Page 53 - 《广西植物》2020年第1期
P. 53
1 期 金鑫等: 基于 5 993 个核基因的被子植物系统发育关系研究 4 9
表 1 本研究所用的 89 个植物物种及数据来源
Table 1 List of the 89 plants used in this study and the data source
物种 数据来源类型 缩写 目 数据来源
Species Data source type Abbreviation Order Data source
银杏 Ginkgo biloba Genome GGIBI 裸子植物门 Gymnosperm http: / / gigadb.org / dataset/ 100613
猕猴桃 Actinidia chinensis Genome GACCH 杜鹃花目 Ericales ncbi
无油樟 Amborella trichopoda Genome GAMTR 无油樟目 Amborellales phytozome
菠萝 Ananas comosus Genome GANCO 禾本目 Poales ncbi
深圳拟兰 Apostasia shenzhenica Genome GAPSH 天门冬目 Asparagales ncbi
拟南芥 Arabidopsis thaliana Genome GARTH 十字花目 Brassicales tair
芦笋 Asparagus officinalis Genome GASOF 天门冬目 Asparagales phytozome
甜菜 Beta vulgaris Genome GBEVU 石竹目 Caryophyllales ncbi
胡桃 Juglans regia Genome GJURE 壳斗目 Fagales ncbi
喜树 Camptotheca acuminata Genome GCAAC 山茱萸目 Cornales https: / / datadryad.org / resource /
doi:10.5061 / dryad.nc8qr
番木瓜 Carica papaya Genome GCAPA 十字花目 Brassicales phytozome
长春花 Catharanthus roseus Genome GCARO 龙胆目 Gentianales https: / / datadryad.org / resource /
doi:10.5061 / dryad.hs593
土瓶草 Cephalotus follicularis Genome GCEFO 酢浆草目 Oxalidales ncbi
甜橙 Citrus sinensis Genome GCISI 无患子目 Sapindales phytozome
中粒咖啡 Coffea canephora Genome GCOCA 龙胆目 Gentianales http: / / coffee-genome.org / download
胡萝卜 Daucus carota Genome GDACA 伞形目 Apiales phytozome
龙眼 Dimocarpus longan Genome GDILO 无患子目 Sapindales http: / / gigadb.org / dataset/
view / id / 100276
几内亚薯蓣 Dioscorea rotundata Genome GDIRO 薯蓣目 Dioscoreales http: / / genome-e.ibrc.or.jp / home /
bioinformatics-team / yam
苦荞麦 Fagopyrum tataricum Genome GFATA 石竹目 Caryophyllales http: / / www.mbkbase.org / Pinku1
小果野蕉 Musa acuminata Genome GMUAC 姜目 Zingiberales ncbi
画眉草 Eragrostis tef Genome GERTE 禾本目 Poales https: / / genomevolution.org / CoGe /
GenomeInfo.pl? gid = 22790
巨桉 Eucalyptus grandis Genome GEUGR 桃金娘目 Myrtales phytozome
欧洲白蜡树 Fraxinus excelsior Genome GFREX 唇形目 Lamiales http: / / www.ashgenome.org / dup_annot11
大豆 Glycine max Genome GGLMA 豆目 Fabales phytozome
向日葵 Helianthus annuus Genome GHEAN 菊目 Asterales phytozome
牵牛花 Ipomoea nil Genome GIPNI 茄目 Solanales ncbi
伽蓝 Kalanchoe fedtschenkoi Genome GKAFE 虎耳草目 Saxifragales phytozome
博落回 Macleaya cordata Genome GMACO 毛茛目 Ranunculales ncbi
苦瓜 Momordica charantia Genome GMOCH 葫芦目 Cucurbitales ncbi
中国莲 Nelumbo nucifera Genome GNENU 山龙眼目 Proteales ncbi
海枣 Phoenix dactylifera Genome GPHDA 棕榈目 Arecales ncbi
毛果杨 Populus trichocarpa Genome GPOTR 金虎尾目 Malpighiales phytozome
委陵菜 Potentilla micrantha Genome GPOMI 蔷薇目 Rosales http: / / gigadb.org / dataset/ 100407