Page 25 - 《广西植物》2024年第2期
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２ 期 王嘉雯等: 马尾松 ＨＤＲ 基因克隆及其对旱与盐胁迫的响应 ２ ２ ７
表 ３ ＰｍＨＤＲ 与部分模式物种基因组密码子使用偏好性比较
Ｔａｂｌｅ ３ Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｏｆ ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｐｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｂｅｔｗｅｅｎ ＰｍＨＤＲ ａｎｄ ｏｔｈｅｒ ｍｏｄｅｌ ｏｒｇａｎｉｓｍｓ
拟南芥 烟草 酿酒酵母 大肠杆菌
基因组 基因组 基因组 基因组
氨基酸 密码子 ＰｍＨＤＲ ＰｍＨＤＲ ＰｍＨＤＲ ＰｍＨＤＲ
ＰｍＨＤＲ Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ Ｎｉｃｏｔｉａｎａ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ
Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ Ｃｏｄｏｎ / Ａｔ / Ｎｔ / Ｓｃ / Ｅｃ
ｔｈａｌｉａｎａ ｔａｂａｃｕｍ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ ｃｏｌｉ
(Ａｔ) (Ｎｔ) (Ｓｃ) (Ｅｃ)
苯丙氨酸 Ｐｈｅ ＵＵＵ ２８.８１ ２１.８０ ２５.１０ ２６.１０ ２２.２０ １.３２ １.１５ １.１０ １.３０
ＵＵＣ ８.２３ ２０.７０ １８.００ １８.４０ １５.９０ ０.４０ ０.４６ ０.４５ ０.５２
亮氨酸 Ｌｅｕ ＵＵＡ ４.１２ １２.７０ １３.４０ ２６.２０ １３.８０ ０.３２ ０.３１ ０.１６ ０.３０
ＵＵＧ ２２.６３ ２０.９０ ２２.３０ ２７.２０ １３.００ １.０８ １.０１ ０.８３ １.７４
ＣＵＵ ２４.６９ ２４.１０ ２４.００ １２.３０ １１.４０ １.０２ １.０３ ２.０１ ２.１７
ＣＵＣ ６.１７ １６.１０ １２.３０ ５.４０ １０.５０ ０.３８ ０.５０ １.１４ ０.５９
ＣＵＡ ４.１２ ９.９０ ９.４０ １３.４０ ３.９０ ０.４２ ０.４４ ０.３１ １.０６
ＣＵＧ １０.２９ ９.８０ １０.２０ １０.５０ ５１.１０ １.０５ １.０１ ０.９８ ０.２０
异亮氨酸 Ｉｌｅ ＡＵＵ ３７.０４ ２１.５０ ２７.８０ ３０.１０ ２９.７０ １.７２ １.３３ １.２３ １.２５
ＡＵＣ １２.３５ １８.５０ １３.９０ １７.２０ ２３.９０ ０.６７ ０.８９ ０.７２ ０.５２
ＡＵＡ １６.４６ １２.６０ １４.００ １７.８０ ５.５０ １.３１ １.１８ ０.９２ ２.９９
甲硫氨酸 Ｍｅｔ ＡＵＧ ２４.６９ ２４.５０ ２５.００ ２０.９０ ２７.２０ １.０１ ０.９９ １.１８ ０.９１
谷氨酰胺 Ｇｌｎ ＣＡＡ １４.４０ １９.４０ ２０.７０ ２７.３０ １４.７０ ０.７４ ０.７０ ０.５３ ０.９８
ＣＡＧ １６.４６ １５.２０ １５.００ １２.１０ ２９.４０ １.０８ １.１０ １.３６ ０.５６
色氨酸 Ｔｒｐ ＵＧＧ １６.４６ １２.５０ １２.２０ １０.４０ １５.３０ １.３２ １.３５ １.５８ １.０８
缬氨酸 Ｖａｌ ＧＵＵ ２６.７５ ２７.２０ ２６.８０ ２２.１０ １８.１０ ０.９８ １.００ １.２１ １.４８
ＧＵＣ ４.１２ １２.８０ １１.１０ １１.８０ １４.８０ ０.３２ ０.３７ ０.３５ ０.２８
ＧＵＡ １８.５２ ９.９０ １１.４０ １１.８０ １０.９０ １.８７ １.６２ １.５７ １.７０
ＧＵＧ ２２.６３ １７.４０ １６.７０ １０.８０ ２６.２０ １.３０ １.３６ ２.１０ ０.８６
丝氨酸 Ｓｅｒ ＡＧＵ １８.５２ １４.００ １３.３０ １４.２０ ９.４０ １.３２ １.３９ １.３０ １.９７
ＡＧＣ １２.３５ １１.３０ １０.００ ９.８０ １６.００ １.０９ １.２３ １.２６ ０.７７
ＵＣＵ ６.１７ ２５.２０ ２０.００ ２３.５０ ８.７０ ０.２４ ０.３１ ０.２６ ０.７１
ＵＣＣ ４.１２ １１.２０ １０.２０ １４.２０ ８.９０ ０.３７ ０.４０ ０.２９ ０.４６
ＵＣＡ ２０.５８ １８.３０ １７.６０ １８.７０ ８.１０ １.１２ １.１７ １.１０ ２.５４
ＵＣＧ ２.０６ ９.３０ ５.３０ ８.６０ ８.８０ ０.２２ ０.３９ ０.２４ ０.２３
脯氨酸 Ｐｒｏ ＣＣＵ １４.４０ １８.７０ １８.７０ １３.５０ ７.２０ ０.７７ ０.７７ １.０７ ２.００
ＣＣＣ ０.００ ５.３０ ６.６０ ６.８０ ５.６０ ０.００ ０.００ ０.００ ０.００
ＣＣＡ １８.５２ １６.１０ １９.８０ １８.３０ ８.４０ １.１５ ０.９４ １.０１ ２.２０
ＣＣＧ ０.００ ８.６０ ５.００ ５.３０ ２２.４０ ０.００ ０.００ ０.００ ０.００
苏氨酸 Ｔｈｒ ＡＣＵ ３９.１０ １７.５０ ２０.３０ ２０.３０ ９.１０ ２.２３ １.９３ １.９３ ４.３０
ＡＣＣ ４.１２ １０.３０ ９.７０ １２.７０ ２２.８０ ０.４０ ０.４２ ０.３２ ０.１８
ＡＣＡ ２０.５８ １５.７０ １７.４０ １７.８０ ８.１０ １.３１ １.１８ １.１６ ２.５４
ＡＣＧ １０.２９ ７.７０ ４.５０ ８.００ １５.００ １.３４ ２.２９ １.２９ ０.６９
丙氨酸 Ａｌａ ＧＣＵ ２０.５８ ２８.３０ ３１.２０ ２１.２０ １５.４０ ０.７３ ０.６６ ０.９７ １.３４
ＧＣＣ ８.２３ １０.３０ １２.５０ １２.６０ ２５.２０ ０.８０ ０.６６ ０.６５ ０.３３
ＧＣＡ ２８.８１ １７.５０ ２３.１０ １６.２０ ２０.７０ １.６５ １.２５ １.７８ １.３９
