Page 107 - 《广西植物》2020年第7期
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７ 期 刘换换等: 北美鹅掌楸 ＣＰＰ 转录因子家族 ＬｔＴＣＸ２ 基因的克隆与分析 １ ０ ０ ３
图 ３ 北美鹅掌楸 ＬｔＴＣＸ２ 蛋白的结构域预测
Ｆｉｇ. ３ Ｄｏｍａｉｎ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｏｆ ＬｔＴＣＸ２ ｐｒｏｔｅｉｎ
子量为 ８８ ６９９.２５ Ｄａꎬ由 ８０７ 个氨基酸残基组成ꎬ ＴＣＸ２ 蛋白仅在第 ３９ ~ ５８ ａａ 处具有一个跨膜螺
理论等电点为 ５.８３ꎬ带正电荷( Ａｒｇ ＋ Ｌｙｓ) 的氨基 旋ꎬＴＭＨＭＭ 结果进一步表明 ＬｔＴＣＸ２ 为非跨膜蛋
酸残基数为 １００ 个ꎬ带负电荷( Ａｓｐ ＋ Ｇｌｕ) 的氨基 白(图 ４:ＢꎬＣ)ꎮ
酸残基数为 １１５ 个ꎮ 蛋白质分子氨基酸组成中丝 ２.３.２ 蛋白二级结构、三级结构预测 通过 ＳＯＰＭＡ
氨酸(Ｓｅｒ)含量最高ꎬ共 ９６ 个ꎬ占 １１.９％ꎬ其次为谷 在线预测分析蛋白的二级结构ꎮ ＬｔＴＣＸ２ 蛋白具有
氨酸(Ｇｌｕꎬ６５ 个ꎬ８.１％)ꎬ色氨酸( Ｔｒｐꎬ１ 个ꎬ０.１％) ４ 种二级结构ꎬ无规则卷曲(Ｃｃ) 占 ７０.６３％ꎬα 螺旋
含量最低ꎮ 该蛋白在哺乳动物体外网织红细胞中 (Ｈｈ)占 ２０.３２％ꎬ延伸链( Ｅｅ) 占 ６.９４％ꎬβ 转角占
的半衰期为 ３０ ｈꎬ在酵母中半衰期大于 ２０ ｈꎬ在大 ２.１１％(图 ５:Ａ)ꎮ 通过 ＳＷＩＳＳ￣ＭＯＤＥＬ 网站使用同
肠杆菌中半衰期大于 １０ ｈꎮ 不稳定系数为 ６２.３８ꎬ 源建模法在线预测蛋白质的三级结构(图 ５:Ｂ)ꎮ
脂溶性指数为 ６５.３７ꎬ疏水性平均值为－０.６１９ꎮ 通 ２.３.３ 信号肽预测与亚细胞定位 通过 ＳｉｇｎａｌＰ￣４.０
过 ＰｒｏｔＳｃａｌｅ 在线软件进行蛋白疏水性分析ꎬ横坐 Ｓｅｒｖｅｒ 在 线 软 件 预 测 蛋 白 的 信 号 肽ꎬ 结 果 表 明ꎬ
标为蛋白质氨基酸残基ꎬ纵坐标为该位点氨基酸 ＬｔＴＣＸ２ 蛋白不含信号肽及切割位点(图 ６)ꎮ 蛋白
残基疏水性值ꎬ正值表示疏水性氨基酸ꎬ负值表示 亚细胞定位通过两种不同方法预测ꎬ即 ＴａｒｇｅｔＰ１.１
亲水性氨基酸ꎮ ＬｔＴＣＸ２ 蛋白含有疏水区域和亲水 Ｓｅｒｖｅｒ 和 ＷｏＬＦ ＰＳＯＲＴ 在线软件ꎬ结合两个结果ꎬ预
区域ꎬ 疏 水 性 平 均 值 为 － ０. ６１９ꎬ 为 亲 水 性 蛋 测该 蛋 白 主 要 定 位 于 细 胞 核ꎬ 应 为 核 蛋 白 ( 表
白(图 ４:Ａ)ꎮ ２ꎬ表 ３)ꎮ
通过 ＥｘＰＡＳｙ ＴＭｐｒｅｄ 和 ＴＭＨＭＭ 在线软件预 ２.３.４ 氨基酸同源性分析 将 ＬｔＴＣＸ２ 氨基酸序列
放入 ＮＣＢＩ 中 ＢＬＡＳＴ 比对分析发现ꎬ ＬｔＴＣＸ２ 氨基
测分析蛋白跨膜区、扩膜方向ꎮ ＴＭｐｒｅｄ 表明ꎬＬｔ￣
