Page 168 - 《广西植物》2025年第3期
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５ ４ ８ 广 西 植 物 ４５ 卷
红色三角形代表文采报春苣苔 ＰｗＤＲＥＢ２ｓ 转录因子ꎬ１ ０００ 次重复中检验获得的自展值在分支上标注ꎮ Ａ. 基于 ＤＲＥＢ 亚族转录
因子全长序列构建的系统进化树(邻接法)ꎬＡ￣１－Ａ￣６ 分别为不同亚组ꎻ Ｂ. 基于 Ａ￣２ 亚组转录因子 ＡＰ２ / ＥＲＦ 保守域及侧翼序列
构建的系统进化树(邻接法)ꎬ不同颜色矩形方框分别表示亚型 １－４ꎮ
Ｒｅｄ ｔｒｉａｎｇｌｅｓ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ ＰｗＤＲＥＢ２ｓ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒｓ ｉｎ Ｐ. ｗｅｎｔｓａｉｉꎬ ｔｈｅ ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｖａｌｕｅｓ ｏｂｔａｉｎｅｄ ｆｒｏｍ ｔｏｔａｌ １ ０００ ｒｅｐｌｉｃａｔｅｓ ａｒｅ ａｌｌ ｎｏｔｅｄ ｏｎ ｔｈｅ
ｂｒａｎｃｈｅｓ. Ａ. Ａｃｃｏｒｄｉｎｇ ｔｏ ｔｈｅ ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ＤＲＥＢ ｓｕｂｆａｍｉｌｙ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒｓꎬ ｔｈｅ ｎｅｉｇｈｂｏｒ￣ｊｏｉｎｉｎｇ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅ ｉｓ ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄꎬ
Ａ￣１－Ａ￣６ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｓｕｂｇｒｏｕｐｓꎬ ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙꎻ Ｂ. Ｂａｓｅｄ ｏｎ ｔｈｅ ＡＰ２/ ＥＲＦ ｄｏｍａｉｎｓ ａｎｄ ｆｌａｎｋｉｎｇ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ａ￣２ ｓｕｂｇｒｏｕｐ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ
ｆａｃｔｏｒｓꎬ ｔｈｅ ｎｅｉｇｈｂｏｒ￣ｊｏｉｎｉｎｇ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅ ｉｓ ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄꎬ ｒｅｃｔａｎｇｌｅ ｂｏｘｅｓ ｗｉｔｈ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｃｏｌｏｒｓ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ ｓｕｂｔｙｐｅｓ １－４ꎬ ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ.
图 ２ 文采报春苣苔 ＰｗＤＲＥＢ２ｓ 转录因子的系统进化分析
Ｆｉｇ. ２ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＰｗＤＲＥＢ２ｓ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒｓ ｉｎ Ｐｒｉｍｕｌｉｎａ ｗｅｎｔｓａｉｉ
不同颜色的方框分别代表了编号为 １ ~ １５ 的不同保守基序ꎬ所示基序匹配的位置 Ｐ 值均小于０.０００ １ꎬ基序长度按比例绘制ꎮ
ＡｔＤＲＥＢ２Ａ(ＮＰ＿１９６１６０)、ＡｔＤＲＥＢ２Ｄ(ＡＢＫ５９６７１)、ＡｔＤＲＥＢ２Ｅ(ＮＰ＿００１３１８３７２)及 ＡｔＤＲＥＢ２Ｆ(ＮＰ＿１９１３１９) 均来自拟南芥ꎮ 利用
ＭＥＭＥ 在线工具对拟南芥和文采报春苣苔中 １２ 个 ＤＲＥＢ２ 转录因子进行保守基序预测ꎮ
Ｂｏｘｅｓ ｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｃｏｌｏｒｓ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ ｍｏｔｉｆｓ ｎｕｍｂｅｒｅｄ １ ｔｏ １５ꎬ ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ. Ｔｈｅ ｍｏｔｉｆ ｍａｔｃｈｅｄ ｓｈｏｗｎ ｈａｓ ａ ｐｏｓｉｔｉｏｎ Ｐ ｖａｌｕｅ
ｌｅｓｓ ｔｈａｎ ０.０００ １. Ｔｈｅ ｄｏｍａｉｎｓ ａｒｅ ｄｒａｗｎ ｔｏ ｓｃａｌｅ. ＡｔＤＲＥＢ２Ａ (ＮＰ＿１９６１６０)ꎬ ＡｔＤＲＥＢ２Ｄ (ＡＢＫ５９６７１)ꎬ ＡｔＤＲＥＢ２Ｅ (ＮＰ＿００１３１８３７２) ａｎｄ
ＡｔＤＲＥＢ２Ｆ (ＮＰ＿１９１３１９) ａｒｅ ｆｒｏｍ Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ｔｈａｌｉａｎａ. Ｔｗｅｌｖｅ ＤＲＥＢ２ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒｓ ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ Ａ. ｔｈａｌｉａｎａ ａｎｄ Ｐｒｉｍｕｌｉｎａ ｗｅｎｔｓａｉｉ ａｒｅ
ｃｏｌｌｅｃｔｅｄ ｆｏｒ ｍｏｔｉｆ ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ｕｓｉｎｇ ＭＥＭＥ ｏｎｌｉｎｅ ｔｏｏｌｓ.
图 ３ 文采报春苣苔 ＰｗＤＲＥＢ２ｓ 转录因子中的保守基序分布
Ｆｉｇ. ３ Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｏｆ ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ ｍｏｔｉｆｓ ｉｎ ｔｈｅ ＰｗＤＲＥＢ２ｓ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒｓ ｆｒｏｍ Ｐｒｉｍｕｌｉｎａ ｗｅｎｔｓａｉｉ
