Page 24 - 《广西植物》2024年第2期
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                                          表 2  PmHDR 基因相对同义密码子使用度
                                               Table 2  RSCU of PmHDR gene

                氨基酸       密码子           个数     频率       比例         氨基酸      密码子           个数     频率     比例
                                 RSCU                                              RSCU
               Amino acid  Codon       Number Frequency  Fraction  Amino acid  Codon     Number Frequency Fraction

               丙氨酸 Ala     GCA   1.87    14   28.807    0.467    脯氨酸 Pro     CCA   2.25    9    18.519  0.562
                           GCC   0.53    4     8.230    0.133                CCC   0.00    0     0.000  0.000
                           GCG   0.27    2     4.115    0.067                CCG   0.00    0     0.000  0.000
                           GCU   1.33    10   20.576    0.333                CCU   1.75    7    14.403  0.438
              半胱氨酸 Cys     UGC   0.86    3     6.173    0.429   谷氨酰胺 Gln     CAA   0.93    7    14.403  0.467
                           UGU   1.14    4     8.230    0.571                CAG   1.07    8    16.461  0.533
              天冬氨酸 Asp     GAC   0.37    5    10.288    0.185    精氨酸 Arg     AGA   2.70    9    18.519  0.450
                           GAU   1.63    22   45.267    0.815                AGG   1.80    6    12.346  0.300
               谷氨酸 Glu     GAA   1.27    28   57.613    0.636                CGA   0.30    1     2.058  0.050
                           GAG   0.73    16   32.922    0.364                CGC   0.60    2     4.115  0.100
              苯丙氨酸 Phe     UUC   0.44    4     8.230    0.222                CGG   0.00    0     0.000  0.000
                           UUU   1.56    14   28.807    0.778                CGU   0.60    2     4.115  0.100
               甘氨酸 Gly     GGA   2.06    16   32.922    0.516    丝氨酸 Ser     AGC   1.16    6    12.346  0.194
                           GGC   0.13    1     2.058    0.032                AGU   1.74    9    18.519  0.290
                           GGG   0.65    5    10.288    0.161                UCA   1.94    10   20.576  0.323
                           GGU   1.16    9    18.519    0.290                UCC   0.39    2     4.115  0.065
               组氨酸 His     CAC   0.67    3     6.173    0.333                UCG   0.19    1     2.058  0.032
                           CAU   1.33    6    12.346    0.667                UCU   0.58    3     6.173  0.097
              异亮氨酸 Ile     AUA   0.75    8    16.461    0.250    苏氨酸 Thr     ACA   1.11    10   20.576  0.278
                           AUC   0.56    6    12.346    0.188                ACC   0.22    2     4.115  0.056
                           AUU   1.69    18   37.037    0.562                ACG   0.56    5    10.288  0.139
              甲硫氨酸 Met     AUG   1.00    12   24.691    1.000                ACU   2.11    19   39.095  0.528
               赖氨酸 Lys     AAA   1.02    23   47.325    0.511      色氨酸 Trp   UGG   1.00    8    16.461  1.000
                           AAG   0.98    22   45.267    0.489      缬氨酸 Val   GUA   1.03    9    18.519  0.257
               亮氨酸 Leu     CUA   0.34    2     4.115    0.057                GUC   0.23    2     4.115  0.057
                           CUC   0.51    3     6.173    0.086                GUG   1.26    11   22.634  0.314
                           CUG   0.86    5    10.288    0.143                GUU   1.49    13   26.749  0.371
                           CUU   2.06    12   24.691    0.343      酪氨酸 Tyr   UAC   0.55    3     6.173  0.273
                           UUA   0.34    2     4.115    0.057                UAU   1.45    8    16.461  0.727
                           UUG   1.89    11   22.634    0.314         ∗      UAA   0.00    0     0.000  0.000
              天冬酰胺 Asn     AAC   0.87    10   20.576    0.435                UAG   1.00    1     2.058  1.000
                           AAU   1.13    13   26.749    0.565                UGA   0.00    0     0.000  0.000
              注: 下划线表示该密码子 RSCU>1ꎻ ∗表示终止密码子ꎮ
              Note: The underline indicates that the RSCU of the condon>1ꎻ ∗ indicates the stop codon.

            2.5 胁迫处理下拟南芥生长观测                                   集这 6 株拟南芥的种子ꎬ开展后续实验ꎮ
                 将转基因拟南芥种子播种在含 Kana 抗生素                            利用 D ̄mannitol 和 NaCl 分别对拟南芥进行干
            的 MS 固体培养基上进行筛选ꎬ并选取其中正常生                           旱胁迫和盐胁迫处理ꎬ将野生型和 PmHDR 转基因
            长发育的植株幼苗转移至营养土中继续培养 2 ~ 3                          拟南芥种子分别点播在含有不同浓度 D ̄mannitol
            周后进行分子鉴定(图 9)ꎬ结果显示被选择的 8 株                         和 NaCl 的 MS 固体培养基上培养 10 dꎬ观察并记
            转基因拟南芥中有 6 株检测结果为阳性ꎬ因此采                            录各个培养基中拟南芥的生长发育情况(图 10)ꎮ
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