Page 41 - 广西植物2024年1期

１ 期 邓永彪等: 珍稀濒危植物越南小花金花茶的叶绿体基因组特征分析 ３ ７

不同颜色表示 ＲＳＣＵ 值的大小ꎬ随着颜色变深密码子使用率增加ꎮ
Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｃｏｌｏｒｓ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ ｔｈｅ ｓｉｚｅｓ ｏｆ ｔｈｅ ＲＳＣＵ ｖａｌｕｅｓ. Ａｓ ｔｈｅ ｃｏｌｏｒ ｄａｒｋｅｎｓꎬ ｔｈｅ ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｒａｔｅ ｉｎｃｒｅａｓｅｓ.
图 ３ 越南小花金花茶的 ＲＳＣＵ 值热图
Ｆｉｇ. ３ ＲＳＣＵ ｈｅａｔ ｍａｐ ｏｆ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｍｉｎｉｍａ

共鉴定了 ６６ 个 ＳＳＲ 位点ꎬ 主要位于大单拷贝区 体基因组中鉴定出的散在重复序列主要以正向和
(ＬＳＣ)ꎬ其中所有的单核苷酸重复都是由 Ａ/ Ｔ 组 回文重复为主ꎬ与抱茎金花茶叶绿体基因组序列特
成ꎬ类似的结果在金花茶组叶绿体基因组(丁祥青 征类似(丁祥青等ꎬ２０２２ｂ)ꎮ 这些重复序列是重要

等ꎬ２０２２ｂ)和其他被子植物中均有发现(Ｈｕｉ ｅｔ ａｌ.ꎬ 的遗传资源ꎬ在系统发育研究中具有重要作用(Ｗｅｉ
２０１４)ꎬ可 能 归 因 于 ｐｏｌｙＡ 和 ｐｏｌｙＴ 相 比 ｐｏｌｙＣ 和 ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２)ꎮ
ｐｏｌｙＧ 具有更高的结构稳定性(Ｊｉｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３)ꎮ 然 密码子使用偏好性对于研究基因的分子进化
而ꎬ我们检测到的 ＳＳＲ 位点数量与 Ｈｕｉ 等(２０１４)的 和外源表达具有重要意义(Ｌｉ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２)ꎮ 本研
结果存在差异ꎬ可能是由于检索 ＳＳＲ 位点的参数设 究首次系统分析了越南小花金花茶叶绿体基因组
定不同ꎬ导致输出的结果不同ꎮ 在越南小花金花茶 的密码子使用模式ꎬ发现精氨酸、异亮氨酸、甘氨酸
的叶绿体基因组中ꎬｃｐ￣ＳＳＲｓ 含量丰富ꎬ可用于检测 是密码子编码的最丰富的氨基酸ꎬ由 ６ 个密码子编
群体的遗传多态性ꎮ 此外ꎬ在越南小花金花茶叶绿 码ꎬ相比之下ꎬ色氨酸、甲硫氨酸仅有一个密码子编