Page 69 - 《广西植物》2022年第10期
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10 期                   焦贝贝等: 基于 Ks 分布的被子植物演化的时间尺度研究                                       1 6 8 7

                            表 1  研究所用的 44 个被子植物及基因组数据来源
                     Table 1  List of the 44 angiosperms involved and the genome data sources
             物种                目             科         数据来源
            Species           Order        Family      Data source
            无油樟             无油樟目          无油樟科         https: / / ftp. ncbi. nlm. nih. gov / genomes/ all/ GCF / 000 / 471 / 905 /
        Amborella trichopoda  Amborellales  Amborellaceae  GCF_000471905.2_AMTR1.0 /
           蓝星睡莲              睡莲目           睡莲科         https: / / phytozome ̄next.jgi.doe.gov / info / Ncolorata_v1_2
        Nymphaea colorata  Nymphaeales   Nymphaeaceae
            鹅掌楸              木兰目           木兰科         https: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / genome / 45466
        Liriodendron chinense  Magnoliales  Magnoliaceae
             牛樟               樟目            樟科         https: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / genome / 57158
       Cinnamomum kanehirae  Laurales     Lauraceae
          卷毛马兜铃              胡椒目          马兜铃科         https: / / ngdc.cncb.ac.cn / search / ? dbId = gwh&q =
        Aristolochia fimbriata  Piperales  Aristolochiaceae  Aristolochia&page = 1
           柳叶蜡梅               樟目           蜡梅科         https: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / genome / 82066? genome_
      Chimonanthus salicifolius  Laurales  Calycanthaceae  assembly_id = 1651656
             紫萍              泽泻目          天南星科         https: / / data.jgi.doe.gov / refine ̄download / phytozome? organism =
        Spirodela polyrhiza  Alismatales   Araceae     Spolyrhiza&expanded = 290
             水稻              禾本目           禾本科         https: / / phytozome ̄next.jgi.doe.gov / info / Osativa_v7_0
          Oryza sativa       Poales        Poaceae
             菠萝              禾本目           凤梨科         https: / / phytozome ̄next.jgi.doe.gov / info / Acomosus_v3
         Ananas comosus      Poales      Bromeliaceae
             椰子              棕榈目           棕榈科         The genome draft of coconut (Cocos nucifera)
          Cocos nucifera     Arecales     Arecaceae
             油棕              棕榈目           棕榈科         https: / / ftp.ncbi.nlm.nih.gov / genomes/ all/ GCF / 000 / 442 / 705 /
         Elaeis guineensis   Arecales     Arecaceae
           小果野蕉               姜目           芭蕉科         https: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / genome / ? term = HE813975%E2%
         Musa acuminata    Zingiberales   Musaceae     80%93HE813985
           鼓槌石斛             天门冬目            兰科         https: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / genome / 41833
       Dendrobium chrysotoxum  Asparagales  Orchidaceae
             文竹             天门冬目          天门冬科         https: / / datadryad.org / stash / dataset/ doi:10.5061 / dryad.
         Asparagus setaceus  Asparagales  Asparagaceae  1c59zw3rm
            金鱼藻             金鱼藻目          金鱼藻科         https: / / genomevolution.org / CoGe / GenomeInfo.pl? gid = 56569
       Ceratophyllum demersum  Ceratophyllales  Ceratophyllaceae
              莲             山龙眼目            莲科         https: / / ftp. ncbi. nlm. nih. gov / genomes/ all/ GCF / 000 / 365 / 185 /
         Nelumbo nucifera   Proteales    Nelumbonaceae  GCF_000365185.1_Chinese_Lotus_1.1 /
            昆栏树             昆栏树目          昆栏树科         http: / / gigadb.org / dataset/ view / id / 100657 / File_page / 5
      Trochodendron aralioides  Trochodendrales  Trochodendraceae
         洛杉矶耧斗菜              毛茛目           毛茛科         https: / / data.jgi.doe.gov / refine ̄download / phytozome? organism =
         Aquilegia coerulea  Ranunculales  Ranunculaceae  Acoerulea&expanded = 322
            油蜡树              石竹目          油蜡树科         https: / / ngdc.cncb.ac.cn / search / ? dbId = gwh&q =
        Simmondsia chinensis  Caryophyllales  Simmondsiaceae  GWHAASQ00000000
          中华猕猴桃             杜鹃花目          猕猴桃科         ftp: / / www.whiteflygenomics.org / pub / kiwifruit/ A_chinensis/
         Actinidia chinensis  Ericales   Actinidiaceae  Red5 / v1.0 / Red5_genome_v1.0.fa.gz
             杜鹃             杜鹃花目          杜鹃花科         https: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / genome? LinkName = bioproject_
        Rhododendron simsii  Ericales     Ericaceae    genome&from_uid = 588298
            油橄榄              唇形目           木樨科         https: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / genome / ? term = Olea+europaea
          Olea europaea      Lamiales      Oleaceae
           大星牵牛               茄目           旋花科         https: / / datadryad.org / stash / dataset/ doi:10.5061 / dryad.b9m61cg
          Ipomoea trifida   Solanales    Convolvulaceae
           中粒咖啡              龙胆目           茜草科         https: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / genome / ? term = Coffea+canephora
         Coffea canephora   Gentianales   Rubiaceae
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