Page 28 - 《广西植物》2026年第9期
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1 4 6 4                                广  西  植  物                                         46 卷
                                          表 1  丽江云杉叶绿体基因组所包含基因
                                 Table 1  Genes contained in Picea likiangensis chloroplast genome
                基因功能分类        基因种类                                    基因名称
              Gene function category  Gene category                   Gene name
                  自我复制        核糖体 RNA                                 rrn16、rrn23、rrn4.5、rrn5
                Self ̄replication  Ribosomal RNAs
                              转运 RNA                                  trnA ̄UGC∗、trnC ̄GCA、 trnD ̄GUC、trnE ̄UUC、 trnF ̄GAA、
                                                                                                       a
                              Transfer RNAs                           trnfM ̄CAU、 trnG ̄GCC∗、 trnG ̄UCC、 trnH ̄GUG 、 trnI ̄
                                                                         a
                                                                      CAU 、trnI ̄GAU∗、 trnK ̄UUU∗、trnL ̄CAA、 trnL ̄UAA∗、
                                                                      trnL ̄UAG、 trnM ̄CAU、 trnN ̄GUU、 trnP ̄GGG、 trnP ̄UGG、
                                                                                                          a
                                                                      trnQ ̄UUG、 trnR ̄ACG、 trnR ̄CCG、 trnR ̄UCU、 trnS ̄GCU 、
                                                                      trnS ̄GGA、 trnS ̄UGA、 trnT ̄GGU、 trnT ̄UGU、 trnV ̄GAC、
                                                                      trnV ̄UAC∗、trnW ̄CCA、trnY ̄GUA
                              RNA 聚合酶                                 rpoA、rpoB、rpoC1∗、rpoC2
                              RNA polymerase
                              核糖体蛋白小亚基                                rps2、rps3、 rps4、 rps7、 rps8、 rps11、 rps12 ∗、 rps14、 rps15、
                              Small subunit of ribosomal protein      rps18、rps19

                              核糖体蛋白大亚基                                rpl14、 rpl16∗、 rpl2∗、 rpl20、 rpl22、 rpl23、 rpl32、
                              Large subunit of ribosomal protein      rpl33、rpl36
              光合作用相关基因        光系统Ⅰ                                    psaA、psaB、psaC、psaI、psaJ、psaM
             Genes for photosynthesis  PhotosystemⅠ
                                                                                                      a
                              光系统Ⅱ                                    psbA、 psbB、 psbC、 psbD、 psbE、 psbF、 psbH、 psbI 、 psbJ、
                              Photosystem Ⅱ                           psbK、psbL、psbM、psbN、psbT、psbZ
                              细胞色素复合物 b / f 亚基                        petA、petB∗、petD∗、petG、petL、petN
                              Subunits of cytochrome b / f complex
                              ATP 合成酶亚基                               atpA、atpB、atpE、atpF∗、atpH、atpI
                              Subunits of ATP synthase
                              叶绿素生物合成                                 chlB、chlL、chlN
                              Chlorophyll biosynthesis
                              二磷酸核酮糖羧化酶大亚基                            rbcL
                              Large subunit of RubisCO
                  其他基因        蛋白酶 Protease                            clpP
                 Other genes
                              成熟酶 Maturase                            matK
                              被膜蛋白 Envelope membrane protein          cemA
                              乙酰辅酶 A 羧化酶亚基                            accD
                              Subunit of acetyl ̄CoA ̄carboxylase
                              C 型细胞色素合成基因                             ccsA

                              C ̄type cytochrome synthesis gene
                              转录起始因子                                  infA
                              Translation initiation factor
                未知功能基因        保守的假定叶绿体开放阅读框                           ycf1、ycf12 、ycf2、ycf3∗∗、ycf4
                                                                             a
             Unknown function genes  Conserved hypothetical chloroplast open reading frame
              注: a 表示基因有 2 个拷贝ꎻ∗和∗∗分别表示基因包含 1 个和 2 个内含子ꎮ
              Note: a indicates the gene has two copiesꎻ ∗ and ∗∗ indicate genes containing one and two intronsꎬ respectively .

            基因进行系统发育重建ꎬ贝叶斯法和最大似然法                              云杉(P. asperata)、欧洲云杉(P. abies)3 个物种聚
            得到了一致的系统发育关系( 图 4)ꎬ巨云杉( P.                         在 一 起 形 成 了 单 系 群ꎬ 再 与 银 云 杉 ( P.
            sitchensis)位于云杉属的基部类群ꎬ剩余云杉属植                       engelmannii)和白云杉(P. glauca)组成的支聚在一
            物被分为两大分支ꎬ每个分支内部均包含 8 个物                            起ꎬ且得到了较高的支持度( 贝叶斯法和最大似然
            种ꎬ在第一分支内部ꎬ同属于云杉组的青海云杉、                             法的支持率分别为 1 和 100%) ꎮ 第二分支中ꎬ雪
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