Page 152 - 《广西植物》2025年第4期
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7 6 6 广 西 植 物 45 卷
有扩增带记为 1ꎬ无带记为 0ꎮ 利用软件 Popgen 32 及自己合成的 38 对引物中分别筛选出 9 对和 8 对
计算等位基因数(number of allelesꎬN )、有效等位基 用于全部材料的 SSR 扩增ꎬ这 17 对引物共扩增出
a
因数( number of effective allelesꎬN )、观察杂合度 98 条带ꎬ每条 EST 引物扩增出条带数为 2 ~ 12ꎬ大
e
(observed heterozygosityꎬH )、期望杂合度(expected 多数引物扩增条带数为 3 ~ 9ꎬ每条引物平均扩增
o
heterozygosityꎬH )和 Shannon’ s 指数(I)ꎻ利用软件 出 5.76 条ꎮ 有效等位基因数( N ) 为 1.16 ~ 7.64ꎬ
e e
Power Marker v3. 25 计 算 多 态 信 息 含 量 平均值为 3.22ꎻ 观察杂合度(H )为 0.04 ~ 0.54ꎬ平
o
(polymorphism information contentꎬPIC)ꎻ 利用软件 均值为 0.28ꎻ期望杂合度(H ) 为 0.58 ~ 0.92ꎬ平均
e
NTSYSpc2.10e 进行 UPGMA 聚类分析ꎬ建立亲缘关 值为 0.77ꎻShannon’s 指数( I) 为 1.38 ~ 2.65ꎬ平均
系图ꎻ采用 Excel 进行嫁接成活率的统计ꎮ 值为 2.14ꎻ多态信息含量(PIC)为0.62 ~ 0.92ꎬ平均
值为 0.78( 表 3)ꎮ 结果表明ꎬ钟花樱及其近缘种
2 结果分析 遗传多样性较为丰富ꎬ其中图 2 为引物 PC10 在钟
花樱及其近缘种的 EST ̄SSR 扩增图ꎮ
2.1 DNA 提取质量和最佳退火温度的筛选 2.3 聚类分析
16 个样品 OD / OD 比值均在 1.6 至 1.8 之 根据 SSR 扩增结果ꎬ利用 NTSYSpc2.10e 软件
260 280
间ꎬ说明提取的 DNA 质量较好ꎬ符合后续实验要 进行 Jaccard 相似性系数分析ꎬ计算出它们之间的
求ꎮ 在梯度 PCR 仪器上对所有引物的最佳退火温 遗传相似系数( genetic similarity coefficientꎬC )ꎬ
GS
其范围为0.653 1 ~ 0.918 4ꎬ具体见表 4ꎬ其中钟花
度进行筛选ꎬ筛选范围为 48 ~ 64 ℃ ꎬ以提高 PCR
樱和高盆樱遗传相似系数最大( C = 0.918 4)ꎬ武
扩增效率ꎬ有利于得到清晰的聚丙烯凝胶电泳图ꎬ GS
减少实验误差ꎬ其中图 1 为部分合成引物最佳退 夷红樱和野生早樱遗传相似系数最小(0.653 1)ꎮ
由表 4 的遗传相似系数可知ꎬ钟花樱与高盆樱亲
火温度的筛选ꎮ
缘关系最近( C = 0. 918 4)ꎬ其 次 与 崖 樱 ( C =
GS GS
0.898 0) 亲缘关系也很近ꎬ但与野生早樱( C =
GS
0.775 5)、沼生矮樱(C = 0.785 7)、黑樱桃( C =
GS GS
0.795 9)、尾叶樱( C = 0.795 9) 等亲缘关系相对
GS
较远ꎻ武夷红樱与高盆樱( C = 0.857 1)、钟花樱
GS
(C = 0.816 3)、迎春樱( C = 0.816 3) 等亲缘关
GS GS
系最近ꎬ 而 与 野 生 早 樱 ( C = 0. 653 1)、 黑 樱 桃
GS
(C = 0.673 5)亲缘关系相对较远ꎮ
GS
通过遗传相似系数进行 UPGMA 聚类分析ꎬ构
建了 16 种樱属植物的聚类关系图(图 3)ꎮ 由图 3
可知ꎬ基本体现了 16 种樱属植物彼此之间亲缘关
系的远近ꎮ 除了野生早樱和黑樱桃外ꎬ其余 14 份
植物可聚为一大类( 图 3:Ⅰ)ꎬ其中钟花樱与高盆
樱聚在一起ꎬ崖樱和雪落樱聚在一起ꎬ山樱和迎春
M 代表 Markꎬ下同ꎻ PC1、PC3、PC6 和 PC8 分别代表不同
樱聚在一起ꎬ郁李和毛樱桃聚在一起ꎬ散毛樱和浙
引物ꎮ
闽樱聚在一起ꎬ尾叶樱和沼生矮樱聚在一起ꎬ武夷
M represents Markꎬ the same belowꎻ PC1ꎬ PC3ꎬ PC6 and PC8
represent different primersꎬ respectively. 红樱和华中樱聚在一起ꎻ野生早樱和黑樱桃与其
图 1 部分合成引物最佳退火温度的筛选 余樱属植物亲缘关系较远ꎬ单独聚类ꎮ
Fig. 1 Selection of optimal annealing temperature 2.4 嫁接成活率分析
for partially synthesized primers 通过嫁接实验可知ꎬ华中樱作为砧木嫁接钟
花樱成活率最高ꎬ达 95%ꎬ野生早樱作为砧木嫁接
2.2 EST ̄SSR 引物的遗传多样分析 钟花樱成活率最低ꎬ为 40%ꎮ 此外ꎬ山樱作为砧木
从 Yoshiaki 等(2009) 开发出的 12 对引物以 嫁接钟花樱成活率为 80%ꎬ浙闽樱作为砧木嫁接

