传学和生态学及进化研究
金花茶组其他植物的特征一致ꎬ可能与叶绿体基因 提供有 价 值 的 信 息 ( Aii et al.ꎬ 1997ꎻ Gui et alꎬ
组的 特 殊 结 构 和 复 制 方 式 有 关 ( Henry et al.ꎬ 2020)ꎮ 本研究在越南小花金花茶叶绿体基因组中