Page 32 - 《广西植物》2026年第9期
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１ ４ ６ ８ 广 西 植 物 ４６ 卷
有 ３０ 个ꎬ其中 ２９ 个均以 Ｕ / Ａ 结尾ꎮ 有研究显示ꎬ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｊｏｕｒｎａｌꎬ １９(３): ４３０－４４７.
玄参科(Ｓｃｒｏｐｈｕｌａｒｉａｃｅａｅ)( 李斌等ꎬ２０２５)、霸王属 Ｄａｎｉｅｌｌ Ｈꎬ Ｌｉｎ Ｃ Ｓꎬ Ｙｕ Ｍꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６. Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ:
ｄｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ａｎｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ
( Ｚｙｇｏｐｈｙｌｌｕｍ ) ( 周 美 等ꎬ ２０２４ )、 绞 股 蓝 属
[Ｊ]. Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ １７(１): １３４.
( Ｇｙｎｏｓｔｅｍｍａ ) ( Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１ )、 铁 杉 属
Ｄｉｎｇ Ｓ Ｊꎬ Ｗｅｉ Ｊ Ｓꎬ Ｌｕ Ｙ Ｌꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ａｎｄ
(Ｔｓｕｇａ)(李佳等ꎬ２０２４)等植物的叶绿体基因组最 ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ ｏｆ Ｐｉｃｅａ ｂｒａｃｈｙｔｙｌａ ｖａｒ. ｃｏｍｐｌａｎａｔａ
优密码子大多也以 Ａ / Ｕ 结尾ꎬ推测可能与叶绿体 ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ [Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｃｅｎｔｒａｌ Ｓｏｕｔｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ
ｏｆ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ ＆ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬ ４３(４): １５６－１６３ꎬ １９０. [丁淑金ꎬ
基因组富含 Ａ / Ｔ 有关ꎮ
魏健生ꎬ 陆莹玲ꎬ 等ꎬ ２０２３. 油麦吊云杉叶绿体基因组特
４ 结论 征及密码子偏性分析 [Ｊ]. 中南林业科技大学学报ꎬ
４３(４): １５６－１６３ꎬ １９０.]
Ｄｏｂｒｏｇｏｊｓｋｉ Ｊꎬ Ａｄａｍｉｅｃ Ｍꎬ Ｌｕｃｉｎ 'ｓｋｉ Ｒꎬ ２０２０. Ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ
本研究测序的丽江云杉叶绿体基因组全长为 ｇｅｎｏｍｅ: Ａ ｒｅｖｉｅｗ [ Ｊ ]. Ａｃｔａ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｉａｅ Ｐｌａｎｔａｒｕｍꎬ
１２４ ２０７ ｂｐꎬ没有 ＩＲ 区ꎬ不是经典的四分体结构ꎮ ４２(６): ９８.
丽江云杉叶绿体基因组共含有 １１３ 个基因ꎬ其中 Ｄｒｏｕｉｎ Ｇꎬ Ｄａｏｕｄ Ｈꎬ Ｘｉａ Ｊ Ｎꎬ ２００８. Ｒｅｌａｔｉｖｅ ｒａｔｅｓ ｏｆ
ｓｙｎｏｎｙｍｏｕｓ ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌꎬ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ
７４ 个为蛋白编码基因ꎬ３５ 个为 ｔＲＮＡ 基因ꎬ４ 个为
ａｎｄ ｎｕｃｌｅａｒ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｓｅｅｄ ｐｌａｎｔｓ [ Ｊ ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
ｒＲＮＡ 基因ꎮ 该基因组偏向以 Ａ / Ｕ 碱基结尾ꎬ且 Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ４９(３): ８２７－８３１.
ＳＳＲ 最多的类型为单碱基 Ａ / Ｔ 重复ꎮ 系统发育基 Ｅｄｉｔｏｒｉａｌ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ ｏｆ Ｆｌｏｒａ ｏｆ Ｃｈｉｎａꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ
因组学结果显示ꎬ巨云杉位于云杉属基部ꎬ剩余云 Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ １９７８. Ｆｌｏｒａ Ｒｅｉｐｕｂｌｉｃａｅ Ｐｏｐｕｌａｒｉｓ Ｓｉｎｉｃａｅ
[Ｍ]. Ｂｅｉｊｉｎｇ: Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｒｅｓｓ: １５１. [中国科学院中国植物
杉属植物被分为两大类群ꎬ与丽江云杉亲缘关系
志编辑委员会ꎬ １９７８. 中国植物志 [Ｍ]. 北京: 科学出版
最近的是麦吊云杉ꎮ
社: １５１.]
Ｆｅｎｇ Ｓꎬ Ｒｕ Ｄ Ｆꎬ Ｓｕｎ Ｙ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９. Ｔｒａｎｓ￣ｌｉｎｅａｇｅ
ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ａｎｄ ｎｏｎｂｉｆｕｒｃａｔｉｎｇ ｄｉｖｅｒｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｇｅｎｕｓ
参考文献: Ｐｉｃｅａ [Ｊ]. Ｔｈｅ Ｎｅｗ Ｐｈｙｔｏｌｏｇｉｓｔꎬ ２２２(１): ５７６－５８７.
Ｇａｇａｌｏｖａ Ｋ Ｋꎬ Ｗａｒｒｅｎ Ｒ Ｌꎬ Ｃｏｏｍｂｅ Ｌꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ｓｐｒｕｃｅ
Ｂｅｉｅｒ Ｓꎬ Ｔｈｉｅｌ Ｔꎬ Ｍüｎｃｈ Ｔꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. ＭＩＳＡ￣ｗｅｂ: ａ ｗｅｂ
ｇｉｇａ￣ｇｅｎｏｍｅｓ: ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌｌｙ ｓｉｍｉｌａｒ ｙｅｔ ｄｉｓｔｉｎｃｔｉｖｅ ｗｉｔｈ
ｓｅｒｖｅｒ ｆｏｒ ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ [ Ｊ ]. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ ｅｘｐａｎｄｉｎｇ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｉｅｓ ａｎｄ ｒａｐｉｄｌｙ ｅｖｏｌｖｉｎｇ
３３(１６): ２５８３－２５８５.
ｇｅｎｅｓ [Ｊ]. Ｔｈｅ Ｐｌａｎｔ Ｊｏｕｒｎａｌꎬ １１１(５): １４６９－１４８５.
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Ｇｒｅｉｎｅｒ Ｓꎬ Ｌｅｈｗａｒｋ Ｐꎬ Ｂｏｃｋ Ｒꎬ ２０１９. ＯｒｇａｎｅｌｌａｒＧｅｎｏｍｅＤＲＡＷ
ＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ [ Ｊ ]. Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ ２７(２): (ＯＧＤＲＡＷ) ｖｅｒｓｉｏｎ １.３.１: ｅｘｐａｎｄｅｄ ｔｏｏｌｋｉｔ ｆｏｒ ｔｈｅ ｇｒａｐｈｉｃａｌ
５７３－５８０. ｖｉｓｕａｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｏｒｇａｎｅｌｌａｒ ｇｅｎｏｍｅｓ [ Ｊ ]. Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ
Ｂｏｌｇｅｒ Ａ Ｍꎬ Ｌｏｈｓ Ｍꎬ Ｕｓａｄｅｌ Ｂꎬ ２０１４. Ｔｒｉｍｍｏｍａｔｉｃ: ａ ｆｌｅｘｉｂｌｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ ４７(Ｗ１): Ｗ５９－Ｗ６４.
ｔｒｉｍｍｅｒ ｆｏｒ ｉｌｌｕｍｉｎａ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａ [ Ｊ]. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ Ｈｕ Ｈꎬ Ｗａｎｇ Ｊ Ｈꎬ Ｙａｎ Ｆꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５. Ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ｓｕｐｅｒｉｏｒ
３０(１５): ２１１４－２１２０. ｅｘｃｅｌｌｅｎｔ ｆａｍｉｌｉｅｓ ｏｆ Ｐｉｃｅａ ｌｉｋｉａｎｇｅｎｓｉｓ [Ｊ]. Ｈｕｎａｎ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ
Ｂｏｕｉｌｌé Ｍꎬ Ｓｅｎｎｅｖｉｌｌｅ Ｓꎬ Ｂｏｕｓｑｕｅｔ Ｊꎬ ２０１１. Ｄｉｓｃｏｒｄａｎｔ ｍｔＤＮＡ Ｓｃｉｅｎｃｅ ＆ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬ ４２(４): １６－１９. [胡华ꎬ 王军辉ꎬ 颜
ａｎｄ ｃｐＤＮＡ ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｅｓ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃ ｓｐｅｃｉａｔｉｏｎ ａｎｄ 芳ꎬ 等ꎬ ２０１５. 丽江云杉优良家系选择 [Ｊ]. 湖南林业科
ｒｅｔｉｃｕｌａｔｉｏｎ ａｓ ｄｒｉｖｉｎｇ ｆａｃｔｏｒｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｄｉｖｅｒｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｇｅｎｕｓ 技ꎬ ４２(４): １６－１９.]
Ｐｉｃｅａ [Ｊ]. Ｔｒｅｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ＆ Ｇｅｎｏｍｅｓꎬ ７(３): ４６９－４８４. Ｊａｎｓｅｎ Ｒ Ｋꎬ Ｒｕｈｌｍａｎ Ｔ Ａꎬ ２０１２. Ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｓｅｅｄ
Ｃｈｏｉ Ｉ Ｓꎬ Ｊａｎｓｅｎ Ｒꎬ Ｒｕｈｌｍａｎ Ｔꎬ ２０１９. Ｌｏｓｔ ａｎｄ ｆｏｕｎｄ: Ｒｅｔｕｒｎ ｐｌａｎｔｓ [ Ｍ] / / Ｂｏｃｋ Ｒꎬ Ｋｎｏｏｐ Ｖ. Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔｓ
ｏｆ ｔｈｅ ｉｎｖｅｒｔｅｄ ｒｅｐｅａｔ ｉｎ ｔｈｅ ｌｅｇｕｍｅ ｃｌａｄｅ ｄｅｆｉｎｅｄ ｂｙ ｉｔｓ ａｎｄ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａ. Ｄｏｒｄｒｅｃｈｔ: Ｓｐｒｉｎｇｅｒ: １０３－１２６.
ａｂｓｅｎｃｅ [ Ｊ ]. Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ １１(４): Ｊｉｎ Ｊ Ｊꎬ Ｙｕ Ｗ Ｂꎬ Ｙａｎｇ Ｊ Ｂꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０. ＧｅｔＯｒｇａｎｅｌｌｅ: ａ ｆａｓｔ
１３２１－１３３３. ａｎｄ ｖｅｒｓａｔｉｌｅ ｔｏｏｌｋｉｔ ｆｏｒ ａｃｃｕｒａｔｅ ｄｅ ｎｏｖｏ ａｓｓｅｍｂｌｙ ｏｆ ｏｒｇａｎｅｌｌｅ
Ｃｏｉｒｏ Ｍꎬ Ｒｏｂｅｒｔ Ｅ Ａꎬ Ｈｏｆｍａｎｎ Ｃ Ｃꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ｃｕｔｔｉｎｇ ｔｈｅ ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ ２１(１): ２４１.
ｌｏｎｇ ｂｒａｎｃｈｅｓ: Ｃｏｎｓｉｌｉｅｎｃｅ ａｓ ａ ｐａｔｈ ｔｏ ｕｎｅａｒｔｈ ｔｈｅ Ｋａｔｏｈ Ｋꎬ Ｓｔａｎｄｌｅｙ Ｄ Ｍꎬ ２０１３. ＭＡＦＦＴ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ
ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｈｉｓｔｏｒｙ ｏｆ Ｇｎｅｔａｌｅｓ [Ｊ]. Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ ｉｎ Ｅｃｏｌｏｇｙ ａｎｄ ａｌｉｇｎｍｅｎｔ ｓｏｆｔｗａｒｅ ｖｅｒｓｉｏｎ ７: Ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔｓ ｉｎ ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ
Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ １０: １０８２６３９. ａｎｄ ｕｓａｂｉｌｉｔｙ [Ｊ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ３０(４):
Ｄａｎｉｅｌｌ Ｈꎬ Ｊｉｎ Ｓ Ｘꎬ Ｚｈｕ Ｘ Ｇꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｇｒｅｅｎ ｇｉａｎｔ — ａ ７７２－７８０.
ｔｉｎｙ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｗｉｔｈ ｍｉｇｈｔｙ ｐｏｗｅｒ ｔｏ ｐｒｏｄｕｃｅ ｈｉｇｈ￣ Ｋｅａｒｓｅ Ｍꎬ Ｍｏｉｒ Ｒꎬ Ｗｉｌｓｏｎ Ａꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２. Ｇｅｎｅｉｏｕｓ Ｂａｓｉｃ: ａｎ
ｖａｌｕｅ ｐｒｏｔｅｉｎｓ: ｈｉｓｔｏｒｙ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ [ Ｊ ]. Ｐｌａｎｔ ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ ａｎｄ ｅｘｔｅｎｄａｂｌｅ ｄｅｓｋｔｏｐ ｓｏｆｔｗａｒｅ ｐｌａｔｆｏｒｍ ｆｏｒ ｔｈｅ
