Page 107 - 《广西植物》2025年第12期

１２ 期 雷翰霖等: 锦葵科 Ｍａｌｖａｔｈｅｃａ 分支的质体基因组演化及系统发育分析 ２ ２ ４ ９

表 １ 木棉亚科常见的质体 ＤＮＡ 分子片段和高变区的矩阵信息及系统发育分辨率
Ｔａｂｌｅ １ Ｔｈｅ ｍａｔｒｉｘ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｃｏｍｍｏｎｌｙ ｕｓｅｄ ｐｌａｓｔｉｄ ＤＮＡ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
ｆｒａｇｍｅｎｔｓ ａｎｄ ｈｉｇｈｌｙ ｖａｒｉａｂｌｅ ｒｅｇｉｏｎｓ ｉｎ Ｂｏｍｂａｃｏｉｄｅａｅ

变异位点 有效位点 主要分支支持率
矩阵长度 数量 (占比) 数量 (占比) Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｏｆ ｍａｊｏｒ ｃｌａｄｅｓ
序列 π 值 Ｍａｔｒｉｘ Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ
Ｓｅｑｕｅｎｃｅ π ｖａｌｕｅ ｌｅｎｇｔｈ ｖａｒｉａｂｌｅ ｓｉｔｅｓ ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ ｓｉｔｅｓ
(ｂｐ) (ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅꎬ (ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅꎬ 木棉属 吉贝属 瓜栗属 猴面包树属
Ｂｏｍｂａｘ Ｃｅｉｂａ Ｐａｃｈｉｒａ Ａｄａｎｓｏｎｉａ
％) ％)
ａｔｐＢ ０.００３ １ ４９７ １７(１.１４) ６(０.４０) — — — —
ｍａｔＫ ０.０１４ １ ５１５ ８６(５.６８) ４６(３.０４) １００ ８７ １００ ９９
ｎｄｈＦ ０.０１７ ２ ２２１ ７２(３.２４) ３４(１.５３) １００ ９９ ８３ １００
ｒｂｃＬ ０.００９ １ ５０３ ４３(２.８６) ３３(２.２０) ９９ — ６６ ６２
ｔｒｎＨ ＧＵＧ －ｐｓｂＡ∗ ０.０１７ １ ７８１ ７６(４.２７) ４３(２.４１) ９９ ９５ — ８１
ｔｒｎＬ ＵＡＡ －ｔｒｎＦ ＧＡＡ ０.０１３ １ ２０９ ５７(４.７１) ２９(２.４０) ９９ ８９ ９２ ９７
ａｃｃＤ－ｐｓａＩ∗ ０.０１７ ２ ４７４ ９３(３.７６) ５８(２.３４) １００ — ５３
ｎｄｈＤ－ｃｃｓＡ∗ ０.０１８ ２ ８７０ １２６(４.３９) ６３(２.２０) １００ — ９７ —
ｐｅｔＡ－ｐｓｂＪ∗ ０.０１９ ２ ２６２ ８７(３.８５) ５２(２.３０) ９９ ９９ — ９７
ｔｒｎＬ ＵＡＧ －ｒｐｌ３２－ｎｄｈＦ∗ ０.０１９ ５ ４５５ ２０３(３.７２) １１０(２.０２) １００ １００ ９８ １００
ｔｒｎＫ ＵＵＵ －ｒｐｓ１６∗ ０.０３４ ４ ９５２ ３１３(６.３２) １４５(２.９３) １００ １００ １００ １００
ｔｒｎＳ ＧＣＵ －ｔｒｎＧ ＵＣＣ ∗ ０.０２１ １ ９８１ １１４(５.７５) ３４(１.７２) １００ ９７ ９７ １００
ｙｃｆ１∗ ０.０１７ ５ ７３０ ２１３(３.７２) １０８(１.８８) １００ １００ １００ １００
注: ∗标注的片段为本研究检测得到的高变区ꎮ 下同ꎮ
Ｎｏｔｅ: Ｔｈｅ ｈｉｇｈｌｙ ｖａｒｉａｂｌｅ ｒｅｇｉｏｎｓ ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ ｄｅｔｅｃｔｅｄ ａｒｅ ｍａｒｋｅｄ ｂｙ ∗. Ｔｈｅ ｓａｍｅ ｂｅｌｏｗ.

表 ２ 锦葵亚科常见的质体 ＤＮＡ 分子片段和高变区的矩阵信息及系统发育分辨率
Ｔａｂｌｅ ２ Ｔｈｅ ｍａｔｒｉｘ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｃｏｍｍｏｎｌｙ ｕｓｅｄ ｐｌａｓｔｉｄ ＤＮＡ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
ｆｒａｇｍｅｎｔｓ ａｎｄ ｈｉｇｈｌｙ ｖａｒｉａｂｌｅ ｒｅｇｉｏｎｓ ｉｎ Ｍａｌｖｏｉｄｅａｅ
变异位点 有效位点 主要分支支持率
矩阵长度 数量 (占比) 数量 (占比) Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｏｆ ｍａｊｏｒ ｃｌａｄｅｓ
序列 π 值 Ｍａｔｒｉｘ Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ
Ｓｅｑｕｅｎｃｅ π ｖａｌｕｅ ｌｅｎｇｔｈ ｖａｒｉａｂｌｅ ｓｉｔｅｓ ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ ｓｉｔｅｓ
(ｂｐ) (ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅꎬ (ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅꎬ 木槿族 锦葵族 棉族
％) ％) Ｈｉｂｉｓｃｅａｅ Ｍａｌｖｅａｅ Ｇｏｓｓｙｐｉｅａｅ
ａｔｐＢ ０.０２４ １ ５３１ １７６(１１.５０) １２４(８.１０) ８２ ９７ １００
ｍａｔＫ ０.０３６ １ ６３６ ４０９(２５.００) ２７６(１６.８７) １００ １００ １００
ｎｄｈＦ∗ ０.０４０ ２ ２６５ ４２２(１８.６３) ２９９(１３.２０) １００ ９５ １００
ｒｂｃＬ ０.０２０ １ ４９５ ２１０(１４.０５) １６０(１０.７０) １００ １００ ９６
ｔｒｎＨ ＧＵＧ －ｐｓｂＡ ０.０２０ ２ ４５４ １１０(４.４８) ８４(３.４２) ７３ ７３ １００
ｔｒｎＬ ＵＡＡ －ｔｒｎＦ ＧＡＡ ０.０２５ １ ８２８ １６４(８.９７) １０７(５.８５) １００ １００ １００
ａｔｐＢ－ｒｂｃＬ∗ ０.０３９ ５ ２６３ ５２５(９.９８) ３８１(７.２４) １００ １００ １００
ｎｄｈＤ－ｃｃｓＡ∗ ０.０３８ ３ １０８ ５００(１６.０９) ３７７(１２.１３) １００ １００ １００
ｐｅｔＡ－ｐｓｂＪ∗ ０.０３９ ３ １７１ ３０６(９.６５) ２１４(６.７５) １００ １００ １００
ｒｐｌ３６－ｒｐｓ８∗ ０.０３７ １ １４０ ２２５(１９.７４) １５２(１３.３３) ９９ １００ １００
ｔｒｎＳ ＧＣＵ －ｔｒｎＧ ＵＣＣ ∗ ０.０３８ ３ ２１１ ２８７(８.９４) ２００(６.２３) １００ １００ １００
ｔｒｎＫ ＵＵＵ / ｍａｔＫ∗ ０.０３６ ３ １９０ ６２０(１９.４４) ４２２(１３.２３) １００ １００ １００
ｙｃｆ１∗ ０.０４８ ６ ４３３ １ ５８２(２４.５９) １ １２８(１７.５３) １００ １００ １００