Page 109 - 《广西植物》2020年第7期
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7 期              刘换换等: 北美鹅掌楸 CPP 转录因子家族 LtTCX2 基因的克隆与分析                                   1 0 0 5





























    A. 二级结构ꎻ B. 三级结构ꎮ
    A. Tertiary structureꎻ B. Secondary structure.
                                   图 5  LtTCX2 蛋白二级、三级结构预测
                        Fig. 5  Secondary and tertiary structure predictions of LtTCX2 protein


  表 2  通过 TargetP1.1 预测 LtTCX2 蛋白亚细胞定位               性 分 析 的 15 个 蛋 白ꎬ 还 包 括 胡 杨 ( XP _
       Table 2  Subcellular localization prediction of
                                                     011026909.1ꎻXP _011039720.1ꎻXP _011019786.1)、
           LtTCX2 protein by TargetP1.1 Server
                                                     银白杨(TKR83702.1)、拟南芥( NP_001328549.1ꎻ
                                         可信度         NP_001328548.1ꎻNP_193213.5ꎻAEE83496.1ꎻNP_
        蛋白名称            亚细胞结构
                                        Credibility
       Protein name   Subcellular structure          566717.1)、月季(Rosa chinensisꎬXP_024179390.1)、白
                                         (%)
                                                     梨(Pyrus bretschneideriꎬXP_009345300.1)、绒毛状
         LtTCX2         叶绿体膜 cTP          56.9
                                                     烟草(Nicotiana tomentosiformisꎬXP_009591884.1)、
                        线粒体膜 mTP          2.8
                                                     芜菁 ( Brassica rapaꎬ XP _ 009135825. 1 )、 野 草 莓
                      分泌通路信号肽 SP          0.6
                                                     (Fragaria vesca subsp. vescaꎬXP_011459206.1)ꎬ共
                         其他 Other         71.6
                                                     27 个具有 Tesmin / TSO1 ̄like CXC 2 结构域的蛋白

                          表 3  通过 WoLF PSORT 预测 LtTCX2 蛋白亚细胞定位

                   Table 3  Subcellular localization prediction of LtTCX2 protein by WoLF PSORT
                                                                                             内质网
        蛋白名称             细胞核           叶绿体          高尔基体          线粒体基质           液泡
                                                                                           Endoplasmic
       Protein name      Nuclear      Chloroplast  Golgi apparatus  Mitochonodrial matrix  Vacuole
                                                                                            reticulum
         LtTCX2           14             -             -             -             -           -


   序列进行进化树构建( 图 8)ꎮ 通过 MEGA7 软件                      2.4 北美鹅掌楸 LtTCX2 基因的组织特异性表达分析

   采用邻接法( Neighbor ̄joiningꎬNJ) 法ꎬ设置参数自                   将北美鹅掌楸花芽、根、叶、茎、萼片、花瓣、雄
   展值(Bootstrap 值) 为1 000次进行进化分析ꎬ结果                  蕊、雌蕊共 8 个组织的总 RNA 参照说明书进行反
   显示ꎬ北美鹅掌楸与莲、胡杨的 TCX2 蛋白明显聚                         转录以获得 cDNAꎬ以鹅掌楸的 LcActin97 为内参
   成一个分支ꎬ说明三者进化关系较近ꎮ                                 基因ꎬ采用相对定量的方法进行 RT ̄qPCRꎮ 检测
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