Page 36 - 《广西植物》2020年第7期
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9 3 2                                 广  西  植  物                                         40 卷
                            表 4  大豆线粒体编码基因的相对同义密码子使用度
                    Table 4  Relative synonymous codon usage of mitochondrial genes in Glycine

                                          栽培大豆 G. max                        野生大豆 G. soja
        氨基酸       密码子
      Amino acid  Codon
                                   基因组       高表达组       低表达组         基因组       高表达组       低表达组
                                  Genome   High experssion Low experssion  Genome  High experssion Low experssion
        Phe / F   TTT∗             1.086      1.103       1.000      1.128      1.000       0.889
                  TTC              0.914      0.897       1.000      0.872      1.000       1.111
        Leu / L   TTA∗             1.248      1.552       1.100      1.230      1.367       0.804
                  TTG              0.996      1.007       1.050      1.050      1.063       1.237
                  CTT∗             1.362      1.385       1.300      1.398      1.557       1.361
                  CTC              0.804      0.671       1.150      0.792      0.570       1.237
                  CTA              0.936      0.671       0.800      0.888      0.835       0.804
                  CTG              0.654      0.713       0.600      0.642      0.608       0.557
         Ile / I  ATT∗             1.254      1.514       1.017      1.221      1.387       1.109
                  ATC              0.885      0.943       1.220      0.924      0.903       1.043
                  ATA              0.861      0.543       0.763      0.855      0.710       0.848
        Val/ V    GTT∗             1.208      1.278       1.254      1.156      1.151       1.018
                  GTC              0.852      0.722       0.836      0.836      0.822       1.309
                  GTA∗             1.024      1.333       1.075      1.000      1.370       1.018
                  GTG              0.920      0.667       0.836      1.008      0.658       0.655
        Ser/ S    TCT              1.368      1.477       1.455      1.338      1.422       1.620
                  TCC∗             1.140      1.385       0.864      1.140      1.378       1.051
                  TCA              1.134      1.200       1.227      1.104      1.067       1.226
                  TCG              0.774      0.554       0.864      0.840      0.622       0.745
                  AGT              0.900      0.738       0.727      0.900      0.978       0.657
                  AGC              0.684      0.646       0.864      0.678      0.533       0.701
        Pro / P   CCT∗             1.452      1.928       1.014      1.448      2.089      1.0625
                  CCC              0.908      0.530       0.732      0.888      0.578       1.000
                  CCA              1.012      1.012       1.352      1.024      0.889       1.125
                  CCG              0.628      0.530       0.901      0.640      0.444      0.8125
        Thr/ T    ACT∗             1.348      1.556       1.120      1.300      1.449       1.302
                  ACC              1.072      0.500       1.360      1.048      0.464       1.302
                  ACA∗             1.060      1.278       1.040      1.096      1.449       1.116
                  ACG              0.520      0.667       0.480      0.556      0.638       0.279
        Ala / A   GCT∗             1.504      2.025       1.500      1.456      2.085       1.222
                  GCC              0.996      0.642       0.714      1.040      0.563       0.889
                  GCA              0.928      0.790       0.929      0.936      0.958       0.778
                  GCG              0.572      0.543       0.857      0.568      0.394       1.111
        Tyr/ Y    TAT              1.440      1.500       1.600      1.426      1.405       1.333
                  TAC              0.560      0.500       0.400      0.574      0.595       0.667
        His/ H    CAT∗             1.348      1.257       1.100      1.324      1.257       1.364
                  CAC              0.652      0.743       0.900      0.676      0.743       0.636
        Gln / Q   CAA∗             1.244      1.421       1.059      1.288      1.318       1.091
                  CAG              0.756      0.579       0.941      0.712      0.682       0.909
        Asn / N   AAT∗             1.286      1.375       0.950      1.276      1.235       0.971
                  AAC              0.714      0.625       1.050      0.724      0.765       1.029
        Lys/ K    AAA∗             1.168      1.127       0.903      1.168      1.228       1.148
                  AAG              0.832      0.873       1.097      0.832      0.772       0.852
        Asp / D   GAT∗             1.258      1.389       1.200      1.234      1.450       1.286
                  GAC              0.742      0.611       0.800      0.766      0.550       0.714
        Glu / E   GAA∗             1.314      1.467       1.414      1.278      1.381       1.320
                  GAG              0.686      0.533       0.586      0.722      0.619       0.680
        Cys/ C    TGT∗             1.154      1.043       1.000      1.154      1.412       1.200
                  TGC              0.846      0.957       1.000      0.846      0.588       0.800
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