Page 53 - 《广西植物》2020年第1期
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1 期                  金鑫等: 基于 5 993 个核基因的被子植物系统发育关系研究                                        4 9



                              表 1  本研究所用的 89 个植物物种及数据来源
                       Table 1  List of the 89 plants used in this study and the data source
    物种                          数据来源类型         缩写      目                           数据来源
    Species                     Data source type  Abbreviation  Order              Data source
    银杏 Ginkgo biloba              Genome      GGIBI    裸子植物门 Gymnosperm    http: / / gigadb.org / dataset/ 100613
    猕猴桃 Actinidia chinensis       Genome      GACCH    杜鹃花目 Ericales                 ncbi
    无油樟 Amborella trichopoda      Genome      GAMTR    无油樟目 Amborellales           phytozome
    菠萝 Ananas comosus             Genome      GANCO    禾本目 Poales                    ncbi
    深圳拟兰 Apostasia shenzhenica    Genome      GAPSH    天门冬目 Asparagales              ncbi
    拟南芥 Arabidopsis thaliana      Genome      GARTH    十字花目 Brassicales               tair
    芦笋 Asparagus officinalis      Genome      GASOF    天门冬目 Asparagales            phytozome

    甜菜 Beta vulgaris              Genome      GBEVU    石竹目 Caryophyllales            ncbi
    胡桃 Juglans regia              Genome      GJURE    壳斗目 Fagales                   ncbi
    喜树 Camptotheca acuminata      Genome      GCAAC    山茱萸目 Cornales        https: / / datadryad.org / resource /
                                                                              doi:10.5061 / dryad.nc8qr
    番木瓜 Carica papaya             Genome      GCAPA    十字花目 Brassicales            phytozome
    长春花 Catharanthus roseus       Genome      GCARO    龙胆目 Gentianales      https: / / datadryad.org / resource /
                                                                              doi:10.5061 / dryad.hs593
    土瓶草 Cephalotus follicularis   Genome      GCEFO    酢浆草目 Oxalidales               ncbi
    甜橙 Citrus sinensis            Genome      GCISI    无患子目 Sapindales             phytozome
    中粒咖啡 Coffea canephora         Genome      GCOCA    龙胆目 Gentianales     http: / / coffee-genome.org / download
    胡萝卜 Daucus carota             Genome      GDACA    伞形目 Apiales                 phytozome
    龙眼 Dimocarpus longan          Genome      GDILO    无患子目 Sapindales        http: / / gigadb.org / dataset/
                                                                                 view / id / 100276
    几内亚薯蓣 Dioscorea rotundata     Genome      GDIRO    薯蓣目 Dioscoreales    http: / / genome-e.ibrc.or.jp / home /
                                                                               bioinformatics-team / yam
    苦荞麦 Fagopyrum tataricum       Genome      GFATA    石竹目 Caryophyllales   http: / / www.mbkbase.org / Pinku1
    小果野蕉 Musa acuminata           Genome      GMUAC    姜目 Zingiberales               ncbi
    画眉草 Eragrostis tef            Genome      GERTE    禾本目 Poales          https: / / genomevolution.org / CoGe /
                                                                             GenomeInfo.pl? gid = 22790
    巨桉 Eucalyptus grandis         Genome      GEUGR    桃金娘目 Myrtales               phytozome
    欧洲白蜡树 Fraxinus excelsior      Genome      GFREX    唇形目 Lamiales      http: / / www.ashgenome.org / dup_annot11

    大豆 Glycine max                Genome      GGLMA    豆目 Fabales                  phytozome
    向日葵 Helianthus annuus         Genome      GHEAN    菊目 Asterales                phytozome
    牵牛花 Ipomoea nil               Genome      GIPNI    茄目 Solanales                  ncbi
    伽蓝 Kalanchoe fedtschenkoi     Genome      GKAFE    虎耳草目 Saxifragales           phytozome
    博落回 Macleaya cordata          Genome      GMACO    毛茛目 Ranunculales              ncbi
    苦瓜 Momordica charantia        Genome      GMOCH    葫芦目 Cucurbitales              ncbi
    中国莲 Nelumbo nucifera          Genome      GNENU    山龙眼目 Proteales                ncbi
    海枣 Phoenix dactylifera        Genome      GPHDA    棕榈目 Arecales                  ncbi
    毛果杨 Populus trichocarpa       Genome      GPOTR    金虎尾目 Malpighiales           phytozome

    委陵菜 Potentilla micrantha      Genome      GPOMI    蔷薇目 Rosales         http: / / gigadb.org / dataset/ 100407
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