Page 108 - 《广西植物》2025年第1期
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1 0 4 广 西 植 物 45 卷
表 4 山东银莲花中不同 SSR 重复基序的出现频率
Table 4 Frequency of occurrence of different SSR
repeat motifs in Anemone shikokiana
重复基序 重复基序
种类数 类型 出现频率
SSR 类型 数量 Frequency of
Number of Repeat
SSR type Number occurrence
repeat motif motif
(%)
types type
单核苷酸 2 A / T 3 208 44.89
Mono ̄nucleotide
C / G 50 0.70
二核苷酸 4 AG / CT 927 12.97
Di ̄nucleotide
AC / GT 385 5.39
横坐标为 SSR 重复单元长度ꎬ纵坐标为该重复单元的重复
AT / AT 328 4.59 次数下 SSR 数量ꎮ
CG / CG 5 0.07 The horizontal coordinate is the length of SSR repeat unit and the
三核苷酸 10 AAG / CTT 648 9.07 vertical coordinate is the number of SSRs under the number of
Tri ̄nucleotide repetitions of that repeat unit.
ATC / ATG 338 4.73
图 5 山东银莲花 SSR 的类型分布
ACC / GGT 307 4.30
Fig. 5 SSR type distribution of Anemone shikokiana
AAC / GTT 205 2.87
AGC / CTG 188 2.63
表现出多态性ꎬ具有多态性的 EST ̄SSR 分子标记
AAT / ATT 168 2.35
可用于遗传多样性分析与分子标记辅助育种ꎮ 因
AGG / CCT 91 1.27
为国内山东银莲花材料稀缺ꎬ获取日本四国岛的
ACT / AGT 39 0.55
山东银莲花材料受限ꎬ所以在本研究中未进行相
CCG / CGG 33 0.46
关聚类分析以及系统进化树的构建ꎬ后续将通过
ACG / CGT 24 0.34
四核苷酸 17 AAAT / ATTT 37 0.52 银莲花属植物对本研究所得的山东银莲花 EST ̄
Tetra ̄nucleotide SSR 多态性引物的通用性进行验证ꎬ同时利用挖
AAAC / GTTT 10 0.14
掘的差异表达基因设计 EST ̄SSR 引物用于区分不
ACAT / ATGT 7 0.10
同生境的山东银莲花居群ꎬ为其进化研究和种质
其他 Others 27 0.38
五核苷酸 11 AGAGG / CCTCT 4 0.06 资源保护奠定基础ꎮ
Penta ̄nucleotide 综上所述ꎬ本研究对山顶灌丛和针阔混交林
AAAAC / GTTTT 3 0.04
下山东银莲花的转录组进行分析ꎬ表明其通过调
AAAAT / ATTTT 3 0.04
控光合作用途径和类黄酮生物合成途径涉及的基
其他 Others 10 0.14
因以适应异质生境ꎬ 并 首 次 开 发 多 态 性 较 好 的
六核苷酸 62 ACCAGC / CTGGTG 5 0.07
Hexa ̄nucleotide EST ̄SSR 分子标记ꎬ填补山东银莲花在此方面的空
AGATGG / ATCTCC 4 0.06
AAAATC / ATTTTG 3 0.04 白ꎬ对其保护与利用具有重要意义ꎮ
其他 Others 89 1.25
参考文献:
析结果一致ꎬ说明 EST ̄SSR 在其发生和进化过程
ANDERS Sꎬ HUBER Wꎬ 2012. BioC 2012: Differential
中具有高度保守性ꎮ EST ̄SSR 分子标记源于功能 expression of RNA ̄Seq data at the gene level [ J ].
基因表达序列ꎬ具有保守程度高、种间及属间通用 EMBL. https:/ / www. bioconductor. org/ help/ course ̄
性好等优点( 娄永峰等ꎬ2022)ꎮ 本研究基于拼接 materials/ 2012/ BioC2012/ DESeq.pdf.
BATSCHAUER Aꎬ 1993. A plant gene for photolyase: An
质量较高的转录组数据ꎬ利用 SSR 位点设计并合
enzyme catalyzing the repair of UV ̄light ̄induced DNA
成 100 对引物ꎬ其中有 68 对引物可以实现有效扩
damage [J]. The Plant Journalꎬ 4(4): 705-709.
增ꎬ有 11 对引物在不同地域的山东银莲花材料中 BEIER Sꎬ THIEL Tꎬ MÜNCH Tꎬ et al.ꎬ 2017. MISA ̄web: a

