Page 108 - 《广西植物》2020年第7期
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A. 蛋白疏水性预测ꎻ Bꎬ C. 蛋白跨膜区预测ꎮ
A. Hydrophobicity predictionꎻ BꎬC. Transmembrane regions prediction.
图 4 LtTCX2 蛋白疏水性和跨膜区的预测分析
Fig. 4 Hydrophobicity and transmembrane region prediction of LtTCX2 protein
酸与其他物种的 CPP ̄like 家族蛋白具有较高的同 021828183. 1 )、 土 瓶 草 ( Cephalotus follicularisꎬ
源性ꎬ 大 多 具 有 保 守 的 CRC 结 构 域ꎮ 选 择 与 GAV57585.1)、桃(Prunus persicaꎬXP _020410865.1)、
LtTCX2 同源性较高的 15 个蛋白序列ꎬ通过 DNA ̄ 胡 桃 ( Juglans regiaꎬ XP _ 018839385. 1 )、 毛 果 杨
MAN 软件ꎬ进行氨基酸同源性比对分析ꎮ 15 个蛋 (Populus trichocarpaꎬXP_024462660.1)、胡杨(P. euph ̄
白分别为沉水樟(Cinnamomum micranthum f. kane ̄ ratica)、银白杨(P. albaꎬTKR83702.1)、海枣(Phoenix
hiraeꎬRWR88930.1)、 亚洲莲(Nelumbo nuciferaꎬXP_ dactyliferaꎬXP_008789994.1)ꎮ 结果表明 16 个蛋白
010259114.1ꎬXP _010256140.1)、葡萄(Vitis viniferaꎬ 序列同源性达 66.28%ꎬCPP ̄like 家族蛋白具有较
XP_010649949.1ꎬXP_010649950.1)、可可(Theobroma 高的保守性ꎬ尤其是 N 端、C 端(图 7)ꎮ
cacaoꎬXP _007034831.2)、博落回(Macleaya cordataꎬ 2.3.5 系统发育进化分析 在 NCBI 上搜索已经发
OVA15531. 1)、 欧 洲 甜 樱 桃 ( Prunus aviumꎬ XP _ 表的 CPP ̄like 家族的蛋白序列ꎬ除了氨基酸同源