Page 28 - 《广西植物》2026年第9期
P. 28
1 4 6 4 广 西 植 物 46 卷
表 1 丽江云杉叶绿体基因组所包含基因
Table 1 Genes contained in Picea likiangensis chloroplast genome
基因功能分类 基因种类 基因名称
Gene function category Gene category Gene name
自我复制 核糖体 RNA rrn16、rrn23、rrn4.5、rrn5
Self ̄replication Ribosomal RNAs
转运 RNA trnA ̄UGC∗、trnC ̄GCA、 trnD ̄GUC、trnE ̄UUC、 trnF ̄GAA、
a
Transfer RNAs trnfM ̄CAU、 trnG ̄GCC∗、 trnG ̄UCC、 trnH ̄GUG 、 trnI ̄
a
CAU 、trnI ̄GAU∗、 trnK ̄UUU∗、trnL ̄CAA、 trnL ̄UAA∗、
trnL ̄UAG、 trnM ̄CAU、 trnN ̄GUU、 trnP ̄GGG、 trnP ̄UGG、
a
trnQ ̄UUG、 trnR ̄ACG、 trnR ̄CCG、 trnR ̄UCU、 trnS ̄GCU 、
trnS ̄GGA、 trnS ̄UGA、 trnT ̄GGU、 trnT ̄UGU、 trnV ̄GAC、
trnV ̄UAC∗、trnW ̄CCA、trnY ̄GUA
RNA 聚合酶 rpoA、rpoB、rpoC1∗、rpoC2
RNA polymerase
核糖体蛋白小亚基 rps2、rps3、 rps4、 rps7、 rps8、 rps11、 rps12 ∗、 rps14、 rps15、
Small subunit of ribosomal protein rps18、rps19
核糖体蛋白大亚基 rpl14、 rpl16∗、 rpl2∗、 rpl20、 rpl22、 rpl23、 rpl32、
Large subunit of ribosomal protein rpl33、rpl36
光合作用相关基因 光系统Ⅰ psaA、psaB、psaC、psaI、psaJ、psaM
Genes for photosynthesis PhotosystemⅠ
a
光系统Ⅱ psbA、 psbB、 psbC、 psbD、 psbE、 psbF、 psbH、 psbI 、 psbJ、
Photosystem Ⅱ psbK、psbL、psbM、psbN、psbT、psbZ
细胞色素复合物 b / f 亚基 petA、petB∗、petD∗、petG、petL、petN
Subunits of cytochrome b / f complex
ATP 合成酶亚基 atpA、atpB、atpE、atpF∗、atpH、atpI
Subunits of ATP synthase
叶绿素生物合成 chlB、chlL、chlN
Chlorophyll biosynthesis
二磷酸核酮糖羧化酶大亚基 rbcL
Large subunit of RubisCO
其他基因 蛋白酶 Protease clpP
Other genes
成熟酶 Maturase matK
被膜蛋白 Envelope membrane protein cemA
乙酰辅酶 A 羧化酶亚基 accD
Subunit of acetyl ̄CoA ̄carboxylase
C 型细胞色素合成基因 ccsA
C ̄type cytochrome synthesis gene
转录起始因子 infA
Translation initiation factor
未知功能基因 保守的假定叶绿体开放阅读框 ycf1、ycf12 、ycf2、ycf3∗∗、ycf4
a
Unknown function genes Conserved hypothetical chloroplast open reading frame
注: a 表示基因有 2 个拷贝ꎻ∗和∗∗分别表示基因包含 1 个和 2 个内含子ꎮ
Note: a indicates the gene has two copiesꎻ ∗ and ∗∗ indicate genes containing one and two intronsꎬ respectively .
基因进行系统发育重建ꎬ贝叶斯法和最大似然法 云杉(P. asperata)、欧洲云杉(P. abies)3 个物种聚
得到了一致的系统发育关系( 图 4)ꎬ巨云杉( P. 在 一 起 形 成 了 单 系 群ꎬ 再 与 银 云 杉 ( P.
sitchensis)位于云杉属的基部类群ꎬ剩余云杉属植 engelmannii)和白云杉(P. glauca)组成的支聚在一
物被分为两大分支ꎬ每个分支内部均包含 8 个物 起ꎬ且得到了较高的支持度( 贝叶斯法和最大似然
种ꎬ在第一分支内部ꎬ同属于云杉组的青海云杉、 法的支持率分别为 1 和 100%) ꎮ 第二分支中ꎬ雪

