Page 76 - 《广西植物》2020年第9期
P. 76
９ 期 涂冬萍等: 牛大力淀粉酶基因家族的生物信息学分析 １ ２ ９ １
表 １ 牛大力淀粉酶理化特征
Ｔａｂｌｅ １ Ｐｈｙｓｉｃｏｃｈｅｍｉｃａｌ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ａｍｙｌａｓｅ ｏｆ Ｍｉｌｌｅｔｔｉａ ｓｐｅｃｉｏｓａ
理化性质 Ｐｈｙｓｉｃｏｃｈｅｍｉｃａｌ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ
名称
Ｎａｍｅ 分子量 等电点 稳定系数 总平均亲水性 脂肪系数
Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｗｅｉｇｈｔ Ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｏｆ Ｔｏｔａｌ ａｖｅｒａｇｅ
Ｉｓｏｅｌｅｃｔｒｉｃ ｐｏｉｎｔ Ｆａｔ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ
(ｋＤａ) ｉｎｓｔａｂｉｌｉｔｙ ｈｙｄｒｏｐｈｉｌｉｃｉｔｙ
ＭｓＡｍ１ ４５.８６ ５.０７ ３７.１３ ０.６７３ ２７.６０
ＭｓＡｍ２ ２５４.１２ ４.８０ ４６.２４ ０.８５２ ３０.６９
ＭｓＡｍ３ １３６.７４ ４.９９ ４４.１２ ０.７３１ ２９.０８
ＭｓＡｍ４ ２７１.４７ ４.８７ ４１.６０ ０.６４３ ２７.５６
ＭｓＡｍ５ １２３.３１ ５.０３ ４６.０２ ０.８２１ ３５.５１
ＭｓＡｍ６ ４６.６８ ５.２０ ４７.１０ ０.６６７ ２７.５４
ＭｓＡｍ７ ７８.８２ ５.１１ ４８.３４ ０.６８９ ２９.６０
ＭｓＡｍ８ １３０.２３ ５.０４ ３９.７４ ０.８４８ ３９.６２
ＭｓＡｍ９ ２２９.４７ ４.９０ ４３.８９ ０.６３２ ２６.４８
ＭｓＡｍ１０ ３１９.４５ ４.８３ ４５.５８ ０.７２２ ３０.７０
ＭｓＡｍ１１ ２６４.９７ ４.８６ ４０.０４ ０.８１７ ３３.０１
ＭｓＡｍ１２ ３４９.３９ ４.７７ ４６.７６ ０.８３５ ３３.７８
ＭｓＡｍ１３ ２７２.６１ ４.８０ ４１.８６ ０.７７７ ２８.４９
ＭｓＡｍ１４ １３３.４８ ４.９８ ４７.８３ ０.７９５ ２９.６９
ＭｓＡｍ１５ ３４３.９１ ５.３１ ２７.９４ ０.５４７ ２９.２５
ＭｓＡｍ１６ １５２.７３ ５.００ ３８.６３ ０.６３０ ２８.７４
ＭｓＡｍ１７ ３５５.３１ ４.７５ ４６.６６ ０.８２７ ３１.６５
ＭｓＡｍ１８ ２７０.３０ ４.８８ ３９.７１ ０.６５６ ２９.８４
ＭｓＡｍ１９ １４５.１３ ４.９７ ４６.４０ ０.７６６ ２８.９９
ＭｓＡｍ２０ ２５３.２９ ４.８３ ４３.９６ ０.８２２ ２８.１５
ＭｓＡｍ２１ １９６.５６ ４.９２ ３５.９８ ０.６６９ ２６.９０
ＭｓＡｍ２２ １２９.２８ ４.９５ ４１.７７ ０.７６５ ３３.２１
ＭｓＡｍ２３ ６１.９１ ５.０５ ４０.８６ ０.６７２ ３０.１６
ＭｓＡｍ２４ ２０１.０４ ４.９１ ４４.９３ ０.６８３ ２６.６７
ＭｓＡｍ２５ １５２.７５ ４.９５ ３６.５１ ０.５６２ ２８.８１
ＭｓＡｍ２６ １７２.７２ ４.９６ ４１.５７ ０.６５０ ２７.５９
ＭｓＡｍ２７ １６９.６７ ４.９３ ３９.４０ ０.８２４ ３０.２０
ＭｓＡｍ２８ ２０.７８ ５.３２ ３６.９４ ０.７８１ ３１.２５
其余为不稳定蛋白ꎻ总平均亲水性及脂肪指数显 ｂｏｘꎻ除了 ＭｓＡｍ１ 外ꎬ均含有 ＳＴＲＥ ꎮ 其次含量丰
示该家族蛋白均属于亲水性蛋白ꎮ 富的是 ＭＹＢꎬ除 ＭｓＡｍ８ 和 ＭｓＡｍ２８ 均含有ꎬ接下
２.１. ２ 牛 大 力 淀 粉 酶 基 因 序 列 预 测 使 用 来依 次 为 ＭＹＣꎬ ＡＲＥꎬ ＭＢＳꎬ ａｓ￣１ꎬ ＭＹＢ￣ｌｉｋｅ ｓｅ￣
ＰｌａｎｔＣＡＲＥ 对基因的顺式调控元件、增强子和抑制 ｑｕｅｎｃｅꎬ Ｕｎｎａｍｅｄ＿＿１ꎬ ＴＧＡＣＧ￣ｍｏｔｉｆ 等ꎮ
子等进行分析发现ꎬ该淀粉酶基因家族共有 ８６ 个 ２.２ 牛大力淀粉酶基因家族成员的二级结构预测
作用 元 件 ( 图 ３)ꎬ ＭｓＡｍ９ 的 作 用 元 件 最 多 ( ４２ ２.２.１ 牛大力淀粉酶的结构域预测 结构域分析
个)ꎬ其次是 ＭｓＡｍ１０(４１ 个)ꎬＭｓＡｍ２８ 的作用元 发现ꎬ牛大力淀粉酶基因家族共有 １１ 个结构域ꎬ
件最少(７ 个)ꎮ ２８ 个淀粉酶中 均含有 Ｕｎｎａｍｅｄ＿＿ 如图 ４ 所示ꎬ包括 ＰＬＮ０２７８４ ｓｕｐｅｒ ｆａｍｉｌｙ、ＡｍｙＡｃ￣
４ 作用元件ꎬ其次除了 ＭｓＡｍ１１ 外ꎬ均含有 ＣＡＡＴ￣ ｆａｍｉｌｙ ｓｕｐｅｒ ｆａｍｉｌｙ、 Ｅ￣ｓｅｔ￣ＧＤＥ￣Ｉｓｏａｍｙｌａｓｅ￣Ｎ、 ＰＵＡ
