Page 72 - 《广西植物》2025年第10期
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monitoringꎬMRM) 过 渡 的 解 簇 电 位 ( decoagulation 基于这些代谢信号对所有样本进行 PCA 分
protentialꎬDP)及碰撞能量( collision energyꎬCE) 展 析ꎬ结果表明类黄酮成分 1( PC1) 和成分 2( PC2)
开深度优化ꎬ结合各时间段洗脱的代谢物特性ꎬ分 分别解释了 76.51%和 17.43%的变异性ꎬ并且成分
时段精准监测特定的 MRM 过渡ꎮ 1 和成分 2 成功分离了所有组织ꎬ表明类黄酮代谢
1.4 氨基酸和糖样品前处理和色谱采集条件 多样性显著(图 1:D)ꎮ 氨基酸成分 1 和成分 2 分
氨 基 酸 及 其 代 谢 物 由 MetWare ( http: / / 别解释了 91.23%和 7.16%的变异性ꎬ并且成分 1
www.metware.cn / ) 基于 AB Sciex QTRAP 6500 LC ̄ 和成分 2 成功分离了所有组织ꎬ表明氨基酸代谢
MS / MS 平 台 进 行 检 测ꎮ 糖 含 量 由 基 于 Agilent 多样性显著(图 1:E)ꎮ 糖成分 1 和成分 2 分别解
8890 ̄5977B 平 台 的 MetWare ( http: / / www. 释了 97.87%和 2.02%的变异性ꎬ并且成分 1 和成
metware.cn / ) 检测ꎮ 分 2 成功分离了所有组织ꎬ表明糖代谢多样性显
1.5 代谢物定量和 DEGs 的分析 著(图 1:F)ꎮ 进一步观察表明ꎬ糖组分中茎、根、
将化合物的质谱图与质谱数据库( NIST 08) 叶的 3 个不同组织在 PCA 图中彼此更接近ꎬ表明
进行了比较ꎬ使用计划多反应监测( MRM) 方法对 组织具有相似的糖代谢特征ꎬ数据可信ꎮ 这表明
代谢 物 进 行 定 量 分 析ꎬ 我 们 使 用 R 软 件 包 R 虽然各组织存在糖代谢多样性ꎬ但相较于类黄酮
version 3.5.1 中的 MetaboAnalyst R 1.0.1 函数生成 和氨基酸代谢ꎬ它们的糖代谢特征更为相似ꎬ在整
主成分分析( principal component analysisꎬPCA) 和 体代 谢 模 式 和 代 谢 水 平 等 方 面 有 更 多 的 共 性
正交偏最小二乘判别分析( orthogonal partial least 之处ꎮ
squares ̄discriminant analysisꎬ OPLS ̄DA)ꎮ 在 数 据 2.2 差异代谢物筛选及生物活性物质代谢物组分
评估之后ꎬ筛选差异积累的代谢物[ 投影的可变重 及含量分析
要性( variable importance of projectionꎬVIP) > 0.7ꎬ 2.2.1 差异代谢物筛选 基于 2 个标准鉴定差异累
P<0.05](https: / / cloud.metware.cn)ꎮ 积 代 谢 物 ( differentially accumulated metabolitesꎬ
1.6 统计分析 DAM)ꎬ即 投 影 的 可 变 重 要 性 ( VIP ) ≥1 和 | log
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统计分析工作借助 SPSS Statistics 19.0( IBMꎬ (Fold change) | ≥1ꎮ 绘制火山图以直观地显示各
ArmonkꎬNYꎬUSA)ꎬ采用单因素方差和 Duncan 多 组中 差 异 表 达 基 因 ( differentially expressed geneꎬ
元比较检验分析不同组织样本和代谢物的差异ꎮ DEG)的分布ꎮ 红色、绿色和灰色圆点分别表示上
文中所有的数据作图由专业统计分析与绘图软件 调的代谢物、下调的代谢物和表达差异不显著的
R studio 完成ꎮ 代谢物(图 2)ꎮ 我们在茎 vs 根的黄酮代谢物比对
中ꎬ筛选出 136 种存在差异的代谢物ꎬ这些代谢物
2 结果与分析 的表达水平呈现出明显的分化态势ꎬ其中有 35 种
代谢物表达上调ꎬ101 种代谢物呈下调状态ꎻ在茎
2.1 生物活性成分代谢物分类和 PCA 分析 vs 叶中共筛选出 197 种差异代谢物ꎬ上调的达 50
类黄酮化合物共检测出 460 种ꎬ其中黄酮和黄 种ꎬ下调的多达 147 种ꎻ在根 vs 叶筛选出 210 种差
酮醇占比最高ꎬ分别为 35.21%和 32.61%ꎮ 其余类 异代谢物ꎬ上调、下调的代谢物分别为 93 种与 117
别的占比依次为二氢黄酮 (9. 78%)、二氢黄酮醇 种(图 2:A、B、C)ꎮ 氨基酸代谢层面ꎬ茎 vs 根的代
(2.61%)、异黄酮(4.57%)、查尔酮(6.74%)、黄烷 谢物比较中共确定 29 种差异代谢物ꎬ27 种呈现上
醇类(0.87%)和其他黄酮醇(7.61%)(图 1:A)ꎮ 对 调趋势ꎬ仅 2 种为下调ꎬ凸显茎在氨基酸合成、转
氨基酸代谢物的结构与功能进行分类统计ꎬ并以不 运或代谢消耗等环节的活跃程度远超根部ꎻ在茎
同颜色表示分类结果ꎮ 在铁皮石斛中ꎬ氨基酸及其 vs 叶的代谢差异探究中ꎬ15 种差异代谢物中 12 种
代谢物占比 76. 60%ꎬ有机酸及其代谢物占比 20. 上调、3 种下调ꎻ根 vs 叶 30 种差异代谢物中 7 种
21%ꎬ另有 3.19%的成分未检测出分类信息(图 1: 上调、23 种下调( 图 2:D、E、F)ꎮ 糖代谢中ꎬ茎 vs
B)ꎮ 糖代谢方面ꎬ主要检测出单糖占比最多ꎬ其次 根之间筛选出 3 种差异代谢物ꎬ其中 2 种上调、1
是二糖ꎬ三糖仅检测出 1 种(图 1:C)ꎮ 这表明铁皮 种下调ꎻ茎 vs 叶的比较实验里ꎬ共 9 种差异代谢
石斛中富含类黄酮、氨基酸、多糖等多种物质ꎮ 物ꎬ 其中 8 种上调、1 种下调ꎻ 根 vs 叶的比较结果

