Page 33 - 《广西植物》2025年第4期

４ 期 徐梦阳等: 南酸枣转录组特征分析及 ＳＳＲ 标记开发 ６ ４ ７

是 ＡＴ / ＡＴ 类型ꎬ有 ７３０ 个ꎬ频率为 １３.９０％ꎻ三核 １０３ 个ꎬ频 率 为１.９６％ꎻ五 核 苷 酸 重 复 基 元 有 ９９
苷酸重复基元有 ６０ 种ꎬ主要以 ＡＡＧ / ＣＴＴ 为优势 种ꎬ以 ＡＡＡＡＴ / ＡＴＴＴＴ 为 主 要 类 型ꎬ 共 有 ５３ 个ꎬ
类型ꎬ共 ５５６ 个ꎬ 频 率 为 １０. ５９％ꎬ 其 次 是 ＡＡＴ / 频率为 １.０１％ꎻ此外ꎬ六核苷酸重复基元 １４８ 种、
ＡＴＴ 类型ꎬ有 ２７７ 个ꎬ频率为 ５.２８％ꎻ四核苷酸重 复合型重复基元 ４０４ 种、位置重叠的复合型重复

复基元 有 ９５ 种ꎬ ＡＡＡＴ / ＡＴＴＴ 类 型 最 多ꎬ 有 ３１２ 基元 １８ 种ꎬ但出现频率都很低ꎬ均在 ０. ５％ 以下
个ꎬ频率为 ５.９４％ꎬ其次是 ＡＡＡＧ / ＣＴＴＴ 类型ꎬ有 ( 图 ２) ꎮ

表 ５ 南酸枣转录组 ＳＳＲ 各重复类型的分布特征
Ｔａｂｌｅ ５ Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ＳＳＲ ｒｅｐｅａｔ ｔｙｐｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｏｆ Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ ａｘｉｌｌａｒｉｓ

比例 频率 总长度 平均长度 平均距离
ＳＳＲ 类型 数目
Ｐｒｏｐｏｒｔｉｏｎ Ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ Ｔｏｔａｌ ｌｅｎｇｔｈ Ａｖｅｒａｇｅ ｌｅｎｇｔｈ Ａｖｅｒａｇｅ ｄｉｓｔａｎｃｅ
ＳＳＲ ｔｙｐｅ Ｎｕｍｂｅｒ
(％) (％) (ｂｐ) (ｂｐ) (ｋｂ)
ｐ２ ２ ２５４ ４２.９３ ５.５９ ４１ ２４８.２０ １８.３０ ２３.４３
ｐ３ １ ６３１ ３１.０６ ４.０４ ２９ ４７２.１７ １８.０７ ３２.３８
ｐ４ ６０５ １１.５２ １.５０ １０ ５４５.１５ １７.４３ ８７.２８
ｐ５ １８５ ３.５２ ０.４６ ３ ９７５.６５ ２１.４９ ２８５.４４
ｐ６ １７２ ３.２８ ０.４３ ４ ４３４.１６ ２５.７８ ３０７.０１
ｃ ３８６ ７.３５ ０.９６ ２６ ６４５.５８ ６９.０３ １３６.８０
∗
ｃ １８ ０.３４ ０.０４ ８１３.９６ ４５.２２ ２ ９３３.６９
总计 Ｔｏｔａｌ ５ ２５１ １００ １３.０２ １１７ １３４.８７ ２２.３１ １０.０６
注: ｐ２. 二核苷酸ꎻ ｐ３. 三核苷酸ꎻ ｐ４. 四核苷酸ꎻ ｐ５. 五核苷酸ꎻ ｐ６. 六核苷酸ꎻ ｃ. 复合型核苷酸ꎻ ｃ . 位置有重叠的复合型核
∗
苷酸ꎮ
Ｎｏｔｅ: ｐ２. Ｄｉｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅꎻ ｐ３. Ｔｒｉｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅꎻ ｐ４. Ｔｅｔｒａｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅꎻ ｐ５. Ｐｅｎｔａｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅꎻ ｐ６. Ｈｅｘａｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅꎻ ｃ. Ｃｏｍｐｌｅｘ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓꎻ
∗
ｃ . Ｃｏｍｐｌｅｘ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ｏｆ ｐｏｓｉｔｉｏｎ ｏｖｅｒｌａｐ.

图 ２ 南酸枣转录组中不同重复基元下 ＳＳＲ 分布
Ｆｉｇ. ２ ＳＳＲ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｕｎｄｅｒ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｒｅｐｅａｔ ｍｏｔｉｆｓ ｉｎ ｔｈｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｏｆ Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ ａｘｉｌｌａｒｉｓ

２.５ 南酸枣转录组中 ＳＳＲ 重复次数 (７２７)ꎬ分别占总数的 ２１.８１％ 和 １５.００％ꎻ二核苷
去掉复合型位点ꎬ二核苷酸至六核苷酸的 ＳＳＲ 酸以 ６ 个串联重复为主ꎬ三核苷酸以 ５ 个串联重复
基元重复次数分布在 ４ 至 ２９ 之间ꎮ 其中ꎬ最常见 为主ꎬ四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸均以 ４ 个串
的是 ６ 个串联重复(１ １００)ꎬ占总数的 ２２.６９％ꎻ其 联重复为主(表 ６)ꎮ 随着重复次数的增加ꎬＳＳＲ 数
次是 ５ 个 串 联 重 复 ( １ ０５７ ) 和 ４ 个 串 联 重 复 量逐渐减少ꎮ