Page 112 - 《广西植物》2025年第12期
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２ ２ ５ ４ 广 西 植 物 ４５ 卷
ＬＩ Ｊꎬ ＹＥ ＧＹꎬ ＬＩＵ ＨＬꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０. Ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ＴＩＬＬＩＣＨ Ｍꎬ ＬＥＨＷＡＲＫ Ｐꎬ ＰＥＬＬＩＺＺＥＲ Ｔꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７.
ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｔｈｒｅｅ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｓｐｅｃｉｅｓꎬ Ａｂｅｌｍｏｓｃｈｕｓ ｍｏｓｃｈａｔｕｓꎬ ＧｅＳｅｑ — ｖｅｒｓａｔｉｌｅ ａｎｄ ａｃｃｕｒａｔｅ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｏｆ ｏｒｇａｎｅｌｌｅ
Ａ. ｍａｎｉｈｏｔ ａｎｄ Ａ. ｓａｇｉｔｔｉｆｏｌｉｕｓ: Ｇｅｎｏｍｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓꎬ ｇｅｎｏｍｅｓ [ Ｊ ]. Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ ４５(Ｗ１):
ｍｕｔａｔｉｏｎａｌ ｈｏｔｓｐｏｔｓꎬ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｉｎ Ｗ６－Ｗ１１.
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ｉｎｓｉｇｈｔｓ ｉｎｔｏ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｏｆ ａｌｌ ｆｌｏｗｅｒｉｎｇ ｐｌａｎｔ ｆａｍｉｌｉｅｓ Ｂｉｏｇｅｏｇｒａｐｈｙ ｏｆ Ｐｌａｎｔｓꎬ １３(２): １７７－３９４.
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ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｏｍｅ￣ｓｃａｌｅ ｄａｔａ ｔｏ ｒｅｓｏｌｖｅ ｅｎｉｇｍａｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｐｌａｓｔｏｍｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ ｈｙｐｅｒ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｐｏａｃｅａｅ [ Ｊ].
ａｍｏｎｇ ｂａｓａｌ ａｎｇｉｏｓｐｅｒｍｓ [Ｊ]. Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ６１(２): ３２８－３４４.
Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ ｏｆ Ａｍｅｒｉｃａꎬ ＷＡＮＧ ＪＨꎬ ＭＯＯＲＥ ＭＪꎬ ＷＡＮＧ Ｈꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｐｌａｓｔｏｍｅ
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ＮＹＦＦＥＬＥＲ Ｒꎬ ＢＡＹＥＲ Ｃꎬ ＡＬＶＥＲＳＯＮ ＷＳꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００５. ｓｕｂｆａｍｉｌｉｅｓ [Ｊ]. Ｇｅｎｅꎬ ７６５: １４５１０３.
Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｍａｌｖａｄｅｎｄｒｉｎａ ｃｌａｄｅ (Ｍａｌｖａｃｅａｅ ＷＡＮＧ ＹＨꎬ ２０１７. Ｐｌａｓｔｉｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ｏｆ Ｆａｂａｃｅａｅ [ Ｄ].
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ｅｘａｍｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ Ｓｉｄａ ｆａｌｌａｘ ｗｉｔｈｉｎ ｔｈｅ Ｈａｗａｉｉａｎ Ｉｓｌａｎｄｓ ａｎｄ Ｐｅｌａｒｇｏｎｉｕｍ ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｎｅｗ Ｐｈｙｔｏｌｏｇｉｓｔꎬ ２１４(２):
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ｐｒｏｐｏｓｅｄ ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒａｌ ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ ｆｏｒ ａ ｌａｒｇｅ ａｎｄ ｗｅｌｌ ｋｎｏｗｎ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｖｅ ｖｉｓｕａｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｄｅ ｎｏｖｏ ｇｅｎｏｍｅ ａｓｓｅｍｂｌｉｅｓ
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ｏｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ [ Ｊ ]. Ｐｌａｎｔ Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ａｎｄ ｉｎ Ｐｏａｌｅｓ [Ｊ]. ＢＭＣ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ ２２(１): ９７.
Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ２７１: １０１－１２２. ＷＵ ＭＳꎬ ＨＥ Ｌꎬ ＭＡ ＧＹꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ
ＲＩＣＨＡＲＤＳＯＮ ＪＥꎬ ＷＨＩＴＬＯＣＫ ＢＡꎬ ＭＥＥＲＯＷ ＡＷꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｄｉｐｌｏｄｉｓｃｕｓ ｔｒｉｃｈｏｓｐｅｒｍｕｓ ａｎｄ
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Ｔｈｅｏｂｒｏｍａ ａｎｄ Ｍａｌｖａｃｅａｅ [ Ｊ]. Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ ｉｎ Ｅｃｏｌｏｇｙ ａｎｄ [Ｊ]. ＢＭＣ Ｇｅｎｏｍｉｃｓꎬ ２４(１): ５７１.
Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ３: １２０. ＷＵ Ｙꎬ ＬＩＵ Ｆꎬ ＹＡＮＧ ＤＧꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ
ＲＯＮＱＵＩＳＴ Ｆꎬ ＴＥＳＬＥＮＫＯ Ｍꎬ ＶＡＮ ＤＥＲ ＭＡＲＫ Ｐꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｉｃｓ ｏｆ Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍ ｓｐｅｃｉｅｓ: ｉｎｓｉｇｈｔｓ ｉｎｔｏ
２０１２. ＭｒＢａｙｅｓ ３.２: Ｅｆｆｉｃｉｅｎｔ Ｂａｙｅｓｉａｎ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ ｒｅｐｅａｔ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ [Ｊ]. Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ ｉｎ
ａｎｄ ｍｏｄｅｌ ｃｈｏｉｃｅ ａｃｒｏｓｓ ａ ｌａｒｇｅ ｍｏｄｅｌ ｓｐａｃｅ [Ｊ]. Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃ Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉｅｎｃｅꎬ ９: ３７６.
Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ ６１(３): ５３９－５４２. ＸＩＥ Ｊꎬ ＣＨＥＮ Ｙꎬ ＣＡＩ Ｇꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｔｒｅｅ Ｖｉｓｕａｌｉｚａｔｉｏｎ Ｂｙ
ＲＯＺＡＳ Ｊꎬ ＦＥＲＲＥＲ￣ＭＡＴＡ Ａꎬ ＳÁＮＣＨＥＺ￣ＤＥＬＢＡＲＲＩＯ ＪＣꎬ Ｏｎｅ Ｔａｂｌｅ ( ｔｖＢＯＴ): ａ ｗｅｂ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｆｏｒ ｖｉｓｕａｌｉｚｉｎｇꎬ
ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. ＤｎａＳＰ ６: ＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ａｎａｌｙｓｉｓ ｍｏｄｉｆｙｉｎｇ ａｎｄ ａｎｎｏｔａｔｉｎｇ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅｓ [ Ｊ]. Ｎｕｃｌｅｉｃ
ｏｆ ｌａｒｇｅ ｄａｔａ ｓｅｔｓ [ Ｊ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ ５１(Ｗ１): Ｗ５８７－Ｗ５９２.
３４(１２): ３２９９－３３０２. ＹＥＮＧＫＨＯＭ Ｓꎬ ＵＤＤＩＮ Ａꎬ ＣＨＡＫＲＡＢＯＲＴＹ Ｓꎬ ２０１９.
ＳＣＨＬＵＴＥＲ Ｄꎬ ＰＲＩＣＥ Ｔꎬ ＭＯＯＥＲＳ ＡØꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ １９９７. Ｄｅｃｉｐｈｅｒｉｎｇ ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｐａｔｔｅｒｎｓ ａｎｄ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｆｏｒｃｅｓ ｉｎ
Ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ ｏｆ ａｎｃｅｓｔｏｒ ｓｔａｔｅｓ ｉｎ ａｄａｐｔｉｖｅ ｒａｄｉａｔｉｏｎ [ Ｊ]. ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｅｓ ｏｆ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ａｓｓａｍｉｃａ ａｎｄ
Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ５１(６): １６９９－１７１１. Ｃａｍｅｌｌｉａ ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｖａｒ. ｓｉｎｅｎｓｉｓ ｉｎ ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｔｏ Ｃａｍｅｌｌｉａ
ＳＴＡＭＡＴＡＫＩＳ Ａꎬ ２０１４. ＲＡｘＭＬ ｖｅｒｓｉｏｎ ８: Ａ ｔｏｏｌ ｆｏｒ ｐｕｂｉｃｏｓｔａ [Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｉｎｔｅｇｒａｔｉｖｅ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅꎬ １８(１２):
ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ｐｏｓｔ￣ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｌａｒｇｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｅｓ ２７７１－２７８５.
[Ｊ]. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ ３０(９): １３１２－１３１３. ＺＨＥＮＧ ＸＭꎬ ＪＵＮＲＵＩ Ｗꎬ ＬＩ Ｆꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. Ｉｎｆｅｒｒｉｎｇ ｔｈｅ
ＳＴＥＶＥＮＳ ＰＦꎬ ２００１. Ａｎｇｉｏｓｐｅｒｍ ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｗｅｂｓｉｔｅ (Ｖｅｒｓｉｏｎ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｉｚｅ ｂｙ
１４) [ＥＢ/ ＯＬ]. (２０１７－０７) (ａｎｄ ｍｏｒｅ ｏｒ ｌｅｓｓ ｃｏｎｔｉｎｕｏｕｓｌｙ ｃｏｍｐａｒｉｎｇ ｗｈｏｌｅ￣ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｉｎ ｓｅｅｄ ｐｌａｎｔｓ
ｕｐｄａｔｅｄ ｓｉｎｃｅ) [２０２５ － ０４ － ０１]. ｈｔｔｐ:/ / ｗｗｗ. ｍｏｂｏｔ. ｏｒｇ/ [Ｊ]. Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｒｅｐｏｒｔｓꎬ ７(１): １５５５.
ＭＯＢＯＴ/ Ｒｅｓｅａｒｃｈ/ ＡＰｗｅｂ/ . ＺＨＵ ＡＤꎬ ＧＵＯ ＷＨꎬ ＧＵＰＴＡ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６. Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ
ＴＡＴＥ ＪＡꎬ ＦＵＥＲＴＥＳ ＡＧＵＩＬＡＲ Ｊꎬ ＷＡＮＧＳＴＡＦＦ ＳＪꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ｄｙｎａｍｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｉｄ ｉｎｖｅｒｔｅｄ ｒｅｐｅａｔ: ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ
２００５. Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｗｉｔｈｉｎ ｔｈｅ ｔｒｉｂｅ Ｍａｌｖｅａｅ ｅｘｐａｎｓｉｏｎꎬ ｃｏｎｔｒａｃｔｉｏｎꎬ ａｎｄ ｌｏｓｓ ｏｎ ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎ ｒａｔｅｓ
(Ｍａｌｖａｃｅａｅꎬ ｓｕｂｆａｍｉｌｙ Ｍａｌｖｏｉｄｅａｅ) ａｓ ｉｎｆｅｒｒｅｄ ｆｒｏｍ ＩＴＳ [Ｊ]. Ｎｅｗ Ｐｈｙｔｏｌｏｇｉｓｔꎬ ２０９(４): １７４７－１７５６.
ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａ [ Ｊ]. Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｏｔａｎｙꎬ ９２(４):
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