Page 78 - 《广西植物》2020年第9期
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９ 期 涂冬萍等: 牛大力淀粉酶基因家族的生物信息学分析 １ ２ ９ ３
图 ３ 牛大力淀粉酶基因顺式调控元件、增强子和抑制子预测图
Ｆｉｇ. ３ Ｃｉｓ￣ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ ｅｌｅｍｅｎｔｓꎬ ｅｎｈａｎｃｅｒｓ ａｎｄ ｓｕｐｐｒｅｓｓｏｒｓ ｏｆ ａｍｙｌａｓｅ ｏｆ Ｍｉｌｌｅｔｔｉａ ｓｐｅｃｉｏｓａ
(３８.１５％ ~ ５８.００％)ꎬＭｓＡｍ５ 中无 α 螺旋ꎬ最小的 肽段ꎬ其余均无信号肽ꎮ 亚细胞定位结果显示这些
是 ＭｓＡｍ６(８.１６％)ꎻβ 折叠比例最高的是 ＭｓＡｍ２３ 淀 粉 酶 均 定 位 在 细 胞 壁 外ꎬ ＭｓＡｍ３、 ＭｓＡｍ９、
(１２.２５％)ꎬ最小的是 ＭｓＡｍ２(４.３４％)ꎻ延长链比 ＭｓＡｍ１１、 ＭｓＡｍ１２、 ＭｓＡｍ１３、 ＭｓＡｍ２１、 ＭｓＡｍ２２、
例最 高 的 是 ＭｓＡｍ５ ( ４０. ００％)ꎬ 其 次 是 ＭｓＡｍ８、 ＭｓＡｍ２３、ＭｓＡｍ２７ 均较大程度定位于叶绿体中ꎮ
ＭｓＡｍ６、ＭｓＡｍ２３、ＭｓＡｍ２５(３４.１５％ ~ ３７.７８％)ꎬ最 ２.３.２ 牛大力淀粉酶的三级结构分析 用 ＳＷＩＳＳ￣
小的是 ＭｓＡｍ２２(１３.５８％)ꎮ ＭＯＤＥＬ 对牛大力淀粉酶家族进行了三级结构预
２.３ 牛大力淀粉酶基因家族成员的三级结构预测 测和可视化分析ꎬ结果如表 ２ 所示ꎮ 三级结构预
２.３.１ 信号肽预测及亚细胞定位 跨膜预测发现该 测 具 有 α￣淀 粉 酶 结 构 的 是 ＭｓＡｍ３、 ＭｓＡｍ１０、
基因家族均可跨膜于胞外ꎬ且信号肽预测结果显示 ＭｓＡｍ１１、ＭｓＡｍ１６、ＭｓＡｍ１８、ＭｓＡｍ１９、ＭｓＡｍ２７ꎻ具
(图 ６)ꎬＭｓＡｍ５、ＭｓＡｍ８ 和 ＭｓＡｍ１４ 可能存在信号 有 β 淀粉酶结构的是 ＭｓＡｍ２２ꎻ具有异淀粉酶结构
