Page 159 - 《广西植物》2025年第3期
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3 期               姚淑婷等: 六堡茶群体种叶绿体基因组捕获历史与遗传多样性研究                                            5 3 9

                                    表 5  六堡茶群体种不同基因组序列的遗传多样性参数
               Table 5  Genetic diversity parameters of different genome sequences of Camellia sinensis var. sinensis ‘Liupao’
                                                                                     单倍型           单倍型
                                                                    平均核苷酸差异
                            单倍型数量        单倍型多样性        核苷酸多样性                       多样性方差        多样性标准差
                数据类型                                                Average number of
                             Number of     Haplotype     Nucleotide                 Variance of  Standard deviation
                Data type                                              nucleotide
                             haplotypes     diversity    diversity                   haplotype    of haplotype
                                                                       differences
                                                                                     diversity     diversity
              叶绿体基因组
                               16           0.949         0.000 9      140.057       0.000 62       0.025
             Chloroplast genome
                核基因
                               27             1          0.004 72      2 598.37      0.000 1        0.01
               Nuclear gene
            展ꎬ并为进一步的遗传改良和品质提升提供更多                              BOUCKAERT Rꎬ HELED Jꎬ KÜHNERT Dꎬ et al.ꎬ 2014. BEAST
                                                                 2: a software platform for bayesian evolutionary analysis
            的选择性和可能性ꎮ
                                                                 [J]. PLOS Computational Biologyꎬ 10(4): e1003537.
            3.3 六堡茶品种选育和资源开发利用
                                                               CHEN Jꎬ LIAO CSꎬ LIU CMꎬ et al.ꎬ 2020. Introduction to
                 优质的茶树品种是茶叶优异品质形成的重要                             clonal tea cultivars suitable for ‘Liubao’ tea production in
            因素(刘佳等ꎬ2013)ꎮ 茶树品种影响茶叶化学成                            Guangxi [J]. Southern Agricultureꎬ 14(19): 53-56. [陈
                                                                 佳ꎬ 廖传盛ꎬ 刘春梅ꎬ 等ꎬ 2020. 适制六堡茶的广西无性
            分组成与含量ꎬ从而影响茶叶的品质( 郭桂义等ꎬ
                                                                 系茶树良种介绍 [J]. 南方农业ꎬ 14(19): 53-56.]
            2010)ꎮ 随着六堡茶市场不断扩大ꎬ为满足日益增
                                                               CHEN Jꎬ QIN XJꎬ LAI ZRꎬ et al.ꎬ 2010. Study on improved
            长的需求ꎬ六堡茶的制作除了使用传统的六堡茶                                technologies of ‘ Liubao’ tea native species [ J]. Chinese
            群体种外ꎬ还引进了其他外地的适制品种ꎬ如凌云                               Horticulture Abstractsꎬ 26(9): 183-184. [陈佳ꎬ 覃秀菊ꎬ
                                                                 赖兆 荣ꎬ 等ꎬ 2010. 六 堡 茶 原 生 种 的 改 良 技 术 探 讨
            白毫茶、临桂白毫茶、资源大桂茶等ꎬ加之六堡茶
                                                                 [J]. 中国园艺文摘ꎬ 26(9): 183-184.]
            茶园里茶树品种来源不一ꎬ导致市场上部分六堡                              CHEN SFꎬ ZHOU YQꎬ CHEN YRꎬ et al.ꎬ 2018. Fastp: an
            茶产 品 失 去 了 其 原 来 的 品 质 特 点 ( 刘 晓 东 等ꎬ                ultra ̄fast  all ̄in ̄one  FASTQ  preprocessor  [ J ].
            2013)ꎮ 本研究显示ꎬ六堡茶群体种具有不同的遗                            Bioinformaticsꎬ34(17): i884-i890.
                                                               CHEN ZMꎬ 1992. The tea classics of China [M]. Shanghai:
            传背景和演化历史ꎬ具有较高遗传多样性ꎮ 这为
                                                                 Shanghai Culture Publishing House: 130. [ 陈 宗 懋ꎬ
            进一步探索不同遗传背景与农艺性状和茶品质之                                1992. 中国茶经 [M]. 上海: 上海文化出版社: 130.]
            间的关联提供了契机ꎮ 未来研究可通过遗传的深                             COHEN KMꎬ FINNRY SCꎬ GIBBARD PLꎬ et al.ꎬ 2013. The
                                                                 ICS international chronostratigraphic chart [ J]. Episodesꎬ
            入分析和农艺性状的评估ꎬ探索不同品种间的遗
                                                                 36: 199-204.
            传差异与茶叶品质之间的关系ꎬ为高品质的六堡                              Compilation Committee of Records of Tea Plant Cultivars in
            茶株系或品种的选育、鉴定和开发利用提供新的                                Chinaꎬ 2001. Records of tea plant cultivars in China
            思路和方案ꎮ 此外ꎬ借鉴六堡茶与突肋茶间的自                               [ M ].  Shanghai: Shanghai  Scientific  and  Technical
                                                                 Publishers: 187. [中国茶树品种志编写委员会ꎬ 2001. 中
            然杂交ꎬ可以开展种间或品种间人工杂交ꎮ 通过
                                                                 国茶树品种志 [M]. 上海: 上海科学技术出版社: 187.]
            定向杂交引入其他品种或种类的优质基因ꎬ可以                              EDGAR RCꎬ 2004. MUSCLE: Multiple sequence alignment
            进一步改良六堡茶的品质特点ꎬ获得高品质的新                                with high accuracy and high throughput [J]. Nucleic Acids
                                                                 Researchꎬ 32(5): 1792-1797.
            品种ꎮ
                                                               EMMS DMꎬ KELLY Sꎬ 2019. OrthoFinder: Phylogenetic
                                                                 orthology inference for comparative genomics [ J]. Genome
                                                                 Biologyꎬ 20(1): 238.
            参考文献:                                              FEHRER Jꎬ GEMEINHOLZER Bꎬ CHRTEK Jꎬ et al.ꎬ
                                                                 2007. Incongruent plastid and nuclear DNA phylogenies
            ACOSTA MCꎬ PREMOLI ACꎬ 2010. Evidence of chloroplast  reveal  ancient  intergeneric  hybridization  in  Pilosella
               capture  in  South  American  Nothofagus  ( subgenus  hawkweeds ( Hieraciumꎬ Cichorieaeꎬ Asteraceae ) [ J ].
               Nothofagusꎬ Nothofagaceae) [J]. Molecular Phylogenetics &  Molecular Phylogenetics & Evolutionꎬ 42(2): 347-361.
               Evolutionꎬ 54: 235-242.                         FU LMꎬ NIU BFꎬ ZHU ZWꎬ et al.ꎬ 2012. CD ̄HIT: accelerated
            ALEXANDER DHꎬ NOVEMBRE Jꎬ LANGE Kꎬ 2009. Fast        for clustering the next ̄generation sequencing data [ J ].
               model ̄based estimation of ancestry in unrelated individuals  Bioinformaticsꎬ 28(23): 3150-3152.
               [J]. Genome Researchꎬ 19(9): 1655-1664.         GONG MSꎬ LU CLꎬ LU YKꎬ et al.ꎬ 2021. Exploitation and
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