Page 77 - 《广西植物》2020年第9期

１ ２ ９ ２ 广 西 植 物 ４０ 卷

表 ２ 牛大力淀粉酶三级结构建模特征
Ｔａｂｌｅ ２ Ｍｏｄｅｌｉｎｇ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｒｅｅ￣ｌｅｖｅｌ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ ａｍｙｌａｓｅ ｏｆ Ｍｉｌｌｅｔｔｉａ ｓｐｅｃｉｏｓａ

建模氨基酸数量及占比 序列同源性
淀粉酶名称 Ｍｏｄｅｌｉｎｇ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄｓ 建模 Ｓｅｑｕｅｎｃｅ 模型名称
Ａｍｙｌａｓｅ ｎａｍｅ ａｎｄ ｐｒｏｐｏｒｔｉｏｎｓ Ｍｏｄｅｌｉｎｇ ｈｏｍｏｌｏｇｙ Ｍｏｄｅｌ ｎａｍｅ
(％) (％)

ＭｓＡｍ１ １４４(９０) ｄ１ｍ５３ａ２ １００ βꎬα 桶ꎬ淀粉酶催化域 βꎬα￣Ｂａｒｒｅｌꎬ ａｍｙｌａｓｅ ｃａｔａｌｙｔｉｃ ｄｏｍａｉｎ
ＭｓＡｍ２ ６４５(７６) ｃ４ｊ７ｒＡ １００ 水解酶ꎬ异淀粉酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬ ｉｓｏａｍｙｌａｓｅ
ＭｓＡｍ３ ３９９(８８) ｃ２ｑｐｕＢ １００ 水解酶ꎬα￣淀粉酶同工酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬ α￣ａｍｙｌａｓｅ ｉｓｏｅｎｚｙｍｅ
ＭｓＡｍ４ １５２(７０) ｃ５ｗｗｒＡ １００ 转移酶ꎬ甲基转移酶 Ｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅꎬｍｅｔｈｙｌｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ
ＭｓＡｍ５ ３３(７３) ｃ ５ｇｋｅＢ ３５.７ 水解酶ꎬ内切酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬ ｅｎｄｏｎｕｃｌｅａｓｅ
ＭｓＡｍ６ １０(２０) ｃ４ｐｂｚＢ １９.９ 细胞周期ꎬ转移蛋白 Ｃｅｌｌ ｃｙｃｌｅꎬ ｔｒａｎｓｆｅｒ ｐｒｏｔｅｉｎ
ＭｓＡｍ９ １８(１８) ｃ２ｉ３ｓＦ １６.７ 细胞周期ꎬ蛋白激酶 Ｃｅｌｌ ｃｙｃｌｅꎬ ｐｒｏｔｅｉｎ ｋｉｎａｓｅ
ＭｓＡｍ１０ ３６０(４０) ｃ２ｑｐｕＢ １００ 水解酶ꎬα￣淀粉酶同工酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬα￣ａｍｙｌａｓｅ ｉｓｏｅｎｚｙｍｅ
ＭｓＡｍ１１ ２７９(９９) ｃ２ｑｐｕＢ １００ 水解酶ꎬα￣淀粉酶同工酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬα￣ａｍｙｌａｓｅ ｉｓｏｅｎｚｙｍｅ
ＭｓＡｍ１２ ６８(６９) ｄ２ａｚｅａ１ ４４.１ Ｅ２Ｆ￣ＤＰ 异二聚化区 Ｅ２Ｆ￣ＤＰ ｈｅｔｅｒｏｄｉｍｅｒｉｚａｔｉｏｎ ｚｏｎｅ
ＭｓＡｍ１３ ８１(１３) ｃ１ｇｃｙＡ ９９.５ 水解酶ꎬ葡聚糖麦芽四氢酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬ ｄｅｘｔｒａｎ ｍａｌｔｅｔｒａｈｙｄｒｏｌａｓｅ
ＭｓＡｍ１４ ６２(１２) ｃ２ｌａａＡ ９６.４ 水解酶ꎬα / β￣淀粉酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬα / β￣ａｍｙｌａｓｅ
ＭｓＡｍ１５ ７(１６) ｃ５ａｊ３ｋ ４２.３ 核聚糖 Ｎｕｃｌｅｏ
ＭｓＡｍ１６ １２６(７８) ｃ３ｂｃ９Ａ １００ 水解酶ꎬα￣淀粉酶催化域 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬα￣ａｍｙｌａｓｅ ｃａｔａｌｙｔｉｃ ｄｏｍａｉｎ
ＭｓＡｍ１７ ２７６(７５) ｃ３ａｍｌＡ １００ 转移酶 Ｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ
ＭｓＡｍ１８ １８２(９８) ｃ２ｑｐｕＢ １００ 水解酶ꎬα￣淀粉酶同工酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬα￣ａｍｙｌａｓｅ ｉｓｏｅｎｚｙｍｅ
ＭｓＡｍ１９ ６３(２３) ｃ２ｃ３ｗＢ ９６ α￣淀粉酶糖结合蛋白 α￣ａｍｙｌａｓｅ ｇｌｙｃｏｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ
ＭｓＡｍ２３ ６(１５) ｃ２ｌ４ｇＡ ７.８ 病毒蛋白 Ｖｉｒａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ
ＭｓＡｍ２４ １５２(７０) ｃ５ｗｗｒＡ １００ 转移酶ꎬ甲基转移酶 Ｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅꎬｍｅｔｈｙｌｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ
ＭｓＡｍ２５ ３８(４６) ｃ４ｔｚｏＣ １７.９ 肽结合蛋白 Ｐｅｐｔｉｄｅ ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ
ＭｓＡｍ２６ １５２(７０) ｃ５ｗｗｒＡ １００ 转移酶ꎬ甲基转移酶 Ｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅꎬｍｅｔｈｙｌｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ
ＭｓＡｍ２７ ２７０(９８) ｃ２ｑｐｕＢ １００ 水解酶ꎬα￣淀粉酶同工酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬα￣ａｍｙｌａｓｅ ｉｓｏｅｎｚｙｍｅ
ＭｓＡｍ７ １６(３２) ｃ６ｇｄｊＡ ３２ 结构蛋白 Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ
ＭｓＡｍ８ １４(３１) ｄ１ｍ１ｈａ１ ７.７ 插入域 Ｉｎｓｅｒｔ ｆｉｅｌｄ
ＭｓＡｍ２１ ４３４(６６) ｄ１ｆａ２ａ １００ꎬ βꎬα￣桶ꎬ淀粉酶催化域 βꎬα￣Ｂａｒｒｅｌꎬ ａｍｙｌａｓｅ ｃａｔａｌｙｔｉｃ ｄｏｍａｉｎ
ＭｓＡｍ２２ ２５７(９７) ｃ２ｘｆｙＡ １００ 水解酶ꎬβ￣淀粉酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬβ￣ａｍｙｌａｓｅ
ＭｓＡｍ２８ ３０(９７) ｄ１ｗｄｐａ１ ９７.９ βꎬα￣桶ꎬ淀粉酶催化域 βꎬα￣Ｂａｒｒｅｌꎬ ａｍｙｌａｓｅ ｃａｔａｌｙｔｉｃ ｄｏｍａｉｎ
ＭｓＡｍ２０ ７２６(９０) ｃ４ｊ７ｒＡ １００ 水解酶ꎬ异淀粉酶 Ｈｙｄｒｏｌａｓｅꎬ ｉｓｏａｍｙｌａｓｅ

ｓｕｐｅｒ ｆａｍｉｌｙ、 ＡｍｙＡｃ￣ｐｌａｎｔ￣ｌｓｏＡ、 ＧＨ￣Ｄ ｓｕｐｅｒ ｆａｍｉｌｙ 结果 发 现 ( 图 ５ )ꎬ 其 二 级 结 构 中 除 ＭｓＡｍ１、
等ꎮ 不同类型的淀粉酶的结构域有差别ꎮ 如含有 ＭｓＡｍ７、 ＭｓＡｍ８、 ＭｓＡｍ１５、 ＭｓＡｍ１６、 ＭｓＡｍ２２、
ＰＬＮ０２７８４ ｓｕｐｅｒ ｆａｍｉｌｙ 结构域的ꎬ预测显示为 α￣淀 ＭｓＡｍ２３、ＭｓＡｍ２８ α 螺旋占比最大( 占 ３８.４６％ ~

粉 酶ꎬ 如 ＭｓＡｍ５、 ＭｓＡｍ６、 ＭｓＡｍ１０、 ＭｓＡｍ１１、 ７５.８６％)外ꎬ其他淀粉酶中无规则卷曲的比例最
ＭｓＡｍ１２、 ＭｓＡｍ１３、 ＭｓＡｍ１４、 ＭｓＡｍ１５、 ＭｓＡｍ１６、 大ꎬ占 ３４.１５％ ~ ５５.５６％ꎬＭｓＡｍ２８ 中无规则卷曲的
ＭｓＡｍ１７、ＭｓＡｍ１８、ＭｓＡｍ１９、ＭｓＡｍ２３、ＭｓＡｍ２７ꎮ 比例最小(３.４５％)ꎬα 螺旋比例最高的是 ＭｓＡｍ２８
２.２. ２ 牛 大 力 淀 粉 酶 的 二 级 结 构 分 析 利 用 (７５. ８６％)ꎬ 其 次 为 ＭｓＡｍ７、 ＭｓＡｍ２２、 ＭｓＡｍ１５、
ＳＯＰＭＡ 对牛大力淀粉酶序列进行二级结构预测ꎬ ＭｓＡｍ８、 ＭｓＡｍ２３、 ＭｓＡｍ１９、 ＭｓＡｍ１、 ＭｓＡｍ１７