Page 37 - 《广西植物》2025年第4期
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４ 期 徐梦阳等: 南酸枣转录组特征分析及 ＳＳＲ 标记开发 ６ ５ １
(谷振军等ꎬ２０１９)ꎬ而高于枇杷(Ｅｒｉｏｂｏｔｒｙａ ｊａｐｏｎｉｃａ)
(６.７７％) (郑婷婷等ꎬ２０１５) 和芒果(７.５７％) ( 罗纯 ４ 结论
等ꎬ２０１５)等植物ꎬ这表明不同物种之间 ＳＳＲ 发生频
率存在差异(Ｚａｌａｐａ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０１２)ꎮ 不同测序组织类 南 酸 枣 转 录 组 数 据 的 ＳＳＲ 发 生 频 率 为
型选择、基因表达量的差异、ＳＳＲ 位点搜索标准的不 １１.１８％ꎬ低级重复基元通常具有较长的进化时间
一致以及 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 数量、长度和序列大小的差异可 和较高的变异频率ꎬ主要以二核苷酸、三核苷酸重
能是导致这种差异的原因ꎮ 不同植物的 ＳＳＲ 位点 复为主ꎮ ２０ 对引物经多态性验证ꎬ共检测到 ８０ 个
重复基元类型各异ꎬ多数植物如杨梅(Ｍｙｒｉｃａ ｒｕｂａｒ) 等位基因ꎬ平均多态性信息含量为 ０.５６ꎮ 表明这
(张淑文等ꎬ２０１９)、 芒果 ( 罗纯等ꎬ２０１５)、 白三叶 ２０ 对引物可有效用于后续南酸枣遗传多样性评
(Ｔｒｉｆｏｌｉｕｍ ｒｅｐｅｎｓ) (张婷婷等ꎬ２０２３) 等都以二核苷 价、性别分子辅助育种、指纹图谱构建以及核心种
酸、三核苷酸重复为主ꎮ 本研究中二核苷酸重复占 质构建等的相关研究中ꎮ
比最高(４６.９５％)ꎬ其次为三核苷酸重复(３４.２７％)ꎮ
这两种重复基元所占比例高达 ８１.２２％ꎬ与大多数物
种重复基元类型相同ꎮ 但是ꎬ也有植物以单核苷酸 参考文献:
重复为 主ꎬ 如 枸 杞 ( Ｌｙｃｉｕｍ ｃｈｉｎｅｎｓｅ) ( 王 佳 伟 等ꎬ
ＣＡＩ ＪＦꎬ ＹＡＮＧ ＸＭꎬ ＹＵ ＷＷꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ
２０２２)、 悬 铃 木 ( Ｐｌａｔａｎｕｓ ａｃｅｒｉｆｏｌｉａ) ( 张 思 思 等ꎬ ＳＳＲ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｏｆ
２０２２)等ꎮ 然而ꎬ由于单核苷酸自身的特殊性ꎬ大多 Ｍｅｌｉａ ａｚｅｄａｒａｃｈ [Ｊ]. Ｓｃｉｅｎｔｉａ Ｓｉｌｖａｅ Ｓｉｎｉｃａｅꎬ ５７(６): ８５－
数研究中不将其作为研究对象ꎬ因此在本研究中不 ９２. [蔡金峰ꎬ 杨晓明ꎬ 郁万文ꎬ 等ꎬ ２０２１. 基于苦楝转录
组测序的 ＳＳＲ 分子标记开发 [Ｊ]. 林业科学ꎬ ５７(６):
考虑单核苷酸重复ꎮ
８５－９２.]
多态性是鉴定分子标记性能的重要参考指标
ＣＨＥＮ Ｌꎬ ＹＵ ＦＬꎬ ＹＡＯ ＭＺꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００８. Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ
之一ꎮ Ｔｅｍｎｙｋｈ 等(２０００) 研究发现ꎬＳＳＲ 长度是影 ＵＰＯＶ ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｃｏｎｄｕｃｔ ｏｆ ｔｅｓｔｓ ｆｏｒ ｄｉｓｔｉｎｃｔｎｅｓｓꎬ
ｕｎｉｆｏｒｍｉｔｙ ａｎｄ ｓｔａｂｉｌｉｔｙ ——— ｔｅａ ｐｌａｎｔ [ Ｊ ]. Ｓｃｉｅｎｔｉａ
响其多态性的重要因素ꎮ 具有高度多态性的 ＳＳＲ
长度通常大于 ２０ ｂｐꎬ中度多态性的 ＳＳＲ 长度大多 Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａ Ｓｉｎｉｃａꎬ ４１(８): ２４００－２４０６. [陈亮ꎬ 虞富莲ꎬ
姚明哲ꎬ 等ꎬ ２００８. 国际植物新品种保护联盟茶树新品种
为 １２~ ２０ ｂｐꎬ低度多态性的 ＳＳＲ 长度在 １２ ｂｐ 以 特异性、一致性、稳定性测试指南的制订 [Ｊ]. 中国农业
下ꎮ 南酸枣 ＳＳＲ 位点长度大多为 ２１ ~ ３０ ｂｐꎬ共有 科学ꎬ ４１(８): ２４００－２４０６.]
１ １１２个ꎬ表明南酸枣的 ＳＳＲ 位点具有高多态性潜 ＤＩＮＧ ＹＧꎬ ＨＯＵ Ｑꎬ ＺＨＯＵ Ｌꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２４. Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ
能ꎮ 本研究开发的 ２０ 对引物ꎬ在 ９ 个群体中共检测 ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｆｏｌｉａｒ ｗａｔｅｒ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｎ ｔｈｅ ｎａｐ
ｔｉｍｅ ｏｆ ｍａｎｇｏ ｌｅａｖｅｓ [ Ｊ ]. Ａｃｔａ Ｂｏｔａｎｉｃａ Ｂｏｒｅａｌｉ￣
到 ８０ 个等位基因ꎬ平均观测杂合度以及平均期望杂
Ｏｃｃｉｄｅｎｔａｌｉａ Ｓｉｎｉｃａꎬ ４４(７): １０９４－１１０４. [丁雨格ꎬ 侯琪ꎬ
合度均为 ０.５３ꎬ平均多态性信息含量为 ０.５６ꎬ其中 周玲ꎬ 等ꎬ ２０２４. 叶面喷水影响芒果叶片“午休”的转录组
１９ 个位点具有中、高多态性ꎬ说明开发的 ＳＳＲ 引物 分析 [Ｊ]. 西北植物学报ꎬ ４４(７): １０９４－１１０４.]
能够满足后续相关研究需求ꎮ 通常认为ꎬ重复基元 Ｅｄｉｔｏｒｉａｌ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ ｏｆ Ｆｌｏｒａ ｏｆ Ｃｈｉｎａꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ
Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ １９８０. Ｆｌｏｒａ Ｒｅｉｐｕｂｌｉｃａｅ Ｐｏｐｕｌａｒｉｓ Ｓｉｎｉｃａｅ:
长度与选择压力相关ꎬ短重复基元变异速率越快ꎬ
Ｖｏｌ. ４５ꎬ ＰａｒｔⅠ[Ｍ]. Ｂｅｉｊｉｎｇ: Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｒｅｓｓ: ８６. [中国科
低级重复基元类型的 ＳＳＲ 多态性高于高级重复基 学院中国植物志编辑委员会ꎬ １９８０. 中国植物志: 第四十
元类型(Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ２００５)ꎮ 单碱基、二碱基和三碱 五卷ꎬ 第一分册 [Ｍ]. 北京: 科学出版社: ８６.]
基等低级重复基元通常具有较长的进化时间和较 ＧＡＯ Ｙꎬ ＢＡ ＹＦꎬ ＬＩ ＨＹꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｃｈａｎｇｅｓ ｏｆ ｃｏｌｏｒ ａｎｄ
高的变异频率(陈亮等ꎬ２００８)ꎮ 除单核苷酸外ꎬ南 ｔｅｘｔｕｒｅ ｏｆ Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ ａｘｉｌｌａｒｉｓ ｆｒｕｉｔ ａｔ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｓｔｏｒａｇｅ
ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅｓ [Ｊ]. Ｎｏｎ￣ｗｏｏｄ Ｆｏｒｅｓｔ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ ３９(４): ２３９－
酸枣主要以二核苷酸重复为主ꎬ表明其具有相对较
２４５. [高阳ꎬ 巴元富ꎬ 李宏宇ꎬ 等ꎬ ２０２１. 不同贮藏温度条
高的进化程度ꎮ 在福建地区发现的中新世南酸枣 件下南酸枣果实色泽和质地的变化 [Ｊ]. 经济林研究ꎬ
化石ꎬ经研究后发现其在我国华南地区可能自远古 ３９(４): ２３９－２４５.]
ＧＲＡＢＨＥＲＲ ＭＧꎬ ＨＡＡＳ ＢＪꎬ ＹＡＳＳＯＵＲ Ｍꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１. Ｆｕｌｌ￣
时代就一直存在至今ꎬ具有悠久的演变历史(Ｗａｎｇ
ｅｔ ａｌ.ꎬ２０２０)ꎮ 南酸枣在此过程中保持一定进化速 ｌｅｎｇｔｈ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ａｓｓｅｍｂｌｙ ｆｒｏｍ ＲＮＡ￣Ｓｅｑ ｄａｔａ ｗｉｔｈｏｕｔ ａ
ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｇｅｎｏｍｅ [Ｊ]. Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬ ２９(７): ６４４.
率的同时ꎬ表现出对环境较高的适应性ꎬ可能与南
ＧＵ ＺＪꎬ ＹＡＮＧ ＣＸꎬ ＤＩＮＧ Ｗꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９. Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ
酸枣较高的多态性特性有关ꎮ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＳＳＲ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｏｆ
