Page 134 - 《广西植物》2020年第5期
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恒科技有限公司)ꎬBSA124S 分析天平(德国赛多利 重计算产量ꎬ样品备用ꎮ
斯集团)ꎬSW ̄CJ ̄2FD 洁净工作台( 中国苏州安泰 1.5.3.2 生物活性检测 病原指示菌分别接种至液
AIRTECH 公司)ꎬES ̄315 高压蒸汽灭菌锅( TOMYꎬ 体 LB 培养基ꎬ白色念珠菌于 28 ℃ ꎬ其余病原细菌
日本)ꎬDHG ̄9240A 电热恒温鼓风干燥箱(上海一恒 于 37 ℃ ꎬ220 rmin 震荡培养 18 hꎮ 用 LB 液体
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科技有限公司)ꎬLRH ̄250 生化培养箱(上海一恒科 培养基分别对各指示菌菌液进行梯度稀释ꎬ稀释
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技有限公司)ꎬSK5200H 超声仪(上海科导)ꎮ 至浓度为 1× 10 ~ 1×10 个mL ꎮ
1.5 方法 采用牛津杯法测定各菌株不同发酵粗提物的
1.5.1 内生菌优势菌株的筛选 放线菌在 YMG 培 体外抗菌活性ꎬ指示菌用涂布法或混菌法准备ꎮ
养基上培养 4 dꎬ用含菌的琼脂块扩散法进行放线 每个粗提物用 4 mL 丙酮溶解ꎬ分别取 50 μL 进行
菌抗病原细菌活性筛选ꎻ用平板对峙法进行抗真 活性测定ꎬ取 50 μL LB 培养基做阴性对照ꎬ取 50
菌活性筛选ꎻ用 SRB 法测定菌株的细胞毒性ꎮ 分 μL 丙酮做空白对照ꎬ取等体积抗生素溶液做阳性
别用 A3F / A7R(700 ~ 800 bp)、K1F / M6R(1 200 ~ 对照(病原细菌以 5 μg 利福霉素为阳性对照ꎻ白
1 400 bp)、KsaF / KSaR (613 bp) 引物进行 PCR 筛 色念珠菌用 20 μg 氟康唑为阳性对照)ꎮ 白色念
选非核糖体肽合成酶 NRPS 基因及聚酮合酶 PKS ̄I、 珠菌于 28 ℃ 培养ꎬ其余病原细菌于 37 ℃ 培养ꎬ24
PKS ̄Ⅱ基因(Qin et al.ꎬ2009)ꎮ h 后用游标卡尺测量抑菌圈的直径大小ꎮ
1.5.2 优势菌株的分类分析 对筛选出的阳性菌 采用 MTT 法对部分发酵产物进行抗肿瘤活性
株进行基因组提取ꎬ 利用细菌 16S rRNA 基因通 测试ꎮ 粗筛浓度为 20 μgmL ꎬ 加样 72 h 后观
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用引物 PA: 5′ ̄CAG AGT TTG ATC CTG GCT ̄3′ꎬ 察肿瘤细胞生长状况ꎮ
PB: 5′ ̄AGG AGG TGA TCC AGC CGC A ̄3′ 进 行
PCR 扩增ꎮ 扩增条件:94 ℃ 预变性 5 minꎻ30 个循 2 结果与分析
环(94 ℃ 变性 1 minꎬ56 ℃ 退火 1 min) ꎬ72 ℃ 延伸
3 minꎻ72 ℃ 总延伸 6 minꎮ 得到的 PCR 产物经 2.1 内生菌优势菌株的筛选
0.8%琼脂糖胶回收后送生工生物工程 ( 上海) 股 对 300 余株分离自剑叶龙血树的内生放线菌
份 有 限 公 司 测 序ꎬ 得 到 的 序 列 经 EzBioCloud 进行抗病原细菌、抗病原真菌活性、抗肿瘤细胞活
(http: / / www. ezbiocloud. net/ ) 中 的 EzTaxon 在 线 性以及 PKS ̄I、PKS ̄Ⅱ和 NRPS 基因的研究ꎬ拟筛选
比对服务进行相关标准菌株的相似性搜索ꎬ确定 出兼具多种抗菌活性和肿瘤细胞毒活性ꎬ并具有
菌 株 的 分 类 学 地 位ꎬ 并 调 出 相 关 放 线 菌 的 产聚酮类化合物和非核糖体多肽类化合物潜力的
16S rRNA基因序列ꎬ随后用 Clustal X 进行序列比 菌株ꎮ 筛选结果表明ꎬ五株内生放线菌 S01 -S05
对ꎬ最终用 MEGA 6 软件 Neighbour ̄Joining 法构建 整体结果较好ꎬ对初筛的 6 种以上病原细菌表现
系统发育树ꎮ 出显著抑菌活性ꎬ菌株 S02 和 S04 对 8 种病原细菌
1.5.3 优势菌株产活性代谢产物发酵培养基的优化 的抑制作用较好ꎬ抑菌圈直径最高达 38 mmꎮ 5 株
1.5.3. 1 菌 株 发 酵 及 提 取 内 生 放 线 菌 接 种 于 菌对产毒真菌和肿瘤细胞株的活性以及次级代谢
YMG 培养基平板上ꎬ28 ℃ 恒温培养箱倒置培养 相关基因簇筛选的结果如表 1 所示ꎬS01、 S02 和
3 ~ 4 d 做为菌种ꎬ挑取适量菌丝分别接于 A-H 培 S05 同时对三株产毒真菌均有抗菌活性ꎻS01 和
养基 (25 mLplate )ꎬ每株 菌 每 种 培 养 基 发 酵 S02 中 PKS ̄I、PKS ̄Ⅱ和 NRPS 三种基因均为阳性ꎻ
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100 mLꎬ于 28 ℃ 恒温培养箱倒置培养ꎬ14 d 后将 S02 发酵液粗提物对 Hep G2 和 MCF ̄7 细胞株有
琼脂切块于三角烧瓶中ꎬ用乙酸乙酯 ∶ 甲醇 ∶ 冰 显著抑制活性ꎬIC 值分别为 10 和 3 μgmL ꎮ
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乙酸 (80 ∶ 15 ∶ 5) 浸泡过夜提取三遍ꎬ把琼脂过 2.2 优势菌株 16S rDNA 序列扩增及系统发育学分析
滤后在旋转蒸发仪上减压浓缩回收溶剂ꎬ用有机 对初筛出的 5 株优势菌株提取基因组后进行
溶剂将粗提物转至样品瓶ꎬ等溶剂完全挥发后ꎬ称 16S rRNA 基因测序ꎬ 将所得序列在数据库中进行