Page 117 - 《广西植物》2025年第12期
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12 期                张煜冰等: 棱枝槲寄生叶绿体基因组结构特征及系统发育分析                                          2 2 5 9















































                                            图 1  棱枝槲寄生叶绿体基因组图谱
                                      Fig. 1  Chloroplast genome map of Viscum diospyrosicola


            重复ꎮ 棱枝槲寄生叶绿体基因组中有 18 个回文                           界处基因不完全相同ꎬ基因的长度也有差异ꎬ5 个物

            重复、25 个正向重复、7 个反向重复ꎮ                               种叶绿体 LSC 区、SSC 区、 IR 区大小范围分别为
                 槲寄生属 5 种植物叶绿体基因组序列中ꎬ共检                        72 365~76 070 bp、8 174 ~ 8 991 bp、22 888~ 23 382
            测到 79 ~ 118 个 SSR 位点(表 4)ꎬ其中单核苷酸重                  bpꎬ其中棱枝槲寄生的 LSC 区与 SSC 区最小ꎮ JLB
            复 49 ~ 73 个、二核苷酸重复 8 ~ 28 个、三核苷酸重                  边界扩张范围显示ꎬ棱枝槲寄生的 rpl22 基因由 IRb
            复 4 ~ 17 个、四核苷酸重复 6 ~ 10 个、五核苷酸重                   区跨越边界进入 LSC 区 31 个碱基ꎮ JSB 边界扩张
            复 0 ~ 2 个、六核苷酸重复 0 ~ 2 个ꎮ 5 种植物叶绿                  范围显示ꎬ除棱枝槲寄生和扁枝槲寄生以外ꎬJLB 边
            体基因组序列中 SSR 类型分别以单核苷酸 A / T                        界两侧分布均有 trnN 和 rpl32 基因ꎮ JSA 边界扩张
            (98.76%)、二核苷酸 AT / AT(79.22%)、三核苷酸                 范围显示ꎬ槲寄生、枫香槲寄生和瘤果槲寄生 JLB 边
            AAT / ATT ( 95. 83%)、 四 核 苷 酸 AAAT / ATTT          界上的 ycf1 基因由 IRa 区跨越边界进入 SSC 区ꎬ边
            (46.34%)、五 核 苷 酸 AAAAT / ATTTT( 50. 00%)、          界右侧基因都为 trnN 基因ꎮ JLA 边界扩张范围显
            六核苷酸 AATGAG / ATTCTC(40.00%) 为主ꎬ表明                 示ꎬ棱枝槲寄生和扁枝槲寄生 JLB 边界侧翼基因为
            其叶 绿 体 基 因 组 序 列 中 SSRs 主 要 由 polyA 或              rpl22 和 trnHꎬ槲寄生、枫香槲寄生和瘤果槲寄生 JLB
            polyT 构成ꎮ                                          边界侧翼基因为 trnH 和 psbAꎮ
            2.3.2 叶绿体基因组 IR 边界的收缩和扩张分析                         2.3.3 叶绿体全基因组比较及共线性分析  5 种
              对叶绿体中 IR 区边界的结构分析发现(图 3)ꎬ边                       槲寄生属植物叶绿体基因序列的整体相似度较高
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