Page 117 - 《广西植物》2025年第5期
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５ 期 彭晓梅等: 垂穗披碱草 ＴＣＰ 转录因子家族鉴定及激素响应模式分析 ９ ２ １
图 １ 全长转录本完整性评估
Ｆｉｇ. １ Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ ｃｏｍｐｌｅｔｅｎｅｓｓ
Ｎｒ 数 据 库 注 释 的 物 种 中 ( 图 ３: Ａ )ꎬ 节 节 麦 统进化树中呈现明显的聚类现象ꎻ根据进化树分
(Ａｅｇｉｌｏｐｓ ｔａｕｓｃｈｉｉ)、圆锥小麦(Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ｔｕｒｇｉｄｕｍ)和 支情况ꎬ垂穗披碱草 ２６ 个 ＴＣＰ 家族成员被划分为
大麦(Ｈｏｒｄｅｕｍ ｖｕｌｇａｒｅ)比对的同源序列占比最高ꎬ Ｃｌａｓｓ Ⅰ亚族和 Ｃｌａｓｓ Ⅱ亚族ꎬ其中 Ｃｌａｓｓ Ⅱ亚族可
分别 为 ３０. ３６％ ( ２３ ７２９)、 ２９. ３５％ ( ２２ ９４２ ) 和 细分为 Ｃｌａｓｓ Ⅱ￣ａ( ＣＩＮ) 和 Ｃｌａｓｓ Ⅱ￣ｂ( ＣＹＣ / ＴＢ１) ２
１６.２９％(１２ ７３０)ꎮ 在 ＣＯＧ 注释的 ２３ ３２３ 条转录 个亚族ꎻ在 ３ 个亚族中ꎬ有 １４ 个 ＥｎＴＣＰｓ 家族成员
本中 ( 图 ３: Ｂ)ꎬ 信 号 转 导 机 制 所 占 比 例 最 高 分布在 Ｃｌａｓｓ Ⅰ( ＰＣＦ) 亚族ꎬ１１ 个 ＥｎＴＣＰｓ 家族成
(１１.６７％ꎬ２ ６８４)ꎬ其次是主要功能预测( ２ ６７０ꎬ 员分布在 Ｃｌａｓｓ Ⅱ￣ａ(ＣＩＮ)亚族ꎬ１ 个 ＥｎＴＣＰ 家族成
１１. ６１％) 和 碳 水 化 合 物 转 运 代 谢 ( ２ ４７８ꎬ 员分布在 Ｃｌａｓｓ Ⅱ￣ｂ(ＣＹＣ / ＴＢ１)亚族ꎮ
１０.７８％)ꎮ ２.６ ＥｎＴＣＰｓ 蛋白保守基序分析
２.４ ＴＣＰ 转录因子家族的筛选及理化性质分析 垂穗披碱草 ＴＣＰ 蛋白的保守基序分析结果
基于垂穗披碱草全长转录本 ＣＤＳ 预测获得对 (图 ５:ＡꎬＢ)显示ꎬ位于同一亚族的大部分 ＥｎＴＣＰｓ
应的氨基酸序列文件ꎬ从中筛选到 ２７ 条具有 ＴＣＰ 家族成员具有相似的保守基序ꎬ与系统进化树的
结构域的序列ꎬ经过数据库比对后去除冗余和注 分支情况相吻合ꎮ ２６ 个 ＥｎＴＣＰｓ 家族成员都具有
释不完整的序列ꎬ保留下来的 ２６ 条序列即为垂穗 Ｍｏｔｉｆ １ꎬ对保守基序 Ｍｏｔｉｆ １ 的蛋白序列进行分析
披碱草 ＴＣＰ 转录因子家族成员ꎮ 对 ２６ 个垂穗披 (图 ５:Ｃ)ꎬ发现其具有 ｂＨＬＨ 碱性二级结构域ꎬ又
碱草 ＴＣＰ 蛋白序列的理化性质进行分析ꎬ由表 ３ 称为“ＴＣＰ 结构域”ꎬ该结构域参与蛋白互作及核
可 知ꎬ ２６ 个 ＴＣＰ 转 录 因 子 蛋 白 的 分 子 量 为 定位等过程ꎮ １４ 个 Ｃｌａｓｓ Ｉ(ＰＣＦ) 亚族成员特异性
２０ ６５０.２０ ~ ６０ ６０５.５７ Ｄａꎻ编码蛋白的氨基酸数量 含有 Ｍｏｔｉｆ ５ꎬ９ 个 Ｃｌａｓｓ Ⅱ￣ａ(ＣＩＮ)亚族成员特异性
最多的是 Ｅｎ４２６９０(５７５ ａａ)ꎬ最少的是 Ｅｎ１０８９５０ 含有 Ｍｏｔｉｆ ４ꎬＣｌａｓｓ Ⅱ￣ｂ( ＣＹＣ / ＴＢ１) 亚族除了含有
(１８６ ａａ)ꎻ等电点为 ５.６５ ~ １２.２５ꎮ 亚细胞定位预 保守的 Ｍｏｔｉｆ １ 外ꎬ与其他蛋白之间的保守结构差
测结果显示ꎬ２６ 个 ＴＣＰ 蛋白均位于细胞核中ꎮ 异较大ꎮ 因此我们推测ꎬ不同亚族 ＥｎＴＣＰｓ 家族成
２.５ ＥｎＴＣＰｓ 系统进化分析 员之间特异性保守基序的差异ꎬ导致它们调控不
将垂穗披碱草 ２６ 个 ＥｎＴＣＰｓ 与双子叶模式植 同的生长发育过程ꎮ
物拟南芥的 ２４ 个 ＡｔＴＣＰｓ 和单子叶模式植物水稻 ２.７ 不同激素处理下的 ＥｎＴＣＰｓ 表达模式分析
的 ２２ 个 ＯｓＴＣＰｓ 共同构建系统进化树ꎮ 系统进化 将不同外源激素处理后不同时间点取样得到
分析(图 ４) 表明ꎬＥｎＴＣＰｓ、ＡｔＴＣＰｓ 和 ＯｓＴＣＰｓ 在系 的 ２７ 个垂穗披碱草样品在 Ｉｌｌｕｍｉｎａ 测序平台进行
