Page 35 - 《广西植物》2025年第4期

４ 期 徐梦阳等: 南酸枣转录组特征分析及 ＳＳＲ 标记开发 ６ ４ ９

横轴和纵轴分别表示片段大小(ｂｐ) 和荧光强度ꎻ ＪＸＣＹ. 江西崇义ꎻ ＧＺＪＫ. 贵州江口ꎻ ＨＮＳＺ. 湖南桑植ꎻ ＹＮＭＳ. 云南芒市ꎻ
ＧＸＰＮ. 广西平南ꎻ ＨＢＣＢ. 湖北赤壁ꎻ ＡＨＱＭ. 安徽祁门ꎻ ＣＱＳＰＢ. 重庆沙坪坝ꎮ
Ｔｈｅ Ｘ￣ａｘｉｓ ａｎｄ Ｙ￣ａｘｉｓ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｓｉｚｅ (ｂｐ) ａｎｄ ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｉｎｔｅｎｓｉｔｙꎬ ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙꎻ ＪＸＣＹ. Ｃｈｏｎｇｙｉꎬ Ｊｉａｎｇｘｉꎻ ＧＺＪＫ. Ｊｉａｎｇｋｏｕꎬ
Ｇｕｉｚｈｏｕꎻ ＨＮＳＺ. Ｓａｎｇｚｈｉꎬ Ｈｕｎａｎꎻ ＹＮＭＳ. Ｍａｎｇｓｈｉꎬ Ｙｕｎｎａｎꎻ ＧＸＰＮ. Ｐｉｎｇｎａｎꎬ Ｇｕａｎｇｘｉꎻ ＨＢＣＢ. Ｃｈｉｂｉꎬ Ｈｕｂｅｉꎻ ＡＨＱＭ. Ｑｉｍｅｎꎬ Ａｎｈｕｉꎻ
ＣＱＳＰＢ. Ｓｈａｐｉｎｇｂａꎬ Ｃｈｏｎｇｑｉｎｇ.
图 ４ 引物 ＮＳＺ￣９１４１ 在 ８ 份南酸枣中扩增出的 ８ 种基因型
Ｆｉｇ. ４ Ｅｉｇｈｔ ｇｅｎｏｔｙｐｅｓ ｇｅｎｅｒａｔｅｄ ｂｙ ｔｈｅ ｐｒｉｍｅｒ ＮＳＺ￣９１４１ ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ａｍｏｎｇ ｅｉｇｈｔ ｓａｍｐｌｅｓ ｏｆ Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ ａｘｉｌｌａｒｉｓ

到等位基因数( Ｎ ) 为 ８０ꎬ平均每对引物检测到 片转录组ꎬ共获得 ２３６ ６５９ ７９６ 条有效序列ꎬＮ５０
ａ
３.８２ 个等位基因ꎻ平均有效等位基因数( Ｎ ) 为 长度为 ２ ４０９ ｂｐꎬ平均长度为 １ ３０９ ｂｐꎬ高于同漆
ｅ
２.６１ꎬ其值分布在 １.１４( ＮＳＺ￣２２９００) 至 ７.１６( ＮＳＺ￣ 树科植物芒果(Ｍａｎｇｉｆｅｒａ ｉｎｄｉｃａ) (Ｎ５０ ＝ ２ １６０ ｂｐꎻ
１３１) 之 间ꎻ 多 样 性 指 数 ( Ｉ) 分 布 在 ０. ２１ ( ＮＳＺ￣ 平均长度 ＝ １ ２１９ ｂｐ)(丁雨格等ꎬ２０２４)ꎮ 此外ꎬ也
２２９００)至 ２.０６( ＮＳＺ￣１３１) 之间ꎬ平均值为 ０.９８ꎻ平 高于其他学者有关南酸枣叶片及果实的转录组测
均观测杂合度( Ｈ ) 以及期望杂合度( Ｈ ) 值均为 序结果(Ｎ５０ ＝ １ ８４１ ｂｐꎻ平均长度 ＝ １ ２８７ ｂｐ) ( 谷
ｏ ｅ
０.５３ꎻ多态性信息含量( ＰＩＣ) 在 ０.１２( ＮＳＺ￣２２９００) 振军等ꎬ２０１９)ꎬ以及同为长江以南主要阔叶树种
至 ０.９２( ＮＳＺ￣１８６) 之间ꎬ平均值为 ０.５６ꎮ 其中ꎬ１５ 的米槠( Ｃａｓｔａｎｏｐｓｉｓ ｃａｒｌｅｓｉｉ) ( Ｎ５０ ＝ １ ４２７ ｂｐꎻ平均
个位点具有高度多态性(ＰＩＣ>０.５)ꎬ４ 个位点具有 长度 ＝ １ ０３４ ｂｐ) ( Ｚｈｏｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０２３) 和同样果用
中度多态性(０.２５<ＰＩＣ≤０.５)ꎮ 结果表明ꎬ开发的 价值 较 高 的 苦 楝 ( Ｍｅｌｉａ ａｚｅｄａｒａｃｈ) ( Ｎ５０ ＝ １ ９５５
２０ 对 ＳＳＲ 引物可用于后续南酸枣分子遗传多样性 ｂｐꎻ平均长度 ＝ １ ４３１.８２ ｂｐ) ( 蔡金峰等ꎬ２０２１) 的

评价ꎮ 测序结果ꎮ 这说明研究所获得的南酸枣转录组测
序质量以及组装效果较好ꎬ为南酸枣的分子标记
３ 讨论 开发奠定良好的信息基础ꎮ
本研究从南酸枣叶片转 录 组 序 列 中 检 测 到
对于没有参考基因组的非模式物种ꎬ基于转 ５ ２５１个 ＳＳＲ 标记位点ꎬ平均分布距离为 １０.０６ ｋｂꎬ
录组数据开发分子标记被认为是最有效的方法 ＳＳＲ 发生频率为 １１.１８％ꎮ 本研究 ＳＳＲ 发生频率低
(Ｕｎａｍｂａ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０１５)ꎮ 本研究基于南酸枣雌雄叶 于南酸枣果实及叶片转录组中的发生频率 ２５.５２％