Page 32 - 《广西植物》2025年第4期
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苷酸、五核苷酸、六核苷酸重复类型的 SSR 长度分 (检测 到 的 序 列 总 长 度 与 搜 索 到 的 SSR 数 量 之
别为 10 545.15、3 975.65、4 434.16 bpꎮ 除去复合型 比)ꎬ平均每 10.06 kb( 检测序列总的大小与搜索
核苷酸和位置有重叠的复合型核苷酸重复类型ꎬ六 到的 SSR 数量之比)就会有 1 个 SSR 位点出现(表
核苷酸 重 复 类 型 的 平 均 长 度 最 长ꎬ 但 占 比 较 小 5)ꎬ其中检测序列总的大小见表 4(52 806 369 bp)
(3.28%)ꎮ 所有 SSR 位点的平均长度为 22.31 bp 以及 1 kb = 1 000 bpꎮ
图 1 南酸枣整体差异表达基因的聚类图(A)和火山图(B)
Fig. 1 The cluster diagram ( A ) and volcano diagram ( B ) of overall
differentially expressed genes of Choerospondias axillaris
表 4 南酸枣转录组 SSR 位点的信息
Table 4 Information of SSR loci in the transcriptome of Choerospondias axillaris
项目类型 统计结果
Project type Statistical result
检测的序列总数 Total number of detected sequences 40 341
检测序列总的大小 Total size of the detected sequence (bp) 52 806 369
检测到的 SSR 位点总数 Total number of detected SSR loci 5 251
包含 SSR 位点的 Unigenes 数量 Number of Unigenes containing SSR loci 4 511
含有单个 SSR 位点的 Unigenes 数量 Number of Unigenes with a single SSR locus 3 892
含有 2 个及以上 SSR 位点的 Unigenes 数量 Number of Unigenes with two or more SSR loci 619
含复合型 SSR 位点的 Unigenes 数量 Number of Unigenes containing composite SSR loci 386
含有位置有重叠的复合 SSR 的 Unigenes 数量 Number of Unigenes containing overlapping composite SSR 18
2.4 转录组 SSR 位点的基元长度及重复基元特点 度在 30 bp 以上的总占比较小ꎬ仅占 10.24%ꎮ
基元长度在 20 bp 以下的 SSR 位点共有 3 601 5 251 个 SSR 位点中含有 412 种重复基元类
个ꎬ所占比例最高ꎬ为 68.58%ꎻ其次为长度为 21 ~ 型ꎮ 其中ꎬ二核苷酸重复基元有 10 种ꎬ以 AG / CT
30 bp 的 SSR 位点ꎬ有 1 112 个ꎬ占比为 21.18%ꎻ长 为主要类型ꎬ 为 1 309 个ꎬ 频率为 24.93%ꎬ 其次

