Page 51 - 《广西植物》2025年第5期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｍａｙ ２０２５ꎬ ４５(５): ８５５－８７１
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２４１２００６
熊霜ꎬ 周富琴ꎬ 王仕东ꎬ 等ꎬ ２０２５. 三脉水丝梨叶绿体基因组特征及系统发育分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４５(５): ８５５－８７１.
ＸＩＯＮＧ Ｓꎬ ＺＨＯＵ ＦＱꎬ ＷＡＮＧ ＳＤꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２５. Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｓｙｃｏｐｓｉｓ
ｔｒｉｐｌｉｎｅｒｖｉａ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４５(５): ８５５－８７１.
三脉水丝梨叶绿体基因组特征及系统发育分析
熊 霜ꎬ 周富琴ꎬ 王仕东ꎬ 李 锐ꎬ 王树宝ꎬ 黄 媛 ∗
( 云南师范大学 生命科学学院ꎬ 昆明 ６５０５００ )
摘 要: 三脉水丝梨(Ｓｙｃｏｐｓｉｓ ｔｒｉｐｌｉｎｅｒｖｉａ)是金缕梅科(Ｈａｍａｍｅｌｉｄａｃｅａｅ)水丝梨属(Ｓｙｃｏｐｓｉｓ)的一种常绿灌木ꎮ
水丝梨属的系统发育地位仍存在争议且与假蚊母属(Ｄｉｓｔｙｌｉｏｐｓｉｓ)、蚊母树属(Ｄｉｓｔｙｌｉｕｍ)等近缘属之间的亲缘
关系尚不明确ꎮ 该研究对三脉水丝梨的叶绿体基因组进行测序与组装ꎬ结合公共数据库中金缕梅科其他物种
的叶绿体基因组数据ꎬ开展比较基因组分析和叶绿体基因组系统发育分析ꎮ 结果表明:(１)三脉水丝梨基因组
大小为 １５９ ３７５ ｂｐꎬ共编码 １３３ 个基因ꎬ包括 ８ 个 ｒＲＮＡ 基因、３７ 个 ｔＲＮＡ 基因、８７ 个蛋白编码基因和 １ 个假基
因ꎮ (２)共检测到 ３３ 个散在重复序列、３９ 个串联重复序列和 ８２ 个简单重复序列(ＳＳＲｓ)ꎮ (３)密码子偏好以
Ａ/ Ｕ 结尾ꎬ共包含 ９ 个最优密码子且密码子偏好主要受自然选择的影响ꎮ (４)与近缘种相比ꎬ三脉水丝梨的叶
绿体基因组整体较为保守ꎬ从水丝梨属中筛选到的 １５ 个高变异区域具有潜在用于分子鉴定的价值ꎮ (５)系统
发育分析显示ꎬ金缕梅科为单系类群ꎬ金缕梅属(Ｈａｍａｍｅｌｉｓ)、白缕梅属(Ｐａｒｒｏｔｉｏｐｓｉｓ)、水丝梨属、假蚊母属、波
斯铁木属(Ｐａｒｒｏｔｉａ)和蚊母树属形成了一个强力支持的单系分支ꎬ６ 个属之间具有较近的亲缘关系ꎬ其中三脉
水丝梨与该分支中的其他类群互为姐妹群ꎬ而水丝梨属、波斯铁木属、假蚊母属和蚊母树属均非单系ꎮ 该研究
结果为金缕梅科的系统发育研究提供了重要的基础数据和参考ꎮ
关键词: 三脉水丝梨ꎬ 叶绿体基因组ꎬ 水丝梨属ꎬ 金缕梅科ꎬ 基因组系统学
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２５)０５￣０８５５￣１７
Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ
ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｓｙｃｏｐｓｉｓ ｔｒｉｐｌｉｎｅｒｖｉａ
∗
ＸＩＯＮＧ Ｓｈｕａｎｇꎬ ＺＨＯＵ Ｆｕｑｉｎꎬ ＷＡＮＧ Ｓｈｉｄｏｎｇꎬ ＬＩ Ｒｕｉꎬ ＷＡＮＧ Ｓｈｕｂａｏꎬ ＨＵＡＮＧ Ｙｕａｎ
( Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｙｕｎｎａｎ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｋｕｎｍｉｎｇ ６５０５００ꎬ Ｃｈｉｎａ )
Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｓｙｃｏｐｓｉｓ ｔｒｉｐｌｉｎｅｒｖｉａ ｉｓ ａｎ ｅｖｅｒｇｒｅｅｎ ｓｈｒｕｂ ｉｎ ｔｈｅ ｇｅｎｕｓ Ｓｙｃｏｐｓｉｓ (Ｈａｍａｍｅｌｉｄａｃｅａｅ). Ｔｈｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｐｏｓｉｔｉｏｎ
ｏｆ Ｓｙｃｏｐｓｉｓ ｈａｓ ｂｅｅｎ ａ ｓｕｂｊｅｃｔ ｏｆ ｄｅｂａｔｅꎬ ａｎｄ ｉｔｓ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｗｉｔｈ ｃｌｏｓｅｌｙ ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅｒａ ｓｕｃｈ ａｓ Ｄｉｓｔｙｌｉｏｐｓｉｓ
ａｎｄ Ｄｉｓｔｙｌｉｕｍ ｒｅｍａｉｎ ｕｎｃｌｅａｒ. Ｈｅｒｅ ｗｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｄ ａｎｄ ａｓｓｅｍｂｌｅｄ ｉｔｓ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ａｎｄ ｃｏｎｄｕｃｔｅｄ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ
ｇｅｎｏｍｉｃ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｏｍｉｃ ａｎａｌｙｓｅｓ ｔｏｇｅｔｈｅｒ ｗｉｔｈ ｐｕｂｌｉｃｌｙ ａｖａｉｌａｂｌｅ Ｈａｍａｍｅｌｉｄａｃｅａｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ. Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ
ｗｅｒｅ ａｓ ｆｏｌｌｏｗｓ: (１) Ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｓ. ｔｒｉｐｌｉｎｅｒｖｉａ ｗａｓ １５９ ３７５ ｂｐ ｉｎ ｌｅｎｇｔｈ ａｎｄ ｅｎｃｏｄｅｄ １３３ ｇｅｎｅｓꎬ
收稿日期: ２０２５－０１－１４ 接受日期: ２０２５－０２－２１
基金项目: 国家自然科学基金(３２３６００６５)ꎮ
第一作者: 熊霜(１９９９—)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为植物进化生物学ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｘｓ１８８２０２２＠ １６３.ｃｏｍꎮ
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通信作者: 黄媛ꎬ博士ꎬ教授ꎬ主要从事植物系统与进化研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｈｕａｎｇｙｕａｎｙｎｎｕ＠ ａｌｉｙｕｎ.ｃｏｍꎮ
