Page 39 - 广西植物2024年1期
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1 期 邓永彪等: 珍稀濒危植物越南小花金花茶的叶绿体基因组特征分析 3 5
图 1 越南小花金花茶的叶绿体基因组物理图谱
Fig. 1 Physical map of chloroplast genome in Camellia minima
IRa 边界和 IRa / LSC 边界ꎮ 本研究对越南小花金 用最大似然法构建系统发育树ꎮ 由图 6 可知ꎬ24
花茶及 6 个近缘金花茶组植物的叶绿体基因组边 种金花茶组植物主要分为 2 个分支ꎬ即 Clade Ⅰ分
界进行了比较分析ꎮ 由图 5 可知ꎬ在所有比较的 支和 Clade Ⅱ分支ꎮ Clade Ⅰ分支中ꎬ越南小花金
叶绿体基因组中ꎬIR 区仅有轻微的扩张和收缩ꎬ长 花茶( C. minima) 与小花金花茶( C. micrantha) 以
度从 25 996 bp(四季花金花茶)到 26 096 bp(毛瓣 100%的支持率聚为了一个单支ꎬ表明这两个物种
金花茶)ꎮ 在 LSC / IRb 边界处ꎬ所有物种的 rps19 的亲缘关系最近ꎮ
基因都跨越了 LSC / IRb 边界ꎬ向 IRb 区域延伸了
46 bpꎮ 在 IRb / SSC 边界处ꎬ7 个金花茶组植物的 3 讨论与结论
边界均位于 ycf1 假基因和 ndhF 基因的重叠处ꎬ在
越南金花茶和毛瓣金花茶中ꎬndhF 基因跨越 IRb / 金花茶组植物均为国家二级保护植物( 国家
SSC 边界ꎬ分别有 39、25 bp 位于 IRb 区域中ꎮ 在 林业和草原局 农业农村部ꎬ2021)ꎬ具有较高的观
SSC / IRa 边界处ꎬycf1 基因跨越该边界ꎬ包含在 IRa 赏和药用价值ꎮ 其中ꎬ越南小花金花茶是一种原
1 034 ~ 1 055 bp 区域内ꎮ 在 IRa / LSC 边界处ꎬ所 产于越南北部的金花茶组植物ꎬ生长于潮湿荫蔽
有物种的边界均位于 rps19 拷贝基因和 trnH 基因 的山谷ꎬ具有较强的适应能力ꎬ被视为优良的嫁接
之间ꎬtrnH 距离 IRa / LSC 边界 1 bpꎮ 砧木ꎬ近年来受到了园艺界的广泛关注( 李桂娥
2.5 系统发育分析 等ꎬ2022)ꎮ 越南小花金花茶叶绿体基因组为典型
基于 25 种山茶科植物( 包括 24 种金花茶组 的环状双链四分体结构ꎬ长度为 156 961 bpꎬGC 含
植物和 1 种大头茶属物种) 叶绿体全基因组序列 量为 37.32%ꎬ叶绿体全基因组注释到了 136 个基
构建系统发育树ꎬ以 P. penangensis 作为外类群ꎬ利 因ꎬ包括 87 个蛋白编码基因ꎬ41 个转运 RNA 基因